4 513525 La evolucin del citoesqueleto Wickstead and Gull 1
Publicado: 22 de agosto 2011. La evolucin del citoesqueleto Bill Wickstead 1,2 and Keith Gull 1
1Sir William Dunn School of Pathology, University of Oxford, Oxford OX1 3RE, England, UK 2Centre for Genetics and Genomics, University of Nottingham, Nottingham NG7 2UH, England, UK (Traduccin libre para uso interno: Csar Amanzo).
El citoesqueleto es un sistema de filamentos intracelulares esenciales para la forma de las clulas, la divisin y la funcin en los tres dominios de la vida (N.T.: dominio eucariota, dominio bacteria y dominio archea). Los citoesqueletos simples de procariotas muestran sorprendente plasticidad en su composicin, sin ninguna de las protenas formadoras de ncleos de filamentos conservados en todos los linajes. En contraste, la funcin del citoesqueleto eucariota se ha enormemente elaborado por la adicin de protenas accesorias y una amplia duplicacin y especializacin de genes. Gran parte de esta complejidad evolucion antes del ltimo ancestro comn de los eucariotas. La distribucin de los filamentos del citoesqueleto pone restricciones en la probable lnea procariota que realiz el salto de la eukaryogenesis. Introduccin La opinin de que el citoesqueleto era una caracterstica nica a eucariotas fue anulada drsticamente hace unos 20 aos por el descubrimiento de que las bacterias poseen homlogos tanto de tubulina (de Boer et al, 1992; Raychaudhuri y Park, 1992; Mukherjee et al, 1993) como de actina (Bork et al, 1992). Desde entonces, una combinacin de bioinformtica, datos estructurales y de imgenes avanzadas de clulas ha consolidado la idea de que tanto las bacterias y arqueas tienen citoesqueletos activos y dinmicos. Sin embargo, a medida como ha surgido ms informacin sobre la funcin de los filamentos procaritas y la distribucin de los componentes del citoesqueleto, se ha hecho evidente que no existe una relacin simple entre los citoesqueletos de las procariotas y eucariotas. Por otra parte, existe una considerable diversidad en la composicin y la funcin entre citoesqueletos en diferentes lneas de procariotas y eucariotas. Al igual que los microfilamentos eucariotas en base a actina y microtbulos eucariotas en base a tubulina, varios de los filamentos del citoesqueleto bacteriano son intrnsecamente "cytomotive" (Lwe y Amos, 2009); es decir, los propios filamentos pueden actuar como motores lineales impulsados por la cintica de polimerizacin / despolimerizacin. En eucariotas, esta actividad se ha incrementado enormemente por la evolucin de mltiples clases de motores, as como una coleccin de nucleadores, agentes de separacin, factores de unin de extremos, y (de) polimerasas. Otros filamentos del citoesqueleto parecen ser ms estructurales en funcin, proporcionando resistencia a la fuerza externa o actuando como un andamio. Tales filamentos pueden todava ser dinmicos en las clulas sin ser intrnsecamente cytomotive.
Abreviaturas utilizadas en este documento: ARP, protena relacionada con la actina; DHC, cadena pesada de dinena; ESCRT-III, complejo de clasificacin endosomal necesario para el transporte tipo III; SI, filamentos intermedios; LECA, ltimo antepasado comn de eucariotas; WACA, ATPasa de la andadera A del citoesqueleto. The Rockefeller University Press J. Cell Biol. Vol. 194 No. 4 513525 www.jcb.org/cgi/doi/10.1083/jcb.201102065 Los ms estudiados de estos son los filamentos intermedios de las clulas animales, pero una protena de la bacteria, la crescentina, tambin construye filamentos intermedios como las estructurales que funcionan en la determinacin de la forma celular. (N.T.: El citoesqueleto evolucion a partir de filamentos cytomotive procariotas). En esta revisin, se discuten las relaciones entre los principales componentes de los citoesqueletos bacterianos, arqueas y eucariotas. Nosotros comparamos la funcin de los filamentos en estos tres grupos y tambin interrogamos la distribucin de los componentes clave en todo el rbol de la vida. Finalmente, se analiza lo que se puede inferir con respecto a los orgenes de los componentes del citoesqueleto y discutir los medios por los que el citoesqueleto procariota simple podra haber evolucionado en el complejo sistema de protenas filamentos, protenas motores y protenas accesorias que es caracterstico de la clula eucariota.
Filamentos I: protenas relacionadas con la tubulina Los microtbulos eucariotas se construyen a partir de protofilamentos resultantes de la polimerizacin de heterodmeros de -tubulina y -tubulina. La mayora de Los microtbulos se componen de 13 protofilamentos que interactan lateralmente para formar un tubo hueco. Los heterodmeros aadidos al extremo ms de los microtbulos contienen GTP en las dos subunidades. La subsiguiente hidrlisis de GTP unido a la subunidad beta estimula un cambio conformacional en el heterodmero que es resistido por la geometra de los microtbulos, atrapando as la energa en la retcula (Howard y Hyman, 2003). Esta diferencia en la energa libre de y GTPpolmeros es la causa de la inestabilidad dinmica de los microtbulos- mediante el cual la presencia de GTP no hidrolizado en el extremo ms de Los microtbulos promueve la polimerizacin adicional, pero la prdida del capuchn induce una rpida despolimerizacin (Erickson y O'Brien , 1992; Howard y Hyman, 2009). La primera evidencia de un homlogo bacteriano de la tubulina vino con el hallazgo de que FtsZ, una protena esencial de la divisin celular de Escherichia coli, liga e hidroliza GTP y posee una secuencia de siete residuos conservado casi idntica a un motivo distintivo de tubulina N-terminal (de Boer et al, 1992; Raychaudhuri y Park, 1992; Mukherjee et al, 1993). Alineamientos subsecuentes mostraron que las similitudes entre las secuencias de FtsZ y se extendienden ms all del motivo distintivo de tubulinal (Mukherjee y Lutkenhaus, 1994). Sin embargo, la tubulina y FtsZ son muy divergentes en la secuencia principal, compartiendo identidad slo un 10% en comparacin con > 40% entre la mayora de las secuencias de FtsZ (Vaughan et al, 2004; Erickson, 2007). A pesar de la baja similitud de secuencias, la determinacin de las estructuras cristalinas de la tubulina y FtsZ revel protenas con pliegues casi idnticos (Fig. 1; Lwe y Amos, 1998; Nogales et al, 1998a, b). A diferencia de la tubulina, FtsZ no se ensambla en microtbulos, pero s forma una variedad de otras estructuras in vitro utilizando interacciones laterales entre J. Cell Biol. Vol. 194 No. 4 513525 La evolucin del citoesqueleto Wickstead and Gull 2 protofilamentos (Bramhill y Thompson, 1994; Mukherjee y Lutkenhaus, 1994; Erickson et al, 1996; Lwe y Amos, 1999, 2000). In vivo, FtsZ forma un dinmico "anillo Z" entre las futuras clulas hijas durante la citocinesis (Fig. 2 A). Este anillo acta como un andamio para la contratacin del "divisoma", que se contrae gradualmente hasta dividir la clula (Adams y Errington, 2009). Este sistema de citocinesis fue claramente un xito evolutivo porque FtsZ est a la vez ampliamente distribuida y altamente conservada. Su presencia en la mayora de los linajes de bacterias