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ENTROBACTRIES

La famille des Enterobacteriaceae comprend de nombreux genres bactriens rpondant la dfinition suivante :
Bacilles Gram ngatif
aro-anarobies
mobiles ou immobiles
facilement cultivables
fermentant le glucose
rduisant les nitrates en nitrites
dpourvus d'oxydase
La famille certains comprend 130 espces actuellement rpertories. Les espces les plus communment isoles en bactriologie
clinique appartiennent aux genres Citrobacter, Enterobacter, Escherichia, Hafnia, Klebsiella, Morganella, Proteus,
Providencia, Salmonella Serratia, Shigella, Yersinia.
MORPHOLOGIE
Ce sont des bacilles Gram ngatif de 2 3 micromtres de long sur 0,6 de large.
Les Proteus sont trs polymorphes : formes longues et filamenteuses ou petits bacilles droits (Prote est un dieu de la mythologie
grecque qui changeait de forme volont).
Les espces mobiles - les plus nombreuses - le sont grce une ciliature pritriche.
Certaines sont immobiles (Klebsiella, Shigella, Yersinia pestis).
Les Klebsiella sont capsules.
La plupart des espces pathognes pour l'homme possdent des fimbriae ou pili communs qui sont des facteurs d'adhsion.
CULTURE
Les entrobactries se dveloppent rapidement in vitro sur des milieux "ordinaires". La temprature optimale de croissance est
37C mais la culture est possible entre 20 et 40C. Leur temps de division varie de 20 40 minutes.
Sur glose, les colonies sont lisses et rgulires et atteignent 2 millimtres de large sauf celles des Yersinia qui sont plus petites.
Les Proteus ont tendance envahir la glose et y former un tapis uniforme. Les Klebsiella forment des colonies souvent ts
muqueuses, larges, grasses et luisantes.
En milieu liquide, les entrobactries occasionnent un trouble uniforme du bouillon.
CARACTRES BIOCHIMIQUES
Les proprits qui dfinissent la famille doivent tre mises en vidence pour affirmer que la souche est une entrobactrie.
Les caractres d'identification sont essentiellement "biochimiques" et utilisent des tests qui tudient le mtabolisme protique
(prsence d'urase, production d'indole, dgradation du tryptophane) ou la fermentation des sucres (glucose, lactose, saccharose
etc..), la capacit d'utiliser le citrate, la prsence d'enzymes (dcarboxylases, dsaminases), la production d'hydrogne sulfur ou
la formation de gaz.
Le tableau ci dessous rsume les caractres d'identification des genres le plus frquemment rencontrs :


