Microbiologia ambiental

Engenharia do Ambiente
Escola Superior Agrria
Instituto Politcnico de Coimbra
abelho@esac.pt
www.esac.pt/abelho
2.5 COMUNIDADE MICROBIANA DA
GUA
Mdulo 1.Ecologia microbiana
Parte 2. Ecologia microbiana
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 2
Conceitos 1
Em comparao com a taxa de difuso no ar,
o oxignio difunde-se na gua a uma taxa
lenta; esta caracterstica uma das mais
importantes na definio das caractersticas
da gua como um ambiente para o
crescimento e o funcionamento microbiano

Depois de dissolvido na gua, o oxignio
pode ser mais rapidamente usado pelos
microrganismos do que a taxa a que
reposto: criao de zonas anaerbias

Se a luz penetrar nessas zonas anaerbias,
podem desenvolver-se grupos especficos
de microrganismos fotossintticos

Tambm podem desenvolver-se
comunidades microbianas especializadas na
interface entre regies anaerbias e
aerbias
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 3
Conceitos 2
Os ambientes aquticos, tanto
marinhos como de gua doce,
incluem grandes volumes de
gua fria e de gelo

Para alm da gua doce
armazenada nos glaciares e nas
regies polares, o gelo marinho
cobre aproximadamente 7% da
superfcie da Terra

A gua fria (2-3%) e as guas de
elevadas presses dos oceanos
so locais importantes para a
sobrevivncia e o
funcionamento microbianos
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 4
Conceitos 3
Os ambientes aquticos permitem o
desenvolvimento de muitos tipos nicos
de microrganismos, incluindo
microrganismos das nascentes
hidrotermais dos fundos dos oceanos

Outros microrganismos fazem a ligao
entre recursos espacialmente
separados, como nitrato e sulfato

Continuam hoje a ser descobertos
novos microrganismos nos ambientes
aquticos

Os ciclos biogeoqumicos do carbono,
do azoto, do enxofre e dos fsforo dos
lagos e dos ambientes marinhos
envolvem interaces locais e atravs de
vastas distncias
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 5
Conceitos 4
O fitoplncton (organismos
fotossintticos procariotas e eucariotas)
forma a base da produo primria na
maioria dos ambientes marinhos e de
gua doce

O fitoplncton liberta matria orgnica
dissolvida e particulada que usada
pelos microrganismos heterotrficos

Parte do fitoplncton consumida pelos
predadores, libertando nutrientes que
so reciclados e novamente usados pelo
fitoplncton (loop microbiano)

O ferro e o azoto podem limitar a
actividade do loop microbiano em
diferentes ambientes marinhos
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 6
Conceitos 5
So constantemente adicionados
gua microrganismos
patognicos e matria orgnica
que podem ser transportados ao
longo de grandes distncias,
principalmente em rios, lagos e
oceanos

As poeiras atmosfricas e outros
materiais como poluentes,
podem ser transportados a
regies longnquas dos oceanos,
dos corpos de gua doce e das
regies cobertas de gelo

Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 7
Conceitos 6
Muitos patognicos humanos, como Shigella,
Vibrio e Legionella, encontram-se na gua

Uns ocorrem normalmente e outros podem
sobreviver durante perodos de tempo variveis
depois de serem adicionados gua

Por serem seus predadores, os protozorios
providenciam muitas vezes proteco para estes
patognicos, principalmente quando esto
associados em biofilmes

Os ambientes aquticos so reservatrios e
vectores de transmisso de microrganismos
patognicos.

Um dos objectivos da gesto dos ecossistemas
aquticos o controlo da sobrevivncia e da
transferncia de microrganismos patognicos
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 8
Conceitos 7
A gua um reservatrio importante
para a sobrevivncia e para a
disseminao de protozorios e de
vrus, que no so controlados pela
adio de cloro gua

Protozorios patognicos incluem
Cryptosporidium, Cyclospora e Giardia

A gua subterrnea uma fonte
importante de gua potvel,
principalmente em zonas suburbanas e
rurais

Em muitos casos, este recurso est
contaminado por microrganismos
patognicos e por nutrientes, derivados
principalmente de fossas spticas
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 9
Diversidade de habitats
Ambientes aquticos
diversos:
corpo humano,
bebidas,
rios,
lagos,
oceanos,
zonas saturadas dos solos,
desde alcalinos a
extremamente cidos