es indicativa de que es una protena antigua. Incluso se ha sugerido que una sobrerepresentacin de los aminocidos con simples rutas biosintticas en posiciones conservadas de FtsZ podra ser evidencia de que la protena precede a la auto-terminacin del cdigo estndar de 20 aminocidos. (Davis, 2002). FtsZ tambin est codificado por muchos genomas archaeal, pero no es ubicuo en procariotas. Lo ms notable es que FtsZ (y otros homlogos de tubulina) estn totalmente ausente de uno de los principales subtipos de arqueas, la Crenarchaeota (Margolin, 2000; Vaughan et al, 2004.). Con la posible excepcin de un gen altamente divergente semejante a FtsZ en solfataricus Sulfolobus probablemente adquiridos por transferencia horizontal de genes (Makarova et al., 2010). FtsZ tambin est ausente en al menos una euryarchaeon secuenciado (Picrophilus torridus; Fig. 3), as como los grupos de bacterias clamidias, Planctomycetes, y algunos Mycoplasmataceae (Vaughan et al, 2004; Adams y Errington, 2009). En el Crenarchaeota, la divisin independiente de FtsZ es posible gracias a una maquinaria de citocinesis alternativa proporcionada por ESCRT-III (complejo de clasificacin endosmica necesaria para el transporte, el tipo III; Linds et al, 2008; Samson et al, 2008.). Las protenas ESCRT-III se conservan entre arqueas y eucariotas, y las protenas eucariotas de esta forma polmeros dinmicos complejos que tienen un papel en los eventos de escisin de la membrana, incluyendo la abscisin celular (N.T.: abscisin, desprendimiento natural de partes de una planta, las hojas suelen morir y la fruta madurar) durante la citocinesis (Hurley y Hanson, 2010). En contraste con la falta de FtsZ en Crenarchaeota, el repertorio en Euryarchaeota ha sido duplicada para formar tres familias monofilticas (FtsZ1, 2, y 3), con FtsZ3 siendo el ms divergente y menos ampliamente distribuidos (Vaughan et al., 2004).
Figura 1. Homologa entre los filamentos del citoesqueleto procariotas y eucariotas. A pesar de los bajos niveles de similitud de secuencia, las protenas del citoesqueleto homlogas FtsZ / Tubz / tubulina (parte superior) y MreB / ParM / actina (parte inferior) tienen una considerable conservacin de plegado y tambin la interaccin longitudinal. ParM y actina forman filamentos helicoidales similares, pero con quiralidad opuesta (Orlova et al., 2007). Estructuras de subunidades de filamentos se derivan de la siguiente Protena nmeros de acceso del Banco de Datos: (. FtsZ; Oliva et al, 2004) (/-tubulina; Lwe et al, 2001) 1W5A, 1JFF, 1JCG (MreB; van den Ent et al., 2001), y 1YAG (actina; Vorobiev et al, 2003.).
FtsZ es el homlogo de tubulina ms frecuente en procariotas (Fig 3). Sin embargo, hay al menos otras cuatro familias de protenas-tubulina como en las bacterias, la mayora de ellos con una distribucin restringida. Varios plsmidos de Bacillus codifican protenas-tubulina similares, que son muy divergentes en secuencia desde el uno al otro y tambin de FtsZ y tubulinas (Larsen et al., 2007). Estas protenas incluyen Tubz y RepX, que desempean papeles importantes en la estabilidad de los plsmidos que las codifican (Tinsley y Khan, 2006; Larsen et al, 2007). Tubz monomrico tiene una estructura muy similar a /-tubulina (Ni et al., 2010), pero las formas de filamentos helicoidales a la derecha consisten en dos protofilamentos (Aylett et al., 2010). Una excepcin al bajo nivel de conservacin de secuencia entre las protenas del citoesqueleto procariotas y eucariotas son BtubA y B, que se encuentra en el Verrucomicrobia Prosthecobacter (Jenkins et al., 2002microtbulos). Estas protenas son mucho ms similares en secuencia a las tubulinas eucariticas que son FtsZ, Tubz, o RepX. Esta elevada similitud en la secuencia, la restriccin a Prosthecobacter, y los anlisis filogenticos de FtsZ / de tubulina sugieren fuertemente que todos los BtubA/B fueron adquiridos por transferencia horizontal de genes de un eucariota y no son descendientes de bacterias J. Cell Biol. Vol. 194 No. 4 513525 La evolucin del citoesqueleto Wickstead and Gull 3 FtsZ / Tubz (Jenkins et al., 2002; Vaughan et al, 2004; .Schlieper et al, 2005; Pilhofer et al, 2007amicrotbulos).
Figura 2. Citoesqueletos bacterianos, arqueas y eucariotas. Las representaciones esquemticas se muestran para un pequeo nmero de organismos modelo de cada uno de los tres dominios de la vida (A-C), se muestra la organizacin del citoesqueleto en clulas que no se dividen y dividen (a la derecha y a la izquierda de cada par, respectivamente). Los filamentos homlogas estn coloreados de manera similar. Tambin se muestra la posible organizacin del citoesqueleto en el ltimo antecesor comn de eucariotes (LECA) (D), destacando las familias ancestrales de motores microtubulares.
Es probable que BtubA es un homlogo de -tubulina y BtubB de -tubulina (Sontag et al., 2009), pero el linaje eucariota que actu como el donante para estas protenas no se conoce. Se conservan la capacidad para formar protofilamentos (no microtbulos), tanto in vitro como in vivo (Sontag et al, 2005;.. Sontag et al, 2009), y su continua expresin y conservacin funcional sugiere que son de algn beneficio para clulas Prosthecobacter. Sin embargo, no han desplazado el citoesqueleto nativo semejante a tubulina en estos organismos, sino que coexisten con FtsZ convencional (Pilhofer et al., 2007b). Muchos eucariotas poseen genes FtsZ de origen procariota (Fig. 3) heredada de los antepasados endosimbiticos de las mitocondrias y los cloroplastos. Posteriormente, estos genes han pasado de los genomas de organelas al ncleo, pero sus orgenes son todava evidentes en filogenias FtsZ, donde el grupo con secuencias de cualquiera - proteobacterias o cianobacterias (Kiefel et al, 2004; Vaughan et al., 2004; los grupos de bacterias que dieron lugar a las mitocondrias y cloroplastos, respectivamente). Estas eucariticas FtsZs funcionan en la divisin de las mitocondrias y cloroplastos mediante la formacin de un anillo de divisin con sorprendente similitud a la encontrada en las bacterias (Margolin, 2005). La redundancia de esta maquinaria de divisin basada en FtsZ con el aparato de fisin dinamina eucaritico puede proporcionar un mecanismo para prdidas mltiples independientes de mitocondrias FtsZ desde la raz eucariota (Osteryoung y Nunnari, 2003; Praefcke y McMahon, 2004). En contraste, los genes del cloroplasto FtsZ estn ms ampliamente conservadas (. Fig 3). Muy recientemente, la familia-FtsZ tubulina se ha ampliado an ms con la identificacin de dos nuevas familias de protenas FtsZ en procariotas denominadas-FtsZl1 y FtsZl2 (Makarova y Koonin, 2010). Ambas familias son divergentes de tubulina, FtsZ, u otras familias previamente identificadas. Una de las nuevas familias, FtsZl2 se encuentra slo en las proteobacterias, pero la familia FtsZl1 tiene una distribucin mucho ms amplia que incluye varios grupos de bacterias y Euryarchaeota. La funcin de FtsZl1 y FtsZl2 es desconocida. Es posible que no forman FtsZ / filamentos tubulina, dada su divergencia estructural predicho a partir de otros miembros de la superfamilia (Makarova y Koonin, 2010).