Escherichi
a
Citrobacte
r
Enterobacte
r
Klebsiell
a
Serrati
a
Salmonell
a
Shigell
a
Proteu
s
Providenci
a
Yersini
a
Gluc
+
+ + + + + + + + +
Lact + + + + - - - - - -
ONPG + + + + + - +/- - - +
Indole + - - +/- - - +/- +/- + +/-
VP
(Actone
)
- - + + + - - - - + *
Citr - + + + + +/- - +/- + -
Mob. + + + - + + - + + + *
Ure - - - + - - - + - +
PDA - - - - - - - + + -
H2S - +/- - - - + - +/- - -
* 20C seulement
LA PAROI DES ENTROBACTRIES
Les entrobactries sont des bacilles Gram ngatif et possdent donc une paroi dont la structure en trois couches est particulire
ces bactries. Cette paroi est constitue de l'extrieur vers l'intrieur : d'une membrane externe, d'une couche mince de
peptidoglycane et d'un espace priplasmique qui entoure la membrane cytoplasmique.
La membrane externe protge les entrobactries de l'action des sels biliaires et des ferments digestifs. Elle est constitue d'une
double couche lipidique dans laquelle sont inclus des molcules de lipopolysaccharide (LPS) qui comprend 3 parties :
. le lipide A qui est l'endotoxine
. le core central, polysaccharide de base (constituant l'antigne R) ECBU
. les polyosides des chanes latrales (constituant les antignes O)
S'y trouvent aussi des protines diverses dont les porines (Omp pour Outer membrane protein) qui, en se polymrisant, forment
des canaux assurant le passage des molcules hydrophiles travers cette membrane externe par ailleurs trs hydrophobe.
Le peptidoglycane constitue une couche rigide, plus mince et plus lche que chez les bactries Gram positif. Il est compos de
chanes linaires de polyosides relies entre elles par des peptides. L'assemblage et le remodelage du peptidoglycane sont sous la
dpendance de transpeptidases et de carboxypeptidases qui fixent les bta-lactamines et sont pour cette raison dnommes PBP
(pour Penicillin binding proteins) ou PLP (pour Protines de liaison aux pnicillines).
Dans l'espace priplasmique s'accumulent des enzymes qui dgradent les substances prleves dans le milieu extrieur et
ncessaires au mtabolisme de la bactrie. On y trouve galement les btalactamases capables d'hydrolyser les btalactamines.
La membrane cytoplasmique est constitue, comme toutes les membranes cellulaires, d'une double couche phospholipidique
hydrophobe dont la permabilit est rendue slective par la prsence de protines dnommes permases. De nombreuses
enzymes et notamment celles qui interviennent dans le mtabolisme nergtique sont insres dans cette membrane. S'y trouvent
aussi, sur sa face externe, les transpeptidases et carboxypeptidases ncessaires la synthse du peptidoglycane.
CARACTRES ANTIGNIQUES
Les entrobactries possdent diffrents antignes :
un antigne commun dnomm ECA (pour Enterobacterial Common Antigen) ou antigne de Kunin. Cet antigne
n'existe que chez les entrobactries et, de ce fait, a un intrt taxonomique. Sa prsence chez les Yersinia a permis
d'inclure ce genre dans la famille des entrobactries.
les antignes O ou somatiques, correspondent aux polyosides fixs sur les lipopolysaccharides (LPS). Ils sont
thermostables et rsistent l'alcool . Les bactries portant des antignes O sont agglutines par les anticorps
correspondants ; les agglutinats sont fins, lents se constituer et difficilement dissociables par agitation (agglutination
"corps corps").
l'antigne R correspond au polysaccharide du core central. La disparition de l'antigne O le dmasque et rend les
souches "rough" (colonies rugueuses) autoagglutinables dans l'eau physiologique, plus sensibles aux substances
bactricides du srum, plus facilement phagocytes et donc moins pathognes.
les antignes H ou flagellaires n'existent que chez les souches mobiles. Constitus de protines spcifiques dnommes
flagelline, ils sont thermolabiles et inactivs par l'alcool. Ils provoquent une agglutination floconneuse (accolement des
bactries par leurs flagelles), rapidement constitue mais facilement dissociable par agitation (rupture des flagelles).
les antignes de surface comprenant :
o les antignes K, capsulaires, de nature polysaccharidique. Chez les Escherichia coli, les Shigella ou chez
certaines Salmonella et Citrobacter (alors appels Vi), ils masquent l'agglutination par les anticorps anti O qui
peut tre restitue aprs chauffage de la souche car ils sont dtruits par bullition.
o les antignes d'adhrence ou adhsines de nature protique, ports par des pili communs (encore appels
fimbriae).
ESCHERICHIA COLI
Bactrie isole en 1885 par Theodor von Escherich et couramment appele "colibacille".
HABITAT
Hte normal de l'intestin de l'homme et des animaux, c'est l'espce arobie la plus reprsente dans le tube digestif. La prsence
de colibacilles ou espces voisines (les coliformes) dans l'eau est un tmoin de contamination fcale (le dnombrement des