Temperaturas nas quais os
microrganismos funcionam:
-5C a mais de 121C
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 10
Diversidade de habitats
Alguns dos microrganismos mais intrigantes existem em
ambientes de temperaturas elevadas
Gisers :
termfilo Thermus aquaticus)
Nascentes hidrotermais ocenicas:
hipertermfilo Pyrolobus fumarii
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 11
Principais factores que controlam as
comunidades microbianas dos
ambientes aquticos
mistura e movimento de nutrientes, O
2

e produtos de excreo

Nos lagos e nos oceanos, a matria
orgnica proveniente da superfcie
afunda-se, criando zonas ricas em
nutrientes onde ocorre decomposio

Os gases e os produtos solveis
produzidos por esses microrganismos
nas zonas profundas podem difundir-se
para as camadas superiores
estimulando a actividade de outros
microrganismos
Um objectivo da
microbiologia o
isolamento e a cultura de
microrganismos marinhos
nicos, principalmente na
busca de microrganismos
que produzam antibiticos
(ver diapositivo seguinte)

Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 12
Novos agentes em
medicina
A maior parte dos antibiticos correntes:
derivam de microrganismos do solo,
principalmente ascomicetes, mas tambm de
outros fungos e de bactrias Gram-positivas

Mais de 100 produtos so hoje usados como
antibiticos, agentes anti-tumorais e agro-
qumicos

Alguns dos mais recentes agentes qumicos so
metabolitos de microalgas marinhas

Tambm existe muito interesse na cultura de
microrganismos marinhos simbiticos com
hospedeiros macroscpicos

Os microrganismos marinhos podem
providenciar compostos bioactivos que no
ocorrem nos microrganismos terrestres
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 13
Prochloron sp., um microrganismo unicelular marinho simbitico com ascdias (tunicados
marinhos). Descoberto em 1976. Contm clorofila a e b e carotenides
Os gases e os
microrganismos
aquticos
A distncia ( escala microbiana) at uma
bolha de ar ou at superfcie limita a
difuso de oxignio na gua
Os ambientes aquticos tm baixa difuso
de oxignio (1/10000 da taxa de difuso
numa fase gasosa)
Na figura seguinte, as setas largas
representam o fluxo rpido de oxignio
atravs do ar; a diminuio da intensidade
da cor azul representa a diminuio da
concentrao de oxignio
Depois de penetrar na gua o oxignio
difunde-se lentamente (seta castanha
mais estreita) e a sua concentrao vai
diminuindo at ser finalmente utilizado
por um microrganismo
De acordo com a figura, a concentrao
de oxignio disponvel para uma enzima
pode ser apenas 1/1000 da concentrao
atmosfrica de oxignio
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 14
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 15
D
i
f
u
s

o

d
o

o
x
i
g

n
i
o

n
a

g
u
a

100 000

10 000

1 000

100

10

1

0.1
C
o
n
c
e
n
t
r
a

o

d
e

o
x
i
g

n
i
o

e
m

p
p
m


(
e
s
c
a
l
a

l
o
g
a
r

t
m
i
c
a
)

Taxas de difuso e barreiras difuso do oxignio
Meio lquido
Interface da bolha
de ar (barreira)
Ar gua
Meio lquido
Bolha
de ar
Microrganismo
Enzima
respiratria
Clula
Clula microbiana
(barreira)
Concentrao na
superfcie da enzima
Efeito da temperatura da gua e da altitude na
concentrao de O
2
dissolvido (mg/litro)
Elevao acima do nvel do mar (metros)
Temperatura (C) 0 1000 2000 3000
0 14.6 12.9 11.4 10.2
5 12.8 11.2 9.9 8.9
10 11.3 9.9 8.8 7.9
15 10.0 8.9 7.9 7.1
25 9.1 8.1 7.1 6.4
20 8.2 7.3 6.4 5.8
35 7.5 6.6 5.9 5.3
40 6.9 6.1 5.4 4.9
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 16
Solubilidade do oxignio diminui com o aumento da temperatura e com a diminuio da
presso: formao de zonas hipxicas ou anxicas nos ambientes aquticos, surgindo
microrganismos quimiotrficos e fototrficos especializados
O CO
2
dissolvido
Importante em processos qumicos e
biolgicos