Filamentos II: la superfamilia de actina La actina es una protena eucariota ubicua que formadora de filamentos. Los filamentos de actina (tambin llamados microfilamentos o F-actina) se componen de dos polmeros de protofilamento unidos en una hlice hacia la derecha. (Fig. 1). La hidrlisis de ATP por actina causa un cambio mucho menos dramtico en la estabilidad del polmero que es visto por la hidrlisis de GTP en microtbulos. Como resultado, la actina pura muestra poca inestabilidad dinmica in vitro (Mitchison, 1992), sino que ms bien sufre "treadmilling" a travs de la adicin de subunidades de ATP polarizados consolidados. In vivo, la actina es mucho ms dinmica que in vitro debido a la presencia de factores de unin de monmeros, agentes de corte de filamentos, y agentes estabilizacin/empaquetado. (N.T. treadmilling: es un fenmeno observado en muchos filamentos del citoesqueleto celular, especialmente en los filamentos de actina y microtbulos. Se produce cuando un extremo de un filamento crece en longitud, mientras que el otro extremo se contrae dando como resultado en una seccin de filamento aparentemente en "movimiento" a travs de un estrato o el citosol. Esto es debido a la eliminacin constante de las subunidades de protenas a partir de estos filamentos en un extremo del filamento, mientras subunidades de la protena se aaden constantemente en el otro extremo). La actina eucariota es un miembro de una superfamilia grande y diversa de ATPasas que incluye chaperonas Hsp70 y varias clases de kinasas azcar / alcohol de azcar (Flaherty et al, 1991; Bork et al, 1992), as como protenas relacionadas con la actina (ARP; Frankel y Mooseker, 1996; Schafer y Schroer, 1999) Tambin identificados como miembros de esta superfamilia de varias otras protenas bacterianas, incluyendo MreB, FtsA, y ParM (Bork et al., 1992) Desde la identificacin inicial, la superfamilia de las protenassemejantes a actina en bacterias ha resultado ser muy complejo, que abarca ms de 20 clases de protenas (Derman et al., 2009). El homlogo ms comn de actina es MreB. En cuanto a tubulina / FtsZ, actina y MreB son muy divergentes en la secuencia primaria, pero tienen estructuras similares (Fig. 1), basada en el "actina -plegada" que une la superfamilia (Kabsch y Holmes, 1995). En _ MreB vitro asambleas de dos protofilamentos que son similares en estructura a F- actina, pero carecen del giro helicoidal (van den Ent et al, 2001; .Esue et al, 2005). La funcin conservada de MreB bacterianos en forma de bastones (y distintas protenas procariotas estrechamente relacionadas, como Mbl y MreBH) parece estar en el mantenimiento de la forma celular (Jones et al, 2001; Graumann, 2007; Margolin, J. Cell Biol. Vol. 194 No. 4 513525 La evolucin del citoesqueleto Wickstead and Gull 4 2009). MreB Los filamentos MreB forman una hlice por debajo de la membrana celular e influyen en la posicin de la sntesis de la pared celular (Figura 2 A;. Jones et al, 2001;. Daniel y Errington, 2003). En consonancia con esta funcin, MreB generalmente se conserva slo entre bacterias en forma de bastn, pero est ausente en cocos esfricos. Debido a linajes bacterianos en forma de bastones en existentes son probablemente ms antiguos, se ha sugerido que las formas por cocos se han derivado de ellos mltiples veces por la prdida de MreB y los genes asociados (Margolin, 2009). Sin embargo, la correlacin entre la forma procariota y MreB no es estricta: algunos cocos an poseen MreB y hay bacterias en forma de bastn que carecen MreB (Margolin, 2009).
Figura 3 La distribucin de los componentes principales del citoesqueleto a travs del rbol de la vida. Los crculos rellenos indican la presencia de un miembro identificable de una familia de protenas en un organismo; los crculo abierto indican ausencia / no se encuentra. Los organismos se identifican nicamente por gneros y se agrupan en grupos taxonmicos superiores. Emiliania huxleyi no ha sido colocado en uno de los grupos taxonmicos en reflejo de la incertidumbre en cuanto a la colocacin de Haptophyta. "MreB" incluye (/ MreBH MBL) secuencias MreB, que colocalize con MreB y son muy similares en secuencia (Carballido Lpez y Errington, 2003; Carballido Lpez et al, 2006.). Las secuencias identificadas como archaea MreB utilizando la tcnica arCOG (arCOG04656;. Makarova et al, 2007, 2010) tienen una afinidad ms cerca de secuencias de Hsp70 y no estn incluidos. Crenactin Arqueal (*) es ortlogos al ancestro comn de la actina eucariotica y ARPs (Yutin et al, 2009;.. Ettema et al, 2011), pero se ha introducido como actina para mayor claridad. Las distribuciones de la gran cantidad de distintas protenas procariotas semejantes a actina distintas de MreB y FtsA (como Alfa, Alp6 / 7/8) no se incluyen aqu debido a las dificultades actuales en la resolucin de las familias individuales (Derman et al, 2009. Yutin et al., 2009). Hay posibles ortlogos de MinD Euryarchaeota (Leipe et al., 2002), pero su verdadera pertenencia an no est clara.