coliformes dans l'eau est appele "colimtrie")
BACTRIOLOGIE
E.coli exprime les caractres gnraux des entrobactries. Il est en outre lactose +, indole +, actone -, citrate -, H2S -, gaz +,
urase -.
ANTIGNES
O : ils comprennent 180 types antigniques dtectables par agglutination.
H : au nombre de 56, ils sont difficiles mettre en vidence.
K : On distingue actuellement 93 antignes K de structure polysaccharidique : les souches les plus pathognes possdent
l'antigne K1. L'ancienne distinction de ces antignes en types L, A et B est abandonne.
FACTEURS DE PATHOGNICIT
L'tude des facteurs de pathognicit des colibacilles ont montr que dans l'espce, il existe de nombreux variants exprimant des
potentialits pathognes diverses : les pathovars.
Les facteurs de pathognicit sont :
Une capsule qui s'oppose la phagocytose.
Des protines de la membrane externe et le LPS donnant aux bactries la capacit d'chapper l'activit bactricide du
srum de l'hte en s'opposant la fixation du complment.
Des systmes de captation du fer - les sidrophores - fournissant aux bactries le fer indispensable leur
multiplication, au dtriment de la transferrine.
Des adhsines : confrant aux souches qui les possdent la proprit de se fixer aux cellules pithliales. De nature
protique, elles sont portes le plus souvent par des pili communs. L'adhrence constitue une tape essentielle de la
pathogense des infections dues aux bactries entriques.
Des toxines
o l'endotoxine, commune aux entrobactries,
o les entrotoxines ST (thermostables) et LT (thermolabiles). Ce sont des toxines cytotoniques qui agissent sur le
contrle entrocytaire de la scrtion hydro-lectrolytique. La toxine LT est proche de la toxine cholrique.
o les cytotoxines SLT1 et SLT2 (Shiga-like toxin). Ce sont des toxines qui altrent l'intgrit des entrocytes. On
les appelle encore des vero-toxines (VT) cause de leur effet toxique sur les cellules vero en culture. (vervet
origin - vervet, un singe africain)
PATHOGENIE
Infections de l'arbre urinaire
Il est connu que les infections urinaires colibacille sont dues la migration de ces germes du tube digestif vers l'arbre urinaire
par voie ascendante et externe. Des raisons anatomiques expliquent leur plus grande frquence chez la femme mais toutes les
causes de stase (lithiase, prostatite, compression, grossesse, malformation) constituent des facteurs favorisants.
Cependant, la contamination vsicale par le colibacille ne donne une infection urinaire et surtout une atteinte du parenchyme
rnal, qu'avec certaines souches particulires capables d'adhrer aux cellules de l'arbre urinaire.
Les souches uro-pathognes appartiennent plus frquemment aux srotypes O 1, 2, 4, 6, 7, 16, 18, 75 et K 1, 2, 3, 12, 13 qui
possdent des adhsines.
Infections abdominales
E. coli est souvent responsable de suppurations pritonales, biliaires, appendiculaires ou gnitales. Les souches en cause ont un
pouvoir cytotoxique sur les polynuclaires, opposent une rsistance la phagocytose et possdent des systmes de captation du
fer.
Bactrimies
Les pathovars incrimins dans les bactrimies sont caractriss par un fort pouvoir invasif. Ils possdent des systmes de
captation du fer, des cytotoxines qui, occasionnant des dgts tissulaires, facilitent leur diffusion et des facteurs de rsistance la
phagocytose (par la capsule) et l'action bactricide du complment (par les chanes latrales du LPS).
Le choc endotoxinique
Fivre, collapsus et hmorragies sont les symptmes principaux du redoutable choc septique qu'engendre la lyse massive dans
l'organisme d'entrobactries (ou de bactries Gram ngatif) qui librent de grandes quantits de LPS. C'est le syndrome de
rponse inflammatoire systmique (SRIS) provoqu par une libration massive d'IL 1 et de TNF.
Mningites et bactrimies du nouveau n et du nourrisson
Trente pour cent environ des mningites nonatales sont dues Escherichia coli. Elles s'accompagnent presque toujours d'un tat
bactrimique, voire septicmique. L'infestation du nouveau-n est certainement d'origine maternelle. Les souches exprimant
l'antigne K1 sont largement prpondrantes dans ces infections.
Chez l'adulte, la frquence des mningites colibacille semble augmenter surtout en milieu neuro-chirurgical.
Syndromes diarrhiques
Plusieurs mcanismes physiopathologiques sont en cause selon les souches responsables :
souches entrotoxinognes: ETEC (Enterotoxinogen Escherichia coli)
(O6, O8, O15, O20, O25, O63, O78 O80, O85, O115, O128, O139)
Ces souches sont responsables de la "diarrhe des voyageurs" ou "turista" et de syndromes diarrhiques pidmiques dans les
pays du tiers-monde. Elles se fixent sur la muqueuse par des pili et laborent les entrotoxines thermolabile (LT) et thermostable
(ST). Ces facteurs de virulence sont cods par les plasmides.