O sistema tampo do bicarbonato (figura
seguinte) mantm o equilbrio entre o
dixido de carbono, o bicarbonato e o
carbonato, que controlam o pH da gua

O pH da gua destilada (no tamponada)
determinado pelo CO
2
dissolvido em
equilbrio com o ar e aproximadamente
5.0-5.5

A gua tamponada a pH 8.0 contm CO
2

absorvido do ar, principalmente sob a forma
de bicarbonato (HCO
3
-
)

Quando os microrganismos autotrficos
como as algas usam o CO
2
da gua, o seu pH
geralmente aumenta
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 17
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 18
R
e
l
a

o

e
n
t
r
e

p
H

e

C
O
2

d
i
s
s
o
l
v
i
d
o

100


80


60


40


20


0
5.0 6.0 7.0 8.0 9.0 10.0
pH
P
e
r
c
e
n
t
a
g
e
m

d
o

c
a
r
b
o
n
o

t
o
t
a
l

Bicarbonato
(HCO
3
-
)
Carbonato
(CO
3
2-
)

CO
2
dissolvido
Os gases atmosfricos afectam as caractersticas fsicas da gua. O pH da
gua influenciado pela quantidade de CO
2
na gua e tambm pelo
equilbrio entre o CO
2
dissolvido e os ies bicarbonato e carbonato
Nutrientes nos ambientes
aquticos
Concentrao muito varivel;
muitos nutrientes nos ambientes
poludos e nos esgotos

Taxa de reciclagem muito
varivel; nos ambientes
marinhos pode demorar
centenas a milhares de anos, nos
pauis, sapais e esturios a taxa
rpida

Uma das formas de ilustrar os
gradientes de nutrientes e a sua
explorao por diferentes
microrganismos a coluna de
Winogradsky
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 19
A coluna de Winogradsky
Microcosmos no qual os
microrganismos e os nutrientes
interagem num gradiente
vertical de condies

Os produtos da fermentao e
sulfito sobem a partir da zona de
reduo inferior (condies
semelhantes aos sedimentos
ricos em nutrientes dos lagos)

A luz permite o crescimento de
microrganismos fotossintticos,
tanto aerbios (zona superior)
como anaerbios (zona inferior)
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 20
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 21
A coluna de Winogradsky
Lama
Lama +
enxofre,
carbonato
e fonte de
celulose
Diatomceas e cianobactrias (fotoautotrficos)



Algas e microrganismos aerbios que oxidam
sulfato: Beggiatoa, Thiobacillus, Thiothrix. Usam
compostos reduzidos de enxofre como fonte de e
-
e
O
2
como aceitador

Fotoheterotrficos: bactrias prpuras no
sulfurosas Rhodospirilum, Rhodopseudomonas.
Usam MO como fonte de e
-
sob condies
anaerbias


Chromatium
usam sulfito de hidrognio como dador
de e
-
e CO
2
como fonte de C
Chlorobium

Clostridium (celulose produtos de fermentao)
Desulfovibrio (produtos de fermentao+sulfato sulfito)
Camada de gua
Camada de lama com O
2

(castanho-claro)













Zona anaerbia com H
2
S (preta)
Zona cor de
ferrugem
Zona
vermelha
Zona
verde
Difuso de H
2
S
Ciclos de nutrientes
nos ambientes
aquticos
Fotossntese, principalmente
fitoplncton = principal fonte de MO nas
superfcies iluminadas
E.g. cianobactria Synechococcus sp.:
pode atingir densidades de 10
4
-10
5

clulas/ml
Picocianobactrias podem representar
20-80% da biomassa de fitoplncton

Para crescer o fitoplncton necessita de
N e de P

A composio da gua em nutrientes
afecta a razo C:N:P das clulas
106C:16N:1P = razo de Redfield=razo
ptima para o crescimento dos
organismos foto-autotrficos
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 22
MO fixada pelo fitoplncton
entra no loop microbiano, onde
reciclada em CO
2
e minerais