J. Cell Biol. Vol. 194 No. 4 513525 La evolucin del citoesqueleto Wickstead and Gull 5 ParM (anteriormente StbA) es un homlogo de actina bacteriano transmitida por plsmido con un ro formador de filamentos. ParM es slo un 20% idntica a MreB, que es comparable al grado de conservacin entre la actina o ParM o MreB. No obstante, ParM rene polmeros retorcidos in vitro que recuerda a F-actina (van den Ent et al., 2002), pero con un lugar de giro diestro-zurdo (Orlova et al., 2007). La energa de polimerizacin de ParM se utiliza en la segregacin del plsmido R1 (y otros que contienen el opern parMRC) empujando el plsmido recin sintetizado a los polos de la clula (Garner et al, 2007; Salje y Lowe, 2008). Hasta la fecha, los homlogos inequvocos estn restringidos a un grupo cercano de -proteobacterias, las Enterobacteriaceae. Es probable que en los genes anotados "ParM" en los genomas de Firmicutes, - proteobacterias y cianobacterias representen otras clases de protenas semejantes a actina, en lugar de verdaderos ortlogos. En apoyo de esta interpretacin, "ParM" codificado en el plsmido pSK41 de Staphylococcus aureus son idnticas en slo un 19% secuencias ParM - proteobacteriales y parece estar ms relacionada estructuralmente con distintas protenas procariotas semejantes a actina archaea (Popp et al., 2010). Tanto MreB y FtsA se limitan casi exclusivamente a bacterias (Fig 3) Ejemplos claros de MreB tambin se encuentran en Euryarchaeota de los gneros Methanopyrus, Methanobrevibacter y Methanothermobacter (Yutin et al., 2009) Dada su limitada distribucin y estrecha similitud con secuencias bacterianas, estos son muy probablemente el resultado de la transferencia horizontal de genes de bacterias. Sin embargo, no se puede descartar por completo que son genes raros pero altamente conservados de ascendencia lineal. Diversos secuencias arqueas se han identificado como posibles ortlogos MreB usando la tcnica "agrupamiento de arqueas de grupos de ortlogos" (Makarova et al., 2007, 2010) Estas secuencias tienen una afinidad ms cerca de Hsp70 que a MreB de las bacterias o Methanopyrus y su agrupacin en arCOG04656 puede ser un artefacto de la tcnica. Estas secuencias no se consideran como miembros cierto MreB en este documento (Fig 3). Existen varios otros miembros de la superfamilia actina en bacterias en particular: MamK, que se requiere para la organizacin del magnetosoma en Magnetospirillium; (Komeili et al, 2006; Pradel et al, 2006). AlfA, que est involucrada en la segregacin plasmdica en Bacillus subtilis en una manera similar a ParM (Becker et al, 2006); y Ta0583 del euryarchaeon Thermoplasma acidophilum (Roeben et al, 2006; Hara et al., 2007) Estas protenas tienen ya sea una distribucin filogentica limitada o sus familias todava tienen que estar bien delimitados (Derman et al, 2009; Yutin et al, 2009) (Hara et al, 2007) La posibilidad de que Ta0583 podra ser el homlogo ms cercano a la actina no ha recibido el apoyo de los anlisis posteriores (Yutin et al, 2009; Ettema et al, 2011). Sin embargo, recientemente una familia archeae semejante a actina ha sido descrito que es monofiltica con la actina y distintas protenas procariotas relacionados con la actina (Yutin et al, 2009; Ettema et al, 2011). Esta familia de protenas, llamada "crenactin," tiene una localizacin en las clulas Pyrobaculum muy similar a MreB en bacterias (Figura 2 B, Ettema et al, 2011), pero est ms relacionado con actina que a MreB o ParM. Las posibles implicaciones de esta familia se tratan ms adelante.
Filamentos III: filamentos intermedios Filamentos intermedios eucariotas (FIs) son a diferentes de los microtbulos y microfilamentos en la estructura, bioqumica, y la distribucin filogentica. A diferencia de la actina y la tubulina, que son protenas globulares que forman protofilamentos polarizados, las protenas FIs son dmeros extendidos que se superponen para formar cables no polarizados. Hay muchos tipos de protenas en los vertebrados, la mayora de los cuales se pueden agrupar en cinco clases: (1) tipo I queratinas (cidas); (2) tipo II queratinas (bsicas); (3) vimentina y desmina; distintas protenas procariotas (4) internexina y neurofilamentos; y (5) las lminas (Fuchs y Weber, 1994) Las lminas estn tambin presentes en protostomes, lo que sugiere que todas las familias de protenas FI se derivan de una secuencia nica semejante a lmina en el ancestro comn de los metazoos (Weber et al, 1989; Dodemont et al, 1994; Bovenschulte et al, 1995) Es significativo, sin embargo, qu la protena FI eucariota slo se han encontrado de forma inequvoca en los animales y sus familiares, lo que sugiere que son una innovacin especfica a este linaje y no est presente en el ltimo ancestro comn (LECA (Erber et al, 1998); Ver Fig 3). La bacteria Caulobacter crescentus codifica una protena con una disposicin prevista de espiral de bobinas similar a la lmina A animal. (Ausmees et al., 2003). Esta protena, CreS o crescentin, forma filamentos helicoidales que son necesarios para las formas celulares vibrioides o helicoidales adoptadas por Caulobacter Aunque crescentin fue originalmente descrita slo como "IF", y pronostic de estructura secundaria de la protena con frecuencia se ha interpretado como evidencia de que las bacterias poseen homlogos antiguos de FI eucariotas Sin embargo, hay varios argumentos en contra de esta interpretacin. En primer lugar, CreS tiene una distribucin muy restringida (Fig 3); hasta la fecha, slo se ha encontrado en Caulobacter Dada esta gama restringida, si la lmina A y crescentina son verdaderamente homlogos, entonces lo ms probable es que CreS representa una transferencia lateral de un gen eucariota para Caulobacter ms que un verdadero homlogo. En segundo lugar, los homlogos identificables de protena FI eucariotas _ estn restringidos a los metazoos (o posiblemente holozoa; Fig 3). y no siempre han estado presentes en las herencia vertical pre- excluida LECA de los procariotas. En tercer lugar, las similitudes en arquitectura de protena prevista (en este caso, las posiciones en espiral de bobina) no son equivalentes para un plegamiento plegamiento homlogo En la actualidad, no es posible comparar protena FI eucariotas y crescentina como pruebas de plegamiento homlogo, ya que no hay representantes de cualquiera de la familia para la que se han determinado las estructuras completas. Adems, aunque ortologos de crescentina no han sido identificados fuera de Caulobacter, hay evidencia de que CreS es un miembro de una familia ms grande de protenas bacterianas (Bagchi et al., 2008). Todas estas protenas se predice que contiene grandes extensiones en espiral - bobinas, pero la gran mayora no tienen similitud arquitectnica sorprendente con lamina A (u otra protena FI vertebrada). Por lo tanto, la distribucin de las regiones en espiral-bobina en crescentina y lamina A es ms probablemente un ejemplo de convergencia que una reflexin de ascendencia compartida.