souches entroinvasives : EIEC (Enteroinvasive Escherichia coli)
(O28, O112, O124, O136, O143, O144, O147, O152)
Ces souches (trs voisines des shigelles par leurs caractres biochimiques et antigniques) sont responsables de syndromes
dysentriques avec invasion de la muqueuse intestinale. Cette pathologie ressemble celle cause par les shigelles.

souches entrohmorragiques : EHEC (Enterohaemorragic Escherichia coli)
(O157 mais aussi O26 et O111)
Ces souches sont responsables de diarrhes sanglantes et de colites hmorragiques lies la production de toxines SLT. Le
syndrome hmolytique et urmique (anmie, thrombopnie et anmie hmolytique) serait d aux lsions que produisent ces
toxines sur les endothliums des capillaires.

souches entropathognes : EPEC (Enteropathogen Escherichia coli)
(O26, O55, O86, O111, O119, O125, O126, O127, 0128, O142)
Ces souches sont responsables de gastro-entrites infantiles, selon un mcanisme physiopathologique imparfaitement lucid. Ces
souches adhrent la surface des entrocytes sans les envahir. Elles sont proches des souches entrohmorragiques (EHEC) car
elles produisent les toxines SLT qui seraient responsable des lsions.

DIAGNOSTIC BIOLOGIQUE DES INFECTIONS A
COLIBACILLES
A partir de prlvements divers, urines, selles, sang, LCR, pus, liquide d'ascite, on recherche le colibacille par des techniques
bactriologiques :
L'examen microscopique rvle la prsence de bacilles Gram ngatif mais il arrive que la morphologie soit atypique.
La culture sur milieux simples ou sur milieux lactoss avec indicateur color donne lieu au dveloppement de bacilles
Gram ngatif, fermentant le lactose et possdant les caractres biochimiques qui caractrisent l'espce (cf. tableau, page
2).
Un srotypage n'est pratiqu couramment que pour les souches entropathognes (EPEC) et pour les srotypes O157
(EHEC) pour lesquelles il existe des srums agglutinants spcifiques.
La mise en vidence des entrotoxines n'est pas facile. Les mthodes de dtection par techniques immunologiques, par
l'tude de l'effet cytopathogne sur des cultures cellulaires ou par hybridation ADN/ADN ne sont pas couramment
pratiques mais on peut penser que des tests simples et spcifiques seront mis au point dans un proche avenir.
La recherche de l'antigne K1 dans le srum, le LCR ou les urines du malades par agglutination de particules de latex
sensibilises permet un diagnostic rapide en particulier chez le nourrisson ou le nouveau-n infects mais on observe une
raction croise avec l'antigne du groupe B des mningocoques.
Le srodiagnostic des infections colibacilles n'est utile que dans les infections urinaires de l'enfant o la dcouverte
d'anticorps (par agglutination ou par hmagglutination passive) fait craindre une "infection haute".
On peut rvler la prsence d'adhsines grce leur pouvoir hmagglutinant sur les globules rouges humains ou
animaux.
Les souches EIEC qui ressemblent aux Shigella sont reconnues par leur pouvoir invasif mis en vidence par le test de
Sereny (l'instillation de la souche sur l'oeil d'un cobaye provoque une krato-conjonctivite) ou par leur pouvoir
envahissant sur cellule HeLa en culture.
Il est parfois demand de rechercher sur les souches isoles d'infections urinaires des anticorps fixs sur les bactries
dont la prsence signerait une infection haute, rnale ou pylo-calicielle.
SENSIBILIT AUX ANTIBIOTIQUES
Escherichia coli est gnralement sensible aux antibiotiques.
Parmi les btalactamines, sont actives les pnicillines du groupe A (aminopnicillines), les carboxypnicillines, les
cphalosporines, les acylurido-pnicilllines, les carbapnems et les monobactams.
Les aminosides et les polypeptides sont galement actifs de mme que les quinolones de premire gnration, les
fluoroquinolones et le cotrimoxazole.
Cette sensibilit peut tre modifie par la production d'enzymes hydrolysant les btalactamines (pnicillinase, cphalosporinase)
ou les aminosides ou par une mutation affectant les porines (disparition de l'Omp F).
CITROBACTER - LEVINEA
Ce sont des entrobactries ayant en commun la capacit d'utiliser le citrate comme seule source de carbone (mais d'autres
entrobactries possdent aussi ce caractre).
Leur taxonomie est complexe :
Citrobacter freundii est l'espce type.
Citrobacter koseri (anciennes appellations : Levinea malonatica, Citrobacter diversus ou intermedius b)
Levinea amalonatica est aussi appel Citrobacter amalonaticus ou intermedius a
BACTRIOLOGIE
Les Citrobacter sont des commensaux du tube digestif de l'homme et des animaux qu'on peut isoler des urines, des scrtions
respiratoires voire du sang mais ils sont rarement responsables d'infections sauf chez les sujets immunodprims.
Les Levinea sont des bactries de l'environnement , ventuellement pathognes opportunistes qu'on peut isoler au cours
d'infections urinaires ou pulmonaires. Elles ont t signales comme responsables de mningo-encphalites nonatales.
TRAITEMENT
Les Citrobacter opposent une rsistance naturelle aux aminopnicillines et C1G mais dans de nombreux cas, cette rsistance
s'tend d'autres, voire toutes, les btalactamines. Les carbapnems restent gnralement actives. Les aminosides et
fluoroquinolones sont souvent efficaces.
Les Levinea rsistent l'ampicilline et aux carboxypnicillines
KLEBSIELLA - ENTEROBACTER
HAFNIA - SERRATIA
Ces entrobactries, frquemment responsables d'infections hospitalires, sont souvent dsignes sous le sigle "KEHS".
Elles utilisent, pour la fermentation des sucres, une voie mtabolique particulire qui produit de l'actyl-mthyl-carbinol ou
actone qu'on met en vidence par la raction de Voges Proskauer ou VP. De ce fait, les KEHS sont dites VP+. Toutefois, ce
caractre phnotypique n'est pas exclusif ce groupe ni d'ailleurs absolument constant.
KLEBSIELLA
Les Klebsiella sont des entrobactries immobiles et capsules. On distingue 5 espces dans le genre qu'on peut diffrencier par
des caractres biochimiques :
Klebsiella pneumoniae, comprenant 2 sous espces : ozaenae et rhinoscleromatis
Klebsiella oxytoca
Klebsiella planticola
Klebsiella terrigena
Klebsiella ornithinolytica
L'espce type est Klebsiella pneumoniae.
Les Klebsiella pneumoniae forment, sur milieux solides, de grosses colonies muqueuses, luisantes. Elles expriment des antignes
K, capsulaires utilisables comme marqueurs pidmiologiques.
Elles sont trs rpandues dans la nature (eaux, sols). Ce sont aussi des commensales du tube digestif des animaux et de l'homme