MO dissolvida libertada pelo
fitoplncton usada pelos
microrganismos heterotrficos
tornando-se parte da MO
particulada

Organismos heterotrficos
consumidos por predadores
(protozorios e metazorios)
libertando CO
2
e minerais


Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 23
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 24
O loop microbiano (setas amarelas)
Consumi-
dores
Zooplncton
Protozorios
Bactrias
Fitoplncton
CO
2
e
minerais
Azoto (N)
Fsforo (P)
DOM
POM
Grande parte da MO sintetizada na fotossntese pelo fitoplncton libertada como MO dissolvida (DOM). DOM
usada pelas bactrias tornando-se POM. Bactrias consumidas pelos protozorios; aps digesto os nutrientes das
bactrias e dos protozorios so mineralizados e voltam ao fitoplncton (loop)
Comunidades microbianas
aquticas
Diversidade elevada

Adaptaes especiais a
ambientes aquticos
particulares

Enorme abundncia de
ultramicrobactrias/
nanobactrias (<0.2mm):
dominantes nos ecossistemas
marinhos, podem atingir 10
12
-
10
13
clulas/ml;
e.g. Sphingomonas sp.
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 25
Sphingomonas sp.
A maior bactria conhecida
Thiomargarita namibiensis
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 26
Dimetro 100-300 mm
Usa sulfito como fonte
de energia e nitrato
como aceitador de e
-
Acumula nitrato num
enorme vacolo
interno (pode ocupar
98% do seu volume e
atingir concentraes
de 800mM)
Tem grnulos de
enxofre na camada de
citoplasma
A bactria esparguete
Adaptao: capacidade de ligar e
usar recursos que se encontram
espacialmente separados
Na costa do Chile onde gua pobre
em O
2
mas rica em nitrato est em
contacto com sedimentos ricos em
sulfito
Clulas 15-40 mm largura e muitos
cm comprimento (da o nome
esparguete)
Formam estruturas filamentosas na
superfcie e no interior dos
sedimentos
Usam o sulfito dos sedimentos
anaerbios e o nitrato da coluna de
gua aerbia
Constituem a maior comunidade
de bactrias visveis a olho nu
Thioploca sp.
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 27
Thioploca sp.
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 28
Grnulos de
enxofre
Os fungos aquticos
Oomicetes (bolores aquticos)
Esporos assexuados mveis com 2
flagelos

Quitrdeos
Esporos assexuados mveis com 1
flagelo
Decomposio da MO; agentes
patognicos e parasitas (e.g.
Batrachochytrium dendrobatidis infecta
a pele dos anfbios, causando a sua
morte)

Hifomicetes aquticos (Filo Deuteromycota)
Esporulam dentro de guacondeos em
forma tetra-radiada ou de S
transportados na gua; ao contactar
com uma folha, colam-se e comeam a
crescer formando miclio que penetra
na folha e promove a sua decomposio
Decomposio da matria orgnica

Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 29
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 30
O
s

h
i
f
o
m
i
c
e
t
e
s

a
q
u

t
i
c
o
s

A diatomcea Pseudonitzschia (responsvel pelas mars
vermelhas)
http://wdfw.wa.gov/science/articles/razor_clams/index.html
Os microrganismos como problema ambiental
Mars vermelhas:
devidas a
crescimento
exagerado de algas
(e.g. Pseudonitzschia)
podem levar morte
dos consumidores
por causa de
neurotoxinas
Impactos negativos
na economia porque
no se podem
apanhar bivalves
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 31
Os microrganismos como problema ambiental
Pfiesteria piscicida: dinoflagelado que provoca a morte dos
peixes
Nos humanos pode causar perda de memria

Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 32
Dinoflagelados: grupo de
protistas com flagelos
http://pt.wikipedia.org/wik
i/Dinoflagelado
Os ambientes de gua
doce: lagos
Nos lagos criam-se
gradientes verticais porque
existe pouca mistura da
gua

Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 33
O aquecimento diferencial da coluna de gua cria diferenas na
temperatura que resultam na formao de camadas de gua com
diferentes densidades:
Epilimnion
Metalimnion (termoclino)
Hipolimnion
Eutrofizao
Lagos oligotrficos
Contm muito poucos nutrientes
dissolvidos e baixa populao
microbiana
Saturados em oxignio