Filamentos IV: protenas WACA Los procariotas tienen una cuarta clase de protenas de filamentos conocidos como ATPasas del citoesqueleto Walker A (Wacas; Michie y Lowe, 2006). WACA protenas son una familia diversa de ATPasas (Koonin, 1993), que son por s mismas parte de la superclase extremadamente grande de protenas P-loop incluyendo protenas de reconocimiento de seal de partculas, Rho / Ras GTPasas y motores del citoesqueleto Walker A (Leipe et al., 2002). J. Cell Biol. Vol. 194 No. 4 513525 La evolucin del citoesqueleto Wickstead and Gull 6 La WACA MinD es una ATPasa activa (de Boer et al, 1991) que forma los filamentos dinmicos alrededor de la periferia de la clula en E. coli e inhibe la formacin del anillo Z (Pichoff y Lutkenhaus, 2001; Shih et al, 2003). En Bacillus subtilis, MinD est estticamente asociada con las polos de la clula (Marston et al, 1998; Marston y Errington, 1999), lo que no esta es si la polimerizacin dinmica es una caracterstica conservada evolutivamente de la biologa de MinD Las secuencias MinD se encuentran en muchos grupos de bacterias (Fig. 3) y hay supuestos ortlogos identificados en Euryarchaeota (Leipe et al., 2002) Sin embargo, las diferencias entre las familias WACA an no se han resuelto por completo, lo que no est claro actualmente si estas secuencias son monofiltica con secuencias MinD bacterianas Incluso si no estrictos orthologues MinD, ejemplos de protenas WACA parecen estar presentes tanto en Euryarcheaota y Crenarchaeota (Makarova et al., 2010). Diversas protenas bacteriana WACA se han descrito ParA, ParF, y Soj juegan un papel en la segregacin del ADN mediante diferentes mecanismos (Pogliano, 2008; Lwe y Amos, 2009), lo que demuestra una aparente versatilidad de este sistema para la segregacin Es quizs sorprendente, por lo tanto, que no hay los filamentos WACA eucariotas El doblez de MinDe y Soj es pariente lejana de las septinas eucariotas (Cordell y Lowe, 2001; Leonard et al, 2005; Lwe y Amos, 2009); pero, esto probablemente refleja la relacin distante compartida por todos los GTPasas P-loop (Leipe et al., 2002). Sin embargo, los genes MinD de ascendencia bacteriana en Viridiplantae (plantas de algas verdes y terrestres) y algunos stramenopiles (Fig 3) que desempean un papel en la divisin de plstidos (Marrison et al, 1999; Colletti et al., 2000; Kanamaru et al., 2000). Es de destacar que todos los eucariotas que poseen genes secuencias MinD tambin codifican derivados FtsZ endosimbiontes.
Divisin procariota: un problema comn con muchas soluciones Si existe un tema central que corre a travs de la evolucin del citoesqueleto procariota, que parece ser esta: la plasticidad Cada una de las principales familias de protenas cytomotive formadoras de filamentos consta de varias paralogues, (N.T.: paralogues, cada par de genes que se deriva del mismo gen ancestral) que a menudo son tan divergentes entre s como estn de homlogos eucariotas. Algunas de las clases_como FtsA (del MreB / actina superfamilia) o las recientemente identificadas familias semejantes a FtsZ pueden no formar filamentos in vivo en absoluto. Sin embargo, entre aquellas familias que polimerizan, las interacciones laterales en el filamento central parecen ser bastante maleables en escalas de tiempo evolutivas sin interrumpir la polimerizacin (por ejemplo, los filamentos MreB rectas, contra ParM torsin zurdo y diestro actina). Tambin hay plasticidad en la funcin biolgica las que son utilizados por los filamentos FtsZ y MreB que estn involucrados en la divisin celular y la morfologa, mientras que sus homlogos Tubz y ParM juegan un papel en la segregacin plasmdica El resultado es que los procariotas utilizan diferentes sistemas para resolver problemas comunes. En las bacterias, la segregacin aciva de ADN se puede lograr por al menos tres tipos de mquinas segregacin (Ebersbach y Gerdes, 2005; Hayes y Barill, 2006). Los sistemas de tipo I utilizan protenas WACA, como Par y Soj Los sistemas de tipo II se basan en el homlogo ParM de la actina. Los sistemas de tipo III son los de Bacillus que utilizan homlogos semejantes a tubulina , como Tubz y RepX En un ejemplo notable de convergencia aparente, tanto ParM (tipo II) y Tubz (tipo III) forman filamentos helicoidales similares que probablemente actan para impulsar plsmidos (van den Ent et al, 2002; Aylett et al, 2010). Sin embargo, es el sistema de tipo I el que tiene, ms amplia difusin en las bacterias Es interesante, entonces, que los filamentos a base de protenas WACA no se han conservado en eucariotas, y no puede ser ampliamente utilizada en la segregacin cromosmica en arqueas (Bernander, 2000; Makarova et al, 2010). Significativamente, ninguna de las familias de protenas del citoesqueleto son ubicuas en todos los procariotas, o an en uno de los dos dominios de la vida procariota El papel como FtsZ en la citocinesis parece ser la funcin bajo mayor presin selectiva para la retencin (Erickson, 2007), pero incluso esta protena ha sido perdida por varios linajes de bacterias y todo el subtipo crenarchaeal.
La eucariognesis: familias y especializacin A pesar de estar basado en los filamentos homlogos, el citoesqueleto eucariota no es simplemente una versin ms extensa del procariota (Fig. 2 C). La complejidad del citoesqueleto eucariota se basa en realidad en un conjunto ms pequeo de filamentos de automocin ancestrales que la de los procariotas Con la notable excepcin de las maquinarias de divisin semejante a procariote asociados con algunos plastidios, slo uno paralogue de una protena de la familia MreB / cranactin y una protena FtsZ / Tubz parece haber creado el citoesqueleto eucariota Sin embargo, esta pequea seleccin ha sido objeto de varias rondas de duplicacin de genes y la especializacin de este conjunto ancestral.
Los heterodmeros de y -tubulina forman la mayor parte de la tubulina en las clulas eucariotas. Ellos son suficientes para la produccin de los microtbulos in vitro, y es muy probable que ellas fueran los primeros tipos en evolucionar desde la simple proto tubulina ancestral Sin embargo, no son las nicas tubulinas ancestrales. Los anlisis sugieren que la familia tubulina abarca por lo menos seis clases, denominadas , , , , y con dos tipos ms divergentes ( y ) encontrados en algunos organismos (Vaughan et al., 2000; Dutcher, 2003). - tubulina juega un papel fundamental en la nucleacin de los microtbulos (a travs de la accin del conservada del complejo en anillo de la -tubulina) y es, al igual que y , ubicuo a todos los eucariotas. En contraste, y -tubulina tienen roles centriolares (Dutcher y Trabuco, 1998; Chang y Stearns, 2000; Ruiz et al., 2000) y se conservan en casi todos los organismos que construyen centrolos /cuerpos basales y est ausente en los organismos que perdieron cilios / flagelos (Hodges et al., 2010). Al menos cinco de las clases de tubulina (, , , y ) se remontan al ancestro comn eucariota ( Fig 3). Todos los tipos tubulina estn ms estrechamente relacionados entre s que a FtsZ / Tubz (Vaughan et al, 2000; Dutcher, 2003), lo que implica que todos son descendientes de una proto tubulina comn por duplicacin de genes. Tanto la duplicacin y especializacin funcional en distintas clases