qui peut galement en hberger dans l'oropharynx.
Elles sont responsables d'infections respiratoires (Klebsiella pneumoniae est appele "pneumobacille de Friedlander"),
d'infections urinaires, de bactrimies et d'infections neuro-mninges post traumatiques ou post-chirurgicales. Les isolements
sont beaucoup plus frquents l'hpital - et singulirement dans les services de ranimation - qu'en ville.
Le diagnostic biologique repose sur la mise en vidence de la bactrie.
Les Klebsiella produisent une pnicillinase constitutive qui leur confre une rsistance naturelle aux amino et carboxypnicillines.
Des btalactamases dites " spectre tendu", rcemment mises en vidence, rendent les souches productrices rsistantes toutes
les btalactamines sauf les cphamycines et les carbapenems.
ENTEROBACTER
Ce sont des entrobactries VP + (Voges-Prauskauer + = production actone) comprenant plusieurs espces :
Enterobacter claocae est l'espce type
Enterobacter aerogenes
Enterobacter agglomerans
Enterobacter gergoviae
Enterobacter sakazakii
Les Enterobacter, prsents dans l'environnement, sont galement des commensaux du tube digestif. Ce sont des pathognes
opportunistes responsables, en milieu hospitalier surtout, d'infections urinaires, de bactrimies, de mningites ou de
suppurations diverses.
Enterobacter cloacae oppose une rsistance naturelle aux pnicillines A et aux cphalosporines de 1re gnration. Il a souvent
acquis une polyrsistance, en particulier aux btalactamines par production d'une cphalosporinase drprime.
Les autres espces sont gnralement plus sensibles aux antibiotiques, sauf en cas d'acquisition de rsistances d'origine
plasmidique (btalactamase spectre tendu d'Enterobacter aerogenes, par exemple, redoutable en milieu hospitalier o svissent
les infections nosocomiales).
HAFNIA ALVEI
Bactrie de la flore digestive humaine et animale et prsente dans l'environnement, Hafnia est souvent confondue avec
Salmonella car les caractres biochimiques sont voisins mais l'action lytique de bactriophages spcifiques permet de les
distinguer .
SERRATIA
Les Serratia sont des entrobactries VP+. Elles sont trs protolytiques et liqufient la glatine, et elles produisent une lipase.
On distingue dix espces dans le genre mais seule l'espce type, Serratia marcescens est frquemment isole chez l'homme. Les
autres espces sont des bactries de l'environnement prsentes sur les plantes, champignons ou mousses, dans l'eau, les sols et
chez les petits mammifres sauvages.
On distingue, chez Serratia marcescens, des biovars et des srovars dont la caractrisation est utile pour les enqutes
pidmiologiques. Certains d'entre eux produisent un pigment rouge.
Longtemps considr comme un saprophyte, Serratia marcescens se comporte de plus en plus souvent comme un pathogne
opportuniste responsable, l'hpital, d'infections nosocomiales, urinaires, pulmonaires, cutanes ou bactrimiques .
Les Serratia opposent une rsistance naturelle aux antibiotiques polypeptidiques et sont par ailleurs trs souvent
polyrsistantes et ceci explique sans doute les isolements de plus en plus frquents l'hpital.
SALMONELLA
Les salmonelles sont des parasites intestinaux des animaux vertbrs qui se dissminent dans la nature par les excrta. Chez les
animaux sang chaud, elles sont souvent pathognes.
TAXONOMIE
Les salmonelles constituent un genre ne contenant qu'une seule espce : Salmonella enterica divise en 7 sous-espces. La
presque totalit (99,8%) des souches responsables d'infestations humaines appartiennent une sous- espce galement dnomme
enterica. On distingue prs de 2000 srovars dans cette sous-espce, selon leur constitution antignique. Pour des raisons
historiques, car pendant longtemps les srovars ont t assimils l'espce, on dsigne chaque srovar par un nom rappelant soit
son pouvoir pathogne (Salmonella Choleraesuis) soit le nom de la ville du premier isolat (Salmonella London).
L'orthodoxie taxonomique imposerait de dsigner les salmonelles par les noms du genre, de l'espce, de la sous-espce et du
srovar (qui peut tre remplac par la formule antignique) :
exemple : Salmonella enterica, subsp enterica, srovar London
ou Salmonella enterica, subsp enterica, sr 3,10 : l,v : 1,6
Pour simplifier, il est admis de dsigner les salmonelles par le nom du genre suivi de celui du srovar consacr par l'usage, mais
ce dernier s'crit en caractres droits et avec une majuscule :
Salmonella London.
CLASSIFICATION DE KAUFFMANN - WHITE
Cette classification repose sur la dtermination des antignes O, H, et Vi.
Les antignes 0, au nombre de 67, ont la structure polyosidique prcdemment dcrite. On les dtermine par
agglutination sur lame l'aide d'immuns srums spcifiques. Certains de ces antignes, qualifis de "majeurs"
caractrisent un groupe de salmonelles : ainsi l'antigne O:4 dfinit-il le groupe B (voir tableau).
D'autres antignes, "mineurs" leurs sont associs mais n'ont gure d'importance diagnostique.
Les antignes H sparent les srovars l'intrieur de ces groupes. On les met galement en vidence par agglutination
sur lame. Les anticorps anti H rendent immobiles les bactries qui portent sur leurs flagelles les spcificits qui leur
correspondent.
Les antignes H existent sous deux phases qui peuvent coexister ou non chez une mme souche :
- La phase 1 est dsigne par des lettres minuscules, a, b, c... Au-del de z, les antignes portent la lettre z associe un chiffre.
- La phase 2 est dsigne par des chiffres arabes mais certains le sont galement par des lettres.
Le procd "d'inversion de phase" de Svent Gard permet d'isoler l'une des deux phases :
Les bactries mobiles, cultives sur une glose appauvrie en agar (glose "molle"), envahissent toute la surface du milieu. Si on incorpore une glose molle un srum anti H
spcifique d'une des deux phases reprsentes dans la souche, les bactries exprimant cette phase sont immobilises et seuls les lments de l'autre phase sont capables de
diffuser distance du point d'inoculation o il est possible de les isoler.
L'antigne Vi n'existe que chez trois srovars (S.Typhi, S.Para C, S.Dublin). Sa prsence peut masquer l'antigne O,
rendant la souche "O inagglutinable". Cette inhibition peut tre leve en chauffant la souche 100 C, car l'antigne Vi
est thermolabile.
Extrait du tableau de Kauffmann-White
Groupes Srovars Antigne O Vi Antigne H
phase 1 phase 2
A Paratyphi A 1,2,12