Lagos eutrficos
Contm muitos nutrientes
dissolvidos
Apenas a zona superior est
saturada em O
2
(fotossntese)
A zona inferior (sedimentos) e o
hipolimnion tm carga elevada de
matria orgnica e podem ser
anaerbios, com o desenvolvimento
de microrganismos sulfurosos
fotossintticos como Chromatium e
Chlorobium
Quando adicionada
gua carga de nutrientes
(N e P) ocorre
crescimento pronunciado
de plantas, algas e bactrias
A morte e a decomposio
desta grande quantidade de
MO pode levar anxia
nestes lagos


Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 34
Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 35
Variao sazonal
do perfil de
oxignio dissolvido
nos lagos
oligotrficos e
eutrficos
Nos lagos
oligotrficos
depende apenas
da temperatura
Nos lagos
eutrficos est
relacionada com
a carga de
matria orgnica

Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 36
As cianobactrias
Pode ocorrer eutrofizao mesmo sem
adio de azoto, apenas com adio de
fsforo

Vantagens competitivas em relao s algas
No necessitam de azoto

Funcionam mais eficientemente sob
condies de pH elevado (8.5-9.5) e de
temperatura alta (30-35C)

Usam CO
2
a taxas elevadas, aumentando o
pH da gua e tornando-a pouco propcia ao
desenvolvimento das algas

Muitas espcies produzem toxinas, sendo
menos consumidas que as algas; as toxinas
causam grandes problemas ambientais e de
sade pblica na eutrofizao por
cianobactrias
Papel importante na
acumulao de nutrientes
mesmo na ausncia de
azoto porque muitos
gneros fixam azoto
atmosfrico
Anabaena, Nostoc,
Cylindrospermum fixam
azoto sob condies
aerbias
Oscillatoria fixa azoto sob
condies anaerbias

Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 37
Rios e ribeiros 1
Existem gradientes longitudinais (i.e., de
distncia) e temporais

Existncia de corrente: maior parte dos
microrganismos aderentes s superfcies
expostas; apenas nos rios grandes (coluna
de gua profunda e corrente lenta) existem
microrganismos em suspenso

Fontes de nutrientes:
(1) Produo interna (autctone) por
microrganismos fotossintticos aquticos
(2) Fonte externa (alctone) atravs de
escorrncias terrestres ou das folhas e de
outros detritos produzidos na zona ripcola

MO metabolizada por microrganismos
quimio-organotrficos, providenciando
energia para as cadeias alimentares

Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 38
Rios e ribeiros 2
Normalmente a quantidade de MO que
entra no sistema no excede a sua
capacidade de a oxidar: os rios possuem
uma enorme capacidade para processar
a MO

Mas podem tambm tornar-se
anaerbios sob condies extremas

Carga de esgotos (carga de MO) no
tratados = poluio pontual: produz
alteraes previsveis na comunidade
microbiana e na concentrao de O
2

(curva sag de oxignio dissolvido)

Carga de nutrientes provenientes dos
fertilizantes usados na agricultura =
poluio difusa

Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 39
A curva sag do oxignio
dissolvido
Os microrganismos e as suas
actividades podem criar
gradientes espaciais e gradientes
temporais, quando existe carga
de nutrientes nos rios.

A curva sag do oxignio dissolvido
ocorre quando existe carga de
matria orgnica num rio limpo.

Durante os estdios mais tardios
da auto-depurao, a
comunidade fotoautotrfica
torna-se novamente dominante
http://www.rpi.edu/dept/chem-
eng/Biotech-
Environ/AERATION/sag.html
http://www.egr.msu.edu/classes/ce2
80/voice/do/doSagCurve.html
http://www.ce.utexas.edu/prof/maid
ment/GISHydro/ferdi/webedu/webd
osag/webdosag.html

Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 40
A curva SAG do oxignio
dissolvido
Carga de MO

Crescimento dos
organismos
heterotrficos
(decompositores)

Libertao de matria
mineral

Crescimento dos
organismos
fotoautotrficos

Manuela Abelho 2012 Microbiologia ambiental 41
http://www.mp-
docker.demon.co.uk/environmental_chemistry/topic_4a/page_
6.html