Ao de la Promocin de la Industria Responsable y del Compromiso Climtico
UNIVERSIDAD NACIONAL FEDERICO VILLARREAL
FACULTAD DE CIENCIAS NATURALES Y MATEMTICA ESCUELA PROFESIONAL DE BIOLOGA
CDIGO GENTICO Y MUTACIONES PRESENTADO POR : LEIVA COSTA, JOSEPH DAVID ROMERO MACAVILCA, JOHAN JOSEP TORRES COELHO, CARLOTA DEA GRUPO : ASIGNATURA : GENTICA I AO : III CICLO : VI PROFESOR : 2014 INTRODUCCIN El cdigo gentico es el conjunto de reglas que define la traduccin de una secuencia de nucletidos en el ARNm a una secuencia de aminocidos en una protena en todos los seres vivos. El cdigo define la relacin entre secuencias de tres nucletidos, llamadas codones, y aminocidos. De ese modo, cada codn se corresponde con un aminocido especfico. La secuencia del material gentico se compone de cuatro bases nitrogenadas distintas, que tienen una funcin equivalente a letras en el cdigo gentico: adenina (A), timina (T), guanina (G) y citosina (C) en el ADN y adenina (A), uracilo (U), guanina (G) y citosina (C) en el ARN. Debido a esto, el nmero de codones posibles es 64, de los cuales 61 codifican aminocidos, siendo adems uno de ellos el codn de inicio, AUG, y los tres restantes son sitios de parada, UAA, llamado ocre; UAG, llamado mbar; UGA, llamado palo. La secuencia de codones determina la secuencia de aminocidos en una protena en concreto, que tendr una estructura y una funcin especficas. En la presente prctica se simulo mediante el uso de naipes la formacin del ADN molde, sntesis de ARN y sntesis de protenas. El objetivo de esta prctica es conocer a los nucletidos y aminocidos que interviene en el cdigo gentico MATERIALES - 250 cartas escritas y separas en dos barajas. - Baraja I: Adenina (25), Guanina (25), Citosina (25), Timina/Uracilo (25), ADNpol (5), ARNpol (5), ADNasa (2) y Ligasa (2). Total 114 cartas. - Baraja II: Metionina (3), Triptofano (3), Fenilalanina (4), Tirosina (4), Asparagina (4), Acido Glutmico (4), Acido Asprtico (4), Glutamina (4), Cistena (4), Lisina (4), Histidina (4), Punto final (5), (Formil)metionina (5), Prolina (8), Valina (8), Glicina (8), Alanina (8), Treonina (8), Isoleucina (8), Leucina (12), Serina (12) y Arginina (12). Total 136 cartas. - Tabla de cdigo gentico
Fig. 1. Tabla de cdigo gentico. PROCEDIMIENTO a. Formacin de la cadena de ADN molde. (Baraja I)
- Usando la baraja I realizaremos la formacin de la cadena de ADN que ser usada como molde la cual crecer en sentido 3 5. - Retirar las ARN pol (ARN polimerasa) de la baraja I. - Repartir 25 cartas a cada uno de los dos equipos. - Cada equipo formar su propia cadena de ADN molde. - Comenzar el equipo que tenga ADN pol y deber formar su cadena con 8 tripletes de bases nitrogenadas, el ltimo de esos tripletes debe contener la formacin de ATT, ATC o ACT. - Cada equipo durante el juego debe tener 25 cartas incluyendo las que tienen en la mano y las de la mesa. Sino poseen las carta que necesitas cogern del maso y esperararn su turno. - La ADNasa hidroliza totalmente el ADN, y la Ligasa une nucletidos y neutraliza la accin de la ADNasa. - El equipo que tenga la carta ADNasa puede emplearla en cualquier momento antes que sus contrincantes coloquen en la mesa el triplete final, destruyendo as la cadena que estn formando. Si fuera as, todas las cartas colocadas en la mesa vuelven directamente al mazo y el equipo contrincante deber tener 25 cartas en la mano y nuevamente buscar la ADN polimerasa. - Si a un grupo se le muestra la carta ADNasa, pero posean una carta Ligasa, su cadena queda protegida y continuar el juego. Las dos cartas ADNasa y Ligasa que fueron utilizadas regresan al mazo pero deben ser sustituidas para de esa manera mantener el nmero de naipes en la mano. - Gana el que complete la cadena. - Luego anotar la secuencia del equipo contrincante adems de la propia.