a -



B



Paratyphi B 1,4,5,12

b 1,2
Wien 1,4,12,27

b l,w
Saintpaul 1,4,12,27

e,h 1,2
Typhimurium 1,4,5,12

i 1,2
Brandenburg 1,4,12

l,v e,n, z15
Agona 1,4,12

f,g,s -
Derby 1,4,12

f,g -


C


Paratyphi C 6,7 + c 1,5
Virchov 6,7

r 1,2
Infantis 6,7

r 1,5
Bovismorbificans 6,8

r 1,5
Goldcoast 6,8

r l,w


D


Typhi 9,12 + d -
Enteritidis 1,9,12

g,m -
Panama 1,9,12

l,v 1,5
Dublin 1,9,12 + g,p -
Gallinarum 1,9,12

- -


E


London 3,10

l,v 1,6
Anatum 3,10

e,h 1,6
Give 3,10,15

l,v 1,7
Senftenberg 1,3,19

g,s,t -
Meleagridis 3,10

e,h l,w

CARACTRES BACTRIOLOGIQUES
Les Salmonelles sont des entrobactries et en possdent les caractres gnraux.
Elles sont btagalactosidase ,urase - , indole - , lactose - , 2S +, citrate +.
Certains srovars ont des caractres particuliers.
POUVOIR PATHOGNE
Les salmonelloses peuvent donner lieu trois types de manifestations cliniques.
1. Des formes bactrimiques, strictement humaines, qui sont les fivres typhode et paratyphode dues Salmonella Typhi,
Para A, Para B et Para C. Ce sont des bactrimies point de dpart lymphatique.
2. Des toxi-infections alimentaires donnant lieu des gastro-entrites dues tous les autres srovars mais galement Para
B et C
3. Des manifestations extra-digestives dans lesquelles divers srovars sont en cause et qui sont plus frquentes chez les
sujets fragiliss :
bactrimies non typhodiques,
infections pleuro-pulmonaires,
atteintes oto-articulaires : arthrites septiques ou ractives, ostomylite, ostite,
infections cardio-vasculaires : pricardites, artrites, infections sur prothses,
infections urinaires,
infections abdominales : cholcystites, abcs du foie, abcs de la rate,
infections du systmes nerveux central : mningites, abcs du cerveau, hmatome sous-dural infect,
abcs pidural
PHYSIOPATHOLOGIE
Les salmonelles ont un pouvoir entro-invasif et pntrent dans les cellules de la muqueuse intestinale.
Selon la conception de Reilly, les souches propagation bactrimique se multiplient dans les ganglions msentriques et passent
dans la circulation sanguine occasionnant la bactrimie ou sont dtruites sur place et librent l'endotoxine responsable des
troubles nerveux et vgtatifs de la typhode.
PIDMIOLOGIE
Les Salmonelles sont limines par les matires fcales et rsistent bien dans le milieu extrieur. L'homme est contamin par voie
digestive.
Les srovars responsables des fivres typhodes sont strictement humains et le seul "rservoir de virus" est
l'homme lui-mme, malade, convalescent ou porteur sain. Ces contaminations interhumaines expliquent la
survenue des cas de fivre typhode par petites pidmies ; elles sont directes, autour d'un malade, ou le plus
souvent indirectes par ingestion d'aliments souills par les excrta. Une hygine alimentaire dfaillante
augmente donc le risque de survenue de la maladie.
Les srovars responsables de gastro-entrites sont trs rpandus dans le monde animal et les animaux
domestiques ou d'levage sont l'origine des contaminations humaines. L'infestation se fait galement par voie
digestive, par consommation d'aliments souills consomms peu cuits : laitages, viandes, oeufs, coquillages,
crudits arroses etc...
Une source d'extension importante, particulirement en milieu hospitalier, est le contage "manuport" autour
de nourrissons atteints qui liminent des salmonelles dans les couches.
Les salmonelloses sont plus frquentes la fin de l't ou au dbut de l'automne, au retour des vacances. Les
voyages dans les pays chauds, le mode de vie "prs de la nature", la consommation de produits "naturels" ou
"du terroir" non aseptiss augmentent les risques d'infestation.
DIAGNOSTIC BIOLOGIQUE
On cherche les Salmonelles, essentiellement par hmoculture ou par coproculture mais d'autres prlvements peuvent en contenir.
L'identification biochimique doit prcder toute tentative de dtermination du srovar qui se fait par agglutination sur lame
l'aide d'immuns srums.
Sur des colonies isoles, on recherche d'abord l'antigne O de groupe puis l'aide du tableau de Kauffmann White, on tudie les
spcificits H dans une phase puis dans l'autre. Si on ne peut mettre en vidence qu'une phase, il faut rechercher l'autre par le
procd de Svent Gard ou inversion de phase qui consiste cultiver la souche sur une glose molle dans laquelle sont incorpors
des anticorps dirigs contre la phase dj mise en vidence. (voir ci-dessus)
Le srodiagnostic d'une fivre typhode ou srodiagnostic de Flix consiste rechercher les anticorps du malade en prsence de
suspensions antigniques O et H de S. Typhi, Para A, B et C. Les anticorps anti O apparaissent les premiers mais disparaissent
plus vite, les anticorps anti H persistent plus longtemps. L'analyse des rsultats permet de suspecter l'agent causal et de fixer la
date de l'infection.
TRAITEMENT
Les Salmonelles sont gnralement sensibles aux antibiotiques actifs contre les bacilles Gram ngatif. Certaines rsistances sont
possibles et impliquent la pratique d'un antibiogramme.
Les fivres typhodes sont actuellement traites par une cphalosporine de troisime gnration et en particulier par la ceftriaxone
(traitement de rfrence), mais les fluoroquinolones sont galement utilises chez l'adulte.
Les gastro-entrites relvent essentiellement d'un traitement symptomatique comprenant rgime et rhydratation. Une
antibiothrapie (sulfamthoxazole-trimthoprime, fluoroquinolones) n'est utile que dans les cas graves.
VACCINATION
Le vaccin TAB (pour Typhi, para A, para B) est constitu d'un mlange de Salmonella Typhi, Paratyphi A et Paratyphi B tues
par la chaleur et le phnol. La vaccination se fait en trois injections avec rappel ; elle est assez mal supporte cause de la grande
quantit d'endotoxine qu'elle apporte et son efficacit est incomplte. Elle n'est obligatoire que pour les sujets exposs (personnel
de sant).
Depuis plusieurs annes, un vaccin injectable, constitu d'un extrait du polyoside capsulaire Vi purifi de Salmonella Typhi est
disponible (Typhim Vi ). Il se pratique en une seule injection, est bien support et protge pour une dure de trois cinq ans. Il est
recommand aux voyageurs en partance pour les contres o la typhode est endmique. La protection qu'il confre se limite la
fivre typhode l'exclusion des paratyphodes et des autres salmonelloses.
Des vaccins vivants administrs par voie orale sont (toujours) l'tude.
SHIGELLA
Les Shigella sont des entrobactries faible pouvoir mtabolique, toujours immobiles. Elles sont gnotypiquement trs voisines
des Escherichiae.
Les caractres biochimiques et antigniques permettent de distinguer 4 espces ou groupes antigniques dans le genre :
espce groupe nombre de srotypes ordre de frquence
Sh. dysenteriae A 10 4
Sh. flexneri B 6 2
Sh. boydii C 15 3
Sh. sonnei D 1 1