debe haber ocurrido antes de LECA. Hay sorprendentes paralelismos entre la evolucin de proto- eucariota de tubulins y el de la actina. Las protenas ms similares en secuencia a la actina convencional son la ARP. Las ARP cubren al menos ocho grandes familias (Sehring et al., 2007) que se encuentra slo en las clulas eucariotas. Cuatro familias ARP (ARP4, 5, 6.7, y 8.9) no se asocian con la actina citoplasmtica, pero son protenas nucleares implicadas en la remodelacin de la cromatina (Chen y Shen, 2007; Dion et al, 2010.). El resto de las familias-ARP1, 2, 3, y 10/11-tienen un papel importante en la modificacin o ampliacin de la funcin de actina citoplasmtica. ARP1 es una parte integral del complejo J. Cell Biol. Vol. 194 No. 4 513525 La evolucin del citoesqueleto Wickstead and Gull 7 dynactin, que une el citoesqueleto de actina y tubulina a base de (Schroer, 2004). Levadura Arp10p y metazoos ARP11 (ARP10 / 11 miembros de la familia) son tambin parte del complejo dynactin (Eckley y Schroer, 2003; Clark y Rose, 2006). En contraste, un complejo de siete subunidades formadas alrededor de un heterodmero de ARP2 y ARP3 es un importante nucleador F-actina en la mayora de los eucariotas (Pollard y Beltzner, 2002; Goley y Welch, 2006). La nica ARP que aparece para formar filamentos es Arp1p (Schafer et al, 1994; Bingham y Schroer, 1999). Estos filamentos son mucho ms cortas que las observadas para la actina, pero tienen morfologa similar. En cuanto a la tubulina, no haba una nica protena semejante a actina como en el proto-eucariota que evolucion en mltiples formas parlogas antes de la LECA. De este modo, tanto la actina y tubulina bases del citoesqueleto inventaron independientemente complejos que contienen formas divergentes de subunidades de filamentos que fueron especializados para la nucleacin (Arp2 / 3 y -tubulina complejos anillo). Sin embargo, en el caso del citoesqueleto basado en actina, este complejo de nucleacin parece ser prescindible en algunas circunstancias porque orthologues de ARP2 y ARP3 se han perdido varias veces a travs de eucariotas (Figura 3;. tenga en cuenta que los organismos siempre pierden tanto, como sera esperado para un complejo). Una conversacin cruzada entre los microtbulos y microfilamentos travs del complejo de dinactina tambin se ha perdido varias veces, como puede verse a partir de la distribucin de ARP1. La historia de estas familias principales del citoesqueleto eucariota tambin muestra cierto grado de plasticidad, pero es bastante diferente de la observada en procariotas. Los parlogos eucariotas estaban, en su mayor parte, presentes en la LECA. Aunque existen tipos divergentes raros (por ejemplo - y -tubulina), no tienen el mismo nivel de divergencia de tipos de ncleo como se ve para las protenas procariotas divergentes. Por otra parte, su funcin biolgica parece ms esttica. La divergencia entre la distribucin de las familias en los eucariotas existentes es en gran medida un producto de la prdida de la funcin (por ejemplo, prdida de dynactin complejo y ARP1; prdida de centriolos y /-tubulina).
Motores del citoesqueleto Los procariotas utilizan la capacidad cytomotive intrnseca de filamentos del citoesqueleto para hacer el trabajo. Las clulas eucariotas tambin utilizan la energa de polimerizacin / despolimerizacin (McIntosh et al., 2010). Sin embargo, en eucariotas la dinmica intrnseca de los filamentos ha sido aumentada por la adicin de motores de citoesqueleto dinenas, kinesins, y miosinasque derivan la energa de hidrlisis de ATP para realizar diversas tareas celulares. Cada uno de estos motores es una superfamilia que contiene varias clases de protenas especializadas. Las kinesinas y miosinas comparten una estructura similar veces, lo que sugiere que tienen una ascendencia comn (Kull et al., 1996, 1998). Esto es bastante sorprendente teniendo en cuenta que ahora actan exclusivamente en los microtbulos y la actina F, respectivamente, y presenta una especie de enigma en trminos de biologa celular evolutiva. Se ha establecido plausible para los motores que evolucionaran despus de los filamentos sobre el que actan. Como se ha comentado anteriormente, los filamentos hechos de tubulina/FtsZ y homlogos de actina/MreB ya estaban bien establecidos en procariotas antes de la aparicin de los eucariotas, pero ambas clases de motor evolucionaron ms tarde en el proto-eucariota. Esto requiere que: (1) un nico "ur-kinesin-miosina" originalmente entr en ambos filamentos basados en actina y tubulina y slo ms tarde se especializ en familias separadas; (2) un motor evolucionado para un tipo de filamento y posteriormente desarroll una capacidad de moverse por el otro; o (3) ambas familias motor evolucionaron independientemente de la misma familia de NTPases. Las grandes diferencias en la estructura y la secuencia entre la tubulina / FtsZ y filamentos de actina / MreB sugieren que el ltimo escenario es ms plausible, aunque menos parsimoniosa. Tambin hay un precedente para esto porque esta familia de NTPases P- loop tambin dio lugar a muchas GTPasas eucariotas especficos (incluyendo Arf, Ras / Rab, Rho / Ran, y las familias de protenas G; Leipe et al, 2002.). Dinenas tienen una estructura muy diferente al de las miosinas y kinesinas. El ncleo del complejo dinena es la cadena pesada de dinena (DHC), que es un miembro de otra superclase grande y diversa de NTPases, la AAA + protenas (una familia incluyendo ATPasas asociadas a diversas actividades celulares). Las cadenas pesadas de dinena contienen seis dominios AAA + que forman un anillo hexamrico intramolecular (Sams et al., 1998; King, 2000; Burgess et al, 2003), lo que implica que las cadenas pesadas de dinena originalmente evolucionaronya sea por la duplicacin de dominio endgeno o fusin de genes que codifican protenas AAA +. Debido a que todas las clases de cadenas pesadas de dinena tienen la misma estructura, esta duplicacin ocurri antes de la creacin de parlogos funcionales. La superfamilia de dinena es tambin diferente de kinesinas y las miosinas en que todos menos uno de las nueve clases asociadas con una especfica organela-el cilio. Slo la dinena citoplasmtica 1 tiene un rol conservado fuera del cilio; las dems familias es el transporte intraflagelar motor (por razones histricas conocidas como dinena 2 citoplasmtica) y siete familias de dinenas integradas en axonemas mviles. Teniendo en cuenta su papel central en la clula eucariota, fue sorprendente encontrar a partir de anlisis post- genmicos de repertorios motor que ninguna de las familias es ubicua a todos los eucariotas. En efecto, las superfamilias de miosina o dinena se han perdido en su totalidad a partir de algunos linajes (ver figura 3; Lawrence et al, 2001; Matsuzaki et al, 2004; Richards y Cavalier- Smith, 2005; Wickstead y Gull, 2007). (Wickstead y Gull, 2006; Wickstead et al, 2010) A la fecha, las kinesinas son codificadas por todos los genomas secuenciados, pero el repertorio en cada linaje pueden ser muy diferentes; por ejemplo, Entamoeba histolytica codifica solamente los miembros de familias de kinesina-5, - 14 y -15 (y no la dinena en absoluto), mientras que el apicomplejo Theileria parva codifica kinesina-8 y -13.