b. Sntesis del ARN (Baraja I)
- Cada equipo debe construir primero en un papel la molcula de ARN formada a partir de la cadena molde formado en el juego anterior. - Barajar nuevamente las cartas, eliminando previamente las cartas ADNasa, Ligasa y ADNpol, colocando en su lugar las de ARNpol. - Se reparten 25 cartas por equipo y se procede igual que para la sntesis del ADN, pero empleando como molde el ADN patrn sintetizado. - Inicia el equipo que tiene la ARNpol. - Su secuencia comienza con AUG y culminar en UGA, UAA o UAG. - Si un equipo no tiene la base correcta para formar cualquiera de sus tripletes, botar una carta y robar otra en cada turno hasta obtenerla.
c. Sntesis de protenas (Baraja II)
- Luego de formar la cadena de ARN utilizar la tabla del cdigo gentico para realizar la traduccin de los codones del ARN y as formar una secuencia de 8 aminocidos. - Mezclar las cartas y se distribuir ocho por equipo. - Inicia el equipo que tenga Formilmetionina (como ocurre durante la sntesis de protenas en los procariotes), y que el codn terminador codifica la carta que dice Punto final. - Construir exactamente la cadena de aminocidos que se ha construido en el papel. Ganar el que tenga mayor puntaje.
RESULTADOS a. Equipo I. La cadena de ADN molde inici con ADNpol y la de ARNm con ARNpol
b. Equipo II La cadena de ADN molde inici con ADNpol y la de ARNm con ARNpol
DISCUSIONES Previamente a sintetizar las cadenas de ADN molde y ARNm se inici con las cartas de ADNpol y ARNpol respectivamente esto es por que las ADN polimerasas son enzimas polimerasas (celulares o virales) que intervienen en el proceso de replicacin del ADN. Llevan a cabo la sntesis de la nueva cadena de ADN. Por otro lado, las ARN-polimerasas son un conjunto de enzimas capaces de formar los ribonucletidos para sintetizar ARN a partir de una secuencia de ADN que sirve como patrn o molde. La ARN polimerasa ms importante es la implicada en la sntesis del ARN mensajero o transcripcin del ADN. (Teijon, et al. 2006)
En la formacin del ADN molde de ambos resultados se construy en direccin 3 5 por lo cual el ARNm que se form a partir de estas cadenas est en direccin 5 3, lo cual concuerda con Merino y Noriega (2004) quienes sealan que en la sntesis de ADN y ARN se requiere una cadena complementaria para usarla como molde, la cual ser utilizada en la sntesis en la direccin 3 5. Durante la sntesis del ADN molde se pudieron usar las cartas de ADNasa para interrumpir y romper la secuencia, pues esta tiene una gran actividad enzimtica que puede despolimeralizar al ADN y la ligasa para proteger mi secuencia y continuar formando mi ADN molde pues es una enzima que sirve para unir fragmentos de ADN. (Macfaddin, 2003) En las cadenas de ARNm formadas a partir de su ADN molde respectivo est en direccin 5 3 lo cual est relacionado con lo que postula Lewin (1993) quien dice que el ARN mensajero es sintetizado sobre un molde de ADN por el proceso de transcripcin. Solo se transcribe una cadena de ADN. El emparejamiento de bases sirve para sintetizar una cadena de ARN complementaria de la cadena de ADN. Por tanto, la secuencia del ARN es idntica a la otra cadena de ADN (la que no sirve para molde). Por tanto la cadena de ARN en formacin queda situada en direccin antiparalela a la cadena molde de ADN. Las bases nitrogenadas generan puentes de hidrgeno entre s de una manera selectiva. Adems nos damos cuenta de la complementariedad de las bases nitrogenadas en la formacin de las cadenas en las cuales si en una cadena hay adenina en la otra timina (uracilo si es ARN), mientras que si en una cadena hay guanina en la otra hay citosina. Ambas cadenas deben ser complementarias y antiparalelas, por otro lado el contenido de guaninas debe ser exactamente igual al contenido de citosinas, y lo mismo debe decirse del contenido de adeninas y timinas. (Lewin, 1993) En la sntesis de ARNm en ambos resultados la secuencia comienza con AUG que sintetizar al aminocido metionina en la sntesis de protena y culmina con UAG y UAA adems tambin pudo culminar con UAG, tripletes representan a los codones Stop o tripletes de terminacin. (Merino & Noriega, 2004) Para la sntesis de protenas tenemos que en todas las clulas vivas, el ARN m sirve para el mismo propsito ser traducido a protenas mediante el cdigo gnetico. Por tanto, existe una