HABITAT - POUVOIR PATHOGNE - PIDMIOLOGIE
Les shigelles sont des bactries strictement humaines. Elles ne font pas partie de la flore intestinale normale ; on ne les trouve que
chez les malades, les convalescents et les rares porteurs sains.
Elles sont responsables de l'historique "dysenterie bacillaire" (Shigella dysenteriae) qui dcimait les armes en campagne.
Actuellement, elles sont la cause, chez l'adulte, de colites infectieuses et chez l'enfant, de gastro-entrites svres avec diarrhe
mucopurulente et sanglante, fivre et dshydratation. Ces infections surviennent par petites pidmies familiales ou "de cantine".
En France, c'est Shigella sonnei que l'on isole le plus souvent.
PHYSIOPATHOLOGIE
Les shigelles envahissent la muqueuse intestinale, pntrent dans les entrocytes et les dtruisent par action vraisemblable d'une
toxine. Il s'en suit une importante raction inflammatoire de la muqueuse qui explique la symptomatologie.
DIAGNOSTIC
Le diagnostic repose sur la mise en vidence de la bactrie par coproculture. Caractres gnraux des entrobactries, nombreux
autres caractres ngatifs et immobilit permettent l'identification qui est complte par l'tude de l'quipement antignique par
agglutination l'aide de srums spcifiques.
Un srodiagnostic est possible mais a peu d'intrt.
TRAITEMENT
Les shigelles sont sensibles aux antibiotiques mais la possibilit de rsistances acquises imposent un antibiogramme. Un
traitement symptomatique est toujours essentiel.
PROTEUS - PROVIDENCIA
Ce groupe comprend les genres :
Proteus avec les espces mirabilis, vulgaris et penneri
Morganella avec l'espce morganii
Providencia avec les espces stuartii, rettgeri, alcalifaciens, et rustigianii.
Toutes ces bactries produisent des dsaminases (tryptophane dsaminase et phnylalanine dsaminase). Les Proteus produisent
en outre une urase.
Certains Proteus (mirabilis et vulgaris) envahissent la surface de la glose en formant des halos de cultures en ondes
concentriques partir du point d'inoculation.
Ce sont des bactries de l'environnement et des commensaux de l'intestin de l'homme et des animaux.
En bactriologie mdicale, on les isole au cours d'infections urinaires, respiratoires hautes ou de bactrimies. Les Proteus se
rencontrent galement sur la peau ou dans les orifices naturels et dans le conduit auditif externe en particulier. En raison de leur
pouvoir alcalinisant d l'urase, les Proteus sont parfois cause de lithiases urinaires.
Les bactries du genre Proteus opposent une rsistance naturelle aux antibiotiques polypeptidiques.
Les Proteus dits "indolognes" sont beaucoup plus rsistants aux antibiotiques que Proteus mirabilis ou penneri.
Providencia stuartii est souvent polyrsistant.
YERSINIA
Anciennement appeles Pasteurella, les Yersinia ont t incluses dans la famille des entrobactries en 1974 car elles en
possdent les caractristiques gnomiques ainsi que l'antigne de Kunin.
Ce sont de petits bacilles Gram ngatif, coloration bipolaire, cultivant sur milieux ordinaires ou sur milieux spciaux pour
entrobactries (glose SS) mais en donnant des petites colonies. Elles possdent une urase mais pas de dsaminases. Dans
certains cas, les caractres biochimiques d'identification s'expriment mieux 20C qu' 37C.
Les principales espces du genre sont Yersinia pestis, Yersinia pseudotuberculosis,Yersinia enterocolitica
YERSINIA PESTIS
La peste, puisqu'il faut l'appeler par son nom ... est une maladie animale frappant les rongeurs et le rat en particulier. Elle se
transmet l'homme par les puces qui transportent les bacilles des animaux l'homme. Une contamination interhumaine par voie
arienne est galement en cause au cours des pidmies. Chez l'homme, la maladie existe sous deux formes : la peste bubonique,
adnite pesteuse, ractionnelle aprs piqre de puce se compliquant d'un syndrome toxi-infectieux et la peste pulmonaire,
pneumopathie trs svre survenant aprs contamination interhumaine.
On reconnat la peste l'examen microscopique du pus ou de l'expectoration car les frottis fourmillent de petits bacilles pesteux.
La culture est lente et permet l'identification biochimique de la bactrie.
Yersinia pestis est sensible aux aminosides, aux sulfamides, aux ttracyclines et au chloramphnicol.
YERSINIA PSEUDOTUBERCULOSIS
Souvent dsign sous le nom de "bacille de Malassez et Vignal", Yersinia pseudotuberculosis est un germe qu'on trouve dans la
nature, potentiellement pathogne pour de nombreuses espces animales et pour l'homme.
La contamination est digestive. Il est responsable d'adnite msentrique ou d'ilite terminale donnant lieu des syndromes
appendiculaires. Les infections Yersinia pseudotuberculosis sont une des tiologies de l'rythme noueux.
YERSINIA ENTEROCOLITICA
Bactrie ubiquitaire contaminant l'homme et les animaux par voie digestive.
Biotypie, srotypie et lysotypie permettent de distinguer dans l'espce des pathovars plus adapts l'homme.
Y. enterocolitica est surtout responsable de gastro-entrites, mais occasionne aussi des syndromes appendiculaires, des
polyarthrites ou un rythme noueux.
Elle est rsistante aux btalactamines mais sensible aux aminosides, au trimthoprime-sulfamthoxazole et aux ttracyclines.
ENTROBACTRIES ET ANTIBIOTIQUES
Les entrobactries opposent une rsistance naturelle aux Pnicillines G et M, aux macrolides, la vancomycine.
Certaines d'entre elles sont naturellement rsistantes d'autres molcules : les Proteus et Serratia la colistine, les Klebsiella et
Levinea l'ampicilline. Ces rsistances tant naturelles dfinissent des phnotypes dits "sensibles" ou "sauvages".
RSISTANCES NATURELLES
Rsistance aux btalactamines
En testant quatre molcules : pnicilline A, carboxypnicilline, cphalosporine de 1re gnration (ou C1G) et
cphalosporine de 3me gnration (C3G), on peut dfinir 4 types de comportement des entrobactries vis
vis des btalactamines.