El axonema Una de las estructuras icnicas del citoesqueleto eucariota es el axonema-que se ajusta a, nueve dobletes de microtbulos radialmente colocados alrededor de un aparato central que contiene dos microtbulos simples (Haimo y Rosenbaum, 1981). El axonema es la estructura alrededor de la cual se forman todos los los cilios y flagelos eucariotas. La evolucin de los flagelos / cilios forma parte de una revisin de esta serie por Carvalho-Santos et al. (2011) y no sern discutidos en detalle aqu. Sin embargo, el axonema representa una importante innovacin del citoesqueleto y los aspectos de su evolucin son muy pertinentes a la aparicin del citoesqueleto en el proto- eucariota. J. Cell Biol. Vol. 194 No. 4 513525 La evolucin del citoesqueleto Wickstead and Gull 8 Desde su distribucin en los organismos existentes, es claro que el axonema evolucion antes del ltimo ancestro comn de los eucariotas Desde entonces, se ha pierde de manera independiente a partir de mltiples linajes eucariotas (en particular, de muchos linajes de plantas, hongos y amebas). Estas prdidas estn estrechamente relacionadas con las prdidas de familias ancestrales de kinesina y dineina. El axonema evolucion a partir de los microtbulos del citoplasma (Cavalier-Smith, 1978, 1982, 2006) Se infiere generalmente que las ms antiguas estructuras fueron semejantes a axonema, unas protrusiones desde el cuerpo celular basadas en microtbulos con una funcin exclusivamente sensorial, similar a un cilio inmvil hallado en muchos tipos de clulas animales diferenciadas (Rosenbaum y Witman, 2002; Jkely y Arendt, 2006; Satir et al., 2007). Axonemal la motilidad, por lo tanto, slo surge despus con la evolucin de las clases especializadas de dinena del axonema. Si se supone que la dinena citoplsmica 1 evolucion antes de las otras clases, a continuacin, las filogenias dinena apoyan esta hiptesis, lo que sugiere la evolucin del transporte intraflagelar (IFT) antes de dinena axonemal (Wilkes et al, 2008; Hartman y Smith, 2009). Este fundamento es tambin coherente con la evolucin de un proto-cilio como una organela mvil, donde el movimiento fue basado originalmente en deslizamiento impulsado por la maquinaria de transporte intraflagelar (Mitchell, 2004, 2007). Sin embargo, el fundamento de las filogenias de cadenas pesadas de dinena con el pariente ms cercano de dinena eucariota, midasin (Garbarino y Gibbons, 2002; Iyer et al, 2004.), sugiere que los los microtbulos deslizantes estaban ms cerca del origen de la evolucin ciliar, emergiendo antes de la maquinaria especializada para el transporte intraflagelar. (Wickstead y Gull, 2011). Esto implica que el proto-cilio no evolucion desde protrusiones inmviles, sino desde un haz de microtbulos mviles citoplasmtica anlogos a un axostilos de oxymonads (Grimstone y Cleveland, 1965; McIntosh, 1973), es de suponer que se unan de manera independiente en un transporte intracelular como son algunos axonemas de hoy (Witman, 2003; Briggs et al, 2004).
La revolucin proto-eucariota Uno de los resultados ms sorprendentes de nuestra creciente capacidad para investigar las caractersticas del ltimo antecesor comn de eucariotas (LECA) ha sido cmo gran parte de la complejidad biolgica en las clulas existentes se remonta a esta clula ancestral. El ltimo antecesor comn de eucariotas (LECA) posea gran parte de la complejidad ya visto en el replisoma (Liu et al., 2009), el espliceosoma (Collins y Penny, 2005), y en el sistema de endocitosis (Dacks et al., 2009), as como en la maquinaria necesaria para la meiosis y fagotrofa (Ramesh et al, 2005.) (Cavalier-Smith, 2002b; Yutin et al, 2009). Por otra parte, el anlisis comparativo del genoma de la Naegleria bruberi de vida libre identific grupos de 4,000 protenas que probablemente estaban presentes en la ltimo antecesor comn de eucariotas (LECA) (Fritzen-Laylin et al., 2010). Este modelo de "complejidad temprana" de la evolucin eucariota se refleja en el citoesqueleto (Fig. 2 D). En algn lugar en el espacio evolutivo entre los procariotas y el ltimo antecesor comn de eucariotas (LECA), Una sola proto- tubulina y molculas de proto-actina se diversificaron en mltiples formas especializadas. Tres clases de motores surgieron de forma independiente, y evolucionaron para incluir al menos nueve clases de dinena, once clases de kinesina, y tres clases de miosina (Richards y Cavalier- Smith, 2005; Wickstead y Gull, 2007; Wickstead et al, 2010). Adems de estos, el axonema formado, con 100-200 protenas asociadas (Avidor-Reiss et al, 2004;. Pazour et al, 2005; Broadhead et al, 2006.), muchas de las cuales no tienen ortlogos procariotas. Entre los procariotas y el ltimo antecesor comn de eucariotas (LECA), se produjo una revolucin en la biologa del citoesqueleto. Esta complejidad no pudo haber aparecido totalmente formada, pero surgi por elaboraciones paso a paso de la estructura celular (y el repertorio gentico). Sin embargo, el gran nmero de formas intermedias ms simples que debe haber existido parecen haber dejado descendencia. Esta es tal vez porque una gran parte de estos cambios se produjo en un tiempo relativamente corto, con una innovacin creadora de un panorama favorable para la evolucin de la prxima (Cavalier-Smith, 2006). Alternativamente, todos los descendientes de estas formas intermedias sencillamente quedaron fuera de competencia por la llegada del ltimo antecesor comn de eucariotas (LECA), con su endosimbionte mitocondrial, sistema de endomembrans, y el sofisticado citoesqueleto. Lo que est claro es que desde este complejo ltimo antecesor comn de eucariotas (LECA), la diversificacin en muchos linajes eucariotas no ha sido a menudo acompaada por la adicin de nuevas clases, sino por prdida de ancestros. Algunas de estas prdidas estn asociados con la prdida de las estructuras o funciones (tales como la motilidad axonemal) especficos, pero parece que hay una notable flexibilidad en el repertorio preciso de muchas de estas antiguas familias que son necesarias para funcin de la clula eucariota. A pesar de que estn construidas a partir de protenas homlogas, las funciones de los filamentos procariotas y eucariotas no son ampliamente homlogas. En eucariotas, la segregacin de ADN se realiza de forma ubicua por el citoesqueleto basado en tubulina, mientras que la citocinesis involucra a la actina-miosina. En contraste, la mayora de las citocinesis procariotas se basan en el homlogo FtsZ, mientras que protenas semejantes a actina, semejantes a tubulina, o WACA pueden utilizarse para la segregacin de ADN. Esto sugiere que un cambio tiene que haber ocurrido en la funcin del citoesqueleto en el proto-eucariota (Lwe y Amos, 2009). Sin embargo, con diversas formas divergentes que ocurren en ambas familias de filamentos, y la creciente evidencia de plasticidad en la funcin del citoesqueleto procariota, esta tal vez no fue una transicin tan dramtica como podra parecer a primera vista. La FtsZ y la tubulina son protenas altamente conservadas que estn restringidas en secuencia, sin embargo, son muy divergentes entre s (Erickson, 2007). Debido a que este es el caso, cmo y FtsZ (o un homlogo procariota de los mismos) evolucionaron hacia tubulina eucariota? Se ha sugerido que las tubulinas eucariotas evolucionaron a partir de una secuencia semejante a Tubz (Cavalier-Smith, 2010). Tal escenario ha sido muy recomendable. Porque en las funciones de semejante a Tubz en la segregacin de ADN, hay una transicin evolutiva plausible el desarrollo de la mitosis basada en tubulina de los eucariotas. Adems, semejante a Tubz y FtsZ coexisten en las clulas bacterianas, lo que significa que una funcin de semejante a tubulina podra evolucionar para un descendiente de Tubz sin la prdida de la funcin celular de escisin basada en FtsZ. Alternativamente, un FtsZ redundante, ya sea como resultado de la duplicacin de genes o la evolucin de la citocinesis basada en la actina, podra haber proporcionado la relajacin necesaria de la secuencia de restricciones tales como FtsZ que pudo evolucionar hacia la tubulina eucariota (Doolittle, 1995; Erickson, 2007). Curiosamente, el aumento en el tamao celular que acompa la eucariognesis puede haber sido uno de los factores que favoreci la sustitucin de la citocinesis J. Cell Biol. Vol. 194 No. 4 513525 La evolucin del citoesqueleto Wickstead and Gull 9 basada en FtsZ con un sistema basado en actina. Hasta la fecha, ningn anillo Z ha sido descrito que sea mucho ms grande que 1 m de dimetro. Incluso grandes bacterias requieren slo estos pequeos anillos Z para la divisin debido a que forman nuevas clulas por gemacin de pequeas endosporas (Angert Losick, 1998; Robinow Angert, 1998). Esto ha llevado a la sugerencia tentativa de que puede haber un dimetro mximo ms all del cual el anillo Z no puede funcionar de manera eficiente (Erickson, 2007).