correspondencia de tres nucletidos (codn) por cada aminocido de la protena. Un codn especficamente permite colocar en la cadena un aminocido en particular. En total en el cdigo gentico hay 64 codones, de los cuales61 llevan informacin para aminocidos, uno de ellos es el codn AUG que lleva especficamente informacin para el aminocido metionina, con el cual se inicia la sntesis de protena, mientras que los otros 3 (codones STOP o sin sentido UAG, UGA o UAA,) no son reconocidos por ningn ARNt y sirven como seal para terminar la traduccin. (Lewin, 1993) CONCLUSIONES - La ADN polimerasa sirve para la formacin del ADN molde y la ARN polimerasa interviene n la formacin del ARN mensajero. - EL ADN molde en direccin 3 5 sirve para la formacin del ARNm que estar de 53 en un proceso denominado transcripcin. - La ADN asa es una enzima que despolimeraliza el ADN y la ligasa es una enzima que une fragmentos de ADN. - Las cadenas formadas deben ser complementarias y antiparalelas. - En la sntesis de ADN la adenina se une con la timina (uracilo en ARN) y la citosina con la guanina. - En la sntesis de ADN y ARN La cantidad de adenina es igual a la timina (uracilo en ARN) y la cantidad de citosina es igual a la de guanina. - La secuencia de ARN m inicia con el codn AUG que se traduce en el aminocido metionina y culmina con UGA, UAA o UAG que representan los codones STOP y sealan el trmino de la traduccin de protenas
BIBLIOGRAFIA 1. Albert L. Lenhinger (2001): PRINCIPIOS DE BIOQUIMICA, Ediciones omega S.A., Barcelona, Espaa. 2. Curtis- Barnes (1994): BIOLOGIA. Editorial Mdica Panamericana, 16 edicin, Mxico, DF. 3. Lewin, B (1993): GENES. Reverte. 2 edicin. Espaa. 4. MacFaddin, J. (2003): PRUEBAS BIOQUMICAS PARA LA IDENTIFICACIN DE BACTERIAS DE IMPORTANCIA CLNICA. Ed. Mdica Panamericana. Espaa 5. Merino, J. & Noriega, M. (2004): FISIOLOGA GENERAL. Universidad de Cantabria. Espaa. 6. Murray, R. Et al (1997): BIOQUIMICA DE HARPER; Editorial El Manual Moderno. Mxico. 7. Teijon, et al (2006): FUDAMENTOS DE BIOQUMICA METABLICA, Editorial Tebar. Espaa.
CUESTIONARIO 1. Por qu se ha hecho diferente nmero de cartas para los aminocidos? Existe alguna sustentacin biolgica? Se elabor diferente nmero de cartas para los aminocidos, pues se intent poner la cantidad de aminocidos en proporcin a la correspondiente al cdigo gentico. El cdigo gentico es el conjunto de reglas que define la traduccin de una secuencia de nucletidos en el ARN a una secuencia de aminocidos en una protena, en todos los seres vivos. El cdigo define la relacin entre secuencias de tres nucletidos, llamadas codones, y aminocidos. De ese modo, cada codn se corresponde con un aminocido especfico. Se han descifrado los 64 codones (tripletes de nucletidos) de los cuales 61 se traducen en 20 aminocidos Metionina (1), Triptofano (1), Fenilalanina (2), Tirosina (4), Asparagina (2), Acido Glutmico (2), Acido Asprtico (2), Glutamina (2), Cistena (2), Lisina (2), Histidina (2), Prolina (4), Valina (4), Glicina (4), Alanina (4), Treonina (4), Isoleucina (3), Leucina (6), Serina (6) y Arginina (6) y 3 nos dan los tripletes de terminacin o codones Stop. 2. Qu significado tienen los tripletes de terminacin? En gentica se denomina codn de terminacin, codn de parada, codn sin sentido o codn stop a aquel codn que no determina en el cdigo gentico aminocido alguno. Su funcin es acotar el mensaje cifrado por el ADN que dar lugar al ARN mensajero; de este modo, limita en el extremo 3' el marco abierto de lectura de los genes. Los codones UAA, UAG y UGA son seales de paro que no especifican ningn aminocido y se conocen como codones de terminacin; determinan el final de la sntesis proteica. 3. Qu funciones cumplen la ADN pol y la ARN pol? La ADN polimerasa es la principal enzima de la replicacin. Partiendo de una cadena inicial o primer la ADN polimerasa aade nucletidos complementarios a la cadena molde extendiendo la nueva cadena de ADN en direccin 5- 3. La ADN polimerasa es capaz de aadir nucletidos complementarios a la cadena molde estableciendo enlaces fosfodister. La ADN polimerasa slo puede catalizar el crecimiento de la cadena inicial en direccin 5'-3'. La ADN polimerasa tambin se encarga de la reparacin del ADN asociada a la replicacin. Las ARN-polimerasa o ARN-polimerizado (ARNP) son un conjunto de protenas con carcter enzimtico capaces de formar los ribonucletidos para sintetizar ARN a partir de una secuencia de ADN que sirve como patrn o molde. La ARN polimerasa ms importante es la implicada en la sntesis del ARN mensajero o transcripcin del ADN. La reaccin qumica que cataliza la ARN polimerasa consiste en la unin de ribonucletidos trifosfato, adenosn trifosfato (ATP), uridn trifosfato (UTP), guanosin trifosfato (GTP) y citidn trifosfato (CTP), liberndose los grupos fosfato y convirtindose estos en nucletidos. Adems de la polimerizacin de los ribonucletidos trifosfato, la ARN polimerasa tiene otras funciones como: Reconocer y unirse a localizaciones especficas o promotores de la molcula de ARN. Desenrollar parcialmente la molcula del molde de ADN, gracias a su actividad helicasa intrnseca. Sintetizar un ARN cebador para la elongacin posterior. Terminacin de la cadena. La ARN polimerasa cataliza consecutivamente la elongacin de la cadena de ARN, al mismo tiempo que enrolla y desenrolla la doble cadena de ADN, y termina la transcripcin despus de copiar el gen. 4. Si en el ADN el porcentaje de Adenina es de 20%, Cul es el porcentaje de citosina? Supongamos que todo es un 100% si tenemos 20% de Adenina la cual su base complementaria sera Timina con un 20% igual, pero para completar el total (100%) faltara 60% lo cual seria 30% de Citosina y 30% de Guanina. Pues el ADn est formado por Adenina (A), Citosina (C), Timina (T) y Guanina (G).
5. Explique el proceso de sntesis de protenas. Se conoce como sntesis de protenas al proceso por el cual se componen nuevas protenas a partir de los veinte aminocidos esenciales. En este proceso, se transcribe el ADN en ARN. La sntesis de protenas se realiza en los ribosomas situados en el citoplasma celular. En el proceso de sntesis, los aminocidos son transportados por ARN de transferencia correspondiente para cada aminocido hasta el ARN mensajero donde se unen en la posicin adecuada para formar las nuevas protenas. Al finalizar la sntesis de una protena, se libera el ARN mensajero y puede volver a ser ledo, incluso antes de que la sntesis de una protena termine, ya puede comenzar la siguiente, por lo cual, el mismo ARN mensajero puede utilizarse por varios ribosomas al mismo tiempo. Fases de las sntesis de protenas La realizacin de la biosntesis de las protenas, se divide en las siguientes fases: Fase de activacin de los aminocidos. Fase de traduccin que comprende: Inicio de la sntesis proteica. Elongacin de la cadena polipeptdica. Finalizacin de la sntesis de protenas. Asociacin de cadenas polipeptdicas y, en algunos casos, grupos prostsicos para la constitucin de las protenas. Fase de activacin de los aminocidos Mediante la enzima aminoacil-ARNt-sintetasa y de ATP, los aminocidos pueden unirse ARN especfico de transferencia, dando lugar a un aminoacil-ARNt. En este proceso se libera AMP y fosfato y tras l, se libera la enzima, que vuelve a actuar. Inicio de la sntesis proteica En esta primera etapa de sntesis de protenas, el ARN se une a la subunidad menor de los ribosomas, a los que se asocia el aminoacil-ARNt. A este grupo, se une la subunidad ribosmica mayor, con lo que se forma el complejo activo o ribosomal. Elongacin de la cadena polipeptdica El complejo ribosomal tiene dos centros o puntos de unin. El centro P o centro peptidil y el centro A. El radical amino del aminocido inciado y el radical carboxilo anterior se unen mediante un enlace peptdico y se cataliza esta unin mediante la enzima peptidil-transferasa. De esta forma, el centro P se ocupa por un ARNt carente de aminocido. Seguidamente se libera el ARNt del ribosoma producindose la translocacin ribosomal y quedando el dipeptil-ARNt en el centro P. Al finalizar el tercer codn, el tercer aminoacil-ARNt se sita en el centro A. A continuacin se forma el tripptido A y despus el ribosoma procede a su segunda translocacin. Este proceso puede repetirse muchas veces y depende del nmero de aminocidos que intervienen en la sntesis. Finalizacin de la sntesis de protenas. En la finalizacin de la sntesis de protenas, aparecen los llamados tripletes sin sentido, tambin conocidos como codones stop. Estos tripletes son tres: UGA, UAG y UAA. No existe ARNt tal que su anticodn sea complementario. Por ello, la sntesis se interrumpe y esto indica que la cadena polipeptdica ha finalizado.