Los orgenes eucariotas Paralelamente a numerosos genes que parecen haber surgido especficamente durante la revolucin proto- eucariota, los genomas eucariotas contienen una mezcla de genes de aparente ancestro archaeal y de genes de origen bacteriano (Koonin, 2010). Los genes de origen bacteriano aparentemente son ms numerosos (Esser et al, 2004;. Rivera y Lago, 2004; Makarova et al, 2005). Debido a que todos los eucariotas existentes descienden de un nico ancestro que ya contena la mitocondria endosimbionte , esto proporciona una buena fuente candidato para muchos de los genes de origen bacteriano (aunque la afinidades filogenticas de estos genes son en realidad bastante mixta y no slo de las -proteobacterias; Koonin, 2010). Por el contrario, gran parte de la maquinaria para la replicacin, transcripcin y traduccin parece ser fundamentalmente arqueas, o ms bien semenjates a arqueas (Ribeiro Golding, 1998; Rivera et al, 1998; Yutin et al, 2008), lo que sugiere que la genoma nuclear eucariota se origin, ya sea desde el interior Archaea o desde un grupo hermano de ella. El citoesqueleto eucariota con mayor probabilidad evolucion del hospedador semejante a arqueas que de una endosimbionte bacteriana. Si asumimos que la mitocondria fue adquirida por un proceso semejante a fagocitosis en una proto-eucariota, entonces la estrecha asociacin entre los sistemas de actina y endomembranas en eucariotas sugiere fuertemente que un citoesqueleto de actina primitiva ya exista (y por lo tanto el citoesqueleto de actina sea el husped y no derivado endosimbionte). Tal origen fagoctico proporciona un mecanismo biolgicamente plausible para la adquisicin de las mitocondrias durante la eucariognesis (Cavalier-Smith, 2002b; Yutin et al, 2009.), aunque la presencia del procariotas que viven en otros procariotas demuestra que la fagocitosis no es necesariamente un requisito previo para la adquisicin (von Dohlen et al., 2001). El origen de la tubulina es menos claro. Sin embargo, al menos inicialmente los filamentos FtsZ / Tubz de la nueva -proteobacterium habran sido atrapados en el "lado equivocado" tanto del fagosoma y las membranas bacterianas. Esto hara que no estn disponibles para las funciones en los movimientos del ADN o de organelas en el husped hasta que la transferencia de genes al genoma del husped y la posterior traduccin en el citoplasma husped. El hecho de que varias lneas eucariotas tambin todava poseen FtsZ mitocondrial identificable con funciones en la divisin de organela sugiere que FtsZ de la mitocondria endosimbionte estaba limitada por la funcin conservada y no evolucion directamente a la tubulina citoplasmtica. Diversos estudios filogenmicos apoyan el origen de partes semejantes a archaea del genoma eucariota desde Crenarchaeota (Cox et al, 2008; .Foster et al, 2009), Euryarchaeota, o cualquier subtipo primitivo (Pisani et al, 2007.) (Yutin et al, 2008; .Kelly et al, 2010). Alternativamente, tanto arqueas y eucariotas pudieron derivarse de una lnea extinta "neomuran" (Brown y Doolittle, 1997; Cavalier_Smith, 2002a). Si tanto la actina eucariota y la tubulina se derivan de un husped semejante a archaea ms que de una recientemente identificada endosimbionte, entonces, qu nos indica este hecho sobre la posicin filogentica de una recientemente identificada proto-eucariota? Dado que FtsZ (y todos los otros homlogos de tubulina identificados) no se encuentran en Crenarchaeota (Fig. 3), esto excluira un origen para los eucariotas desde de este grupo (los "eocytes"; Lago, 1988). Por el contrario, una recientemente identificada protena archea crenactin, que es monofiltico con actina eucariota/ARP y el homlogo ms cercano existente de actina eucariota, est ausente en Euryarchaeota (Yutin et al., 2009). Teniendo en cuenta estos datos, la presencia tanto de crenactin y FtsZ en Korarcheota, arqueas profundamente ramificados que no parecen ser ni Euryarchaeota ni Crenarchaeota (Barns et al, 1996.; Elkins et al., 2008), es particularmente interesante (ver Fig. 3). Significativamente, el secuenciado korarchaeon tambin contiene componentes clave de ARN polimerasas eucariotas (Koonin et al., 2007) y de histonas (Bell y Negro, 2010). Tales inferencias basadas en la distribucin son de ninguna manera definitivas (hay que destacar que la secuenciado korarchaeon carece de ESCRTIII [Makarova et al., 2010], que se encuentra en eucariotas). Sin embargo, ellos no dan apoyo a una raz para los eucariotas ya sea incrustadas en una lnea basal de arqueas, o como una clula neomuran anterior. Durante los ltimos 20 aos nuestro modelo de la evolucin del citoesqueleto ha cambiado en gran medida. El citoesqueleto procariota ha demostrado no slo que existe, sino que es dinmica y diversa. Sorprendentemente, tambin ha resultado ser prescindibles al menos en sus formas primordiales. Durante la eucariognesis una cantidad enorme de complejidad se construy antes de LECA, pero la composicin en los organismos individuales existentes muestra una notable flexibilidad. Como muchos datos biolgicos se recolectan y se se hace posible analizar las secuencias de una mayor gama de genomas, parece probable que ms sorpresas surgirn. Para los procariotas, puede ser que an algunos de los protagonistas tienen que formar parte del escenario.