Groupe Peni
A
Carb C1G C3G


1

S

S

S

S
Escherichia coli,
Proteus mirabilis,
Salmonella, Shigella
Phnotypes sensibles
2 R R S S Klebsiella, Levinea Pnicillinase chromosomique

3

R

S

R

S
Enterobacter,
Citrobacter
Proteus indole +,
Serratia, Providencia
Cphalosporinase
4 R R R S Yersinia enterocolitica Pnicillinase + Cphalosporinase

Rsistance aux autres antibiotiques
Les aminosides, quinolones et phnicols sont normalement actifs contre les entrobactries mais les rsistances
acquises sont frquentes.
RSISTANCES ACQUISES
1 - Par production d'enzymes
- Rsistance aux btalactamines
C'est surtout en produisant des btalactamases que les entrobactries acquirent des rsistances aux
btalactamines.
Les pnicillinases (TEM), d'origine plasmidique, rendent les souches qui en produisent rsistantes aux pni G,
A et aux carbnicillines mais si le niveau de production est lev, la rsistance s'tend aux acylurido-
pnicillines, aux cphalosporines de premire et seconde gnration (C1G, C2G) et quelques C3G.
Certaines de ces pnicillinases rsistent aux inhibiteurs qui sont alors totalement inoprants : on les appelle TRI
(pour TEM rsistantes aux inhibiteurs) et les souches productrices sont rsistantes aux pnicillines A et aux
carboxypnicillines mme lorsqu' elles sont associes ces inhibiteurs.
La production importante de cphalosporinase (cphalosporinase "drprime"), d'origine chromosomique, rend
les souches rsistantes toutes les btalactamines sauf aux carbapnems.
Depuis peu sont apparues, chez Klebsiella pneumoniae surtout, des btalactamases spectre tendu (SHV)
d'origine plasmidique qui inactivent toutes les btalactamines, sauf certaines C2G et les carbapnems.
Les entrobactries du groupe 1 et Escherichia coli en particulier expriment parfois une pnicillinase sensible
aux inhibiteurs (50% des colibacilles) Il arrive que cette pnicillinase soit abondamment produite (pnicillinase
de haut niveau) et dans ce cas les inhibiteurs se rvlent moins efficaces.
Une pnicillinase TRI est prsente chez 3% environ des souches d' Escherichia coli
Les entrobactries du groupe 2 (Klebsiella, Levinea) produisent parfois leur pnicillinase naturelle un haut
niveau.
C'est galement principalement mais non exclusivement chez les klebsielles qu'on rencontre les BLSE
Les entrobactries du groupe 3 (Enterobacter, Citrobacter, Proteus indolognes, Providencia, Serratia)
produisent naturellement une cphlosporinase qui peut tre drprime.
- Rsistance aux aminosides
Les enzymes qui hydrolysent les aminosides sont :
les aminosides phosphotransfrases (APH)
les aminosides nuclotidyltransfrases (ANT)
les aminosides actyltransfrases (AAC)
On peut, en testant les quatre aminosides les plus frquemment utiliss (gentamicine, tobramicine, ntilmicine
et amikacine), dfinir les phnotypes suivants : G, GT, GTN, TNA et GTNA.
Ces rsistances sont parfois difficiles dceler et il faut une observation attentive et une interprtation correcte
des rsultats des antibiogrammes.
Les phnotypes rsistants sont rares : moins de 3% chez Escherichia coli, Salmonella et Shigella, un peu moins
rares chez les Proteus mais deviennent plus frquents, atteignant 20 50%, chez les autres entrobactries :
Klebsiella, Enterobacter, Citrobacter, Serratia.
- Rsistance aux phnicols
Une chloramphnicol-actyl-tranfrase (CAT) est responsable de la rsistance des entrobactries aux
phnicols en particulier de certaines souches de Salmonella.
2 - Autres mcanismes
- Impermabilit ou modification des cibles sont plus rarement cause de rsistance chez les entrobactries :
Une mutation portant sur les porines est cause de rsistance haut niveau chez les Enterobacter, Citrobacter,
Serratia, Proteus indolognes et rarement Salmonella.
Les mutations qui affectent le transport actif des aminosides sont galement responsables d'une rsistance
croise ces antibiotiques.
Une mutation affectant l'ADN gyrase dtermine une rsistance aux quinolones (Klebsiella, Serratia,
Citrobacter, Providencia)
Les mutations qui affectent les protines ribosomales, entranent une diminution de l'affinit des ribososomes
pour les aminosides. De tels mutants sont rarement isols en clinique

En guise de conclusion
Les entrobactries sont-elles pathognes ?
Oui, serait-on tent de rpondre puisque ce sont les bactries les plus frquemment isoles chez les malades,
Non, au contraire, puisque nous accueillons ces bactries sans dommages : le colibacille ne constitue-t-il pas l'espce dominante
de la flore commensale arobie de nos intestins ?
En fait, il en est des relations hte-entrobactries comme de toute relation : il y a des hauts et des bas .
Diffrentes raisons, tenant tant l'hte qu' la bactrie, expliquent cette versatilit.
Dpendent de l'hte : les modalits d'entre du microbe, la prsence de certains rcepteurs tissulaires d'adhsion, l'tat
des tissus atteints, les pathologies associes, l'efficacit du systme immunitaire.
Dpendent de l'(entro)bactrie : l'importance de l'inoculum, le pathovar auquel elle appartient que dfinissent, les
facteurs de virulence (capacits d'adhsion, de multiplication, laboration de toxines et sans doute bien d'autres facteurs
dcouvrir).
"C'est de l'union entre la bactrie et l'organisme que dpend la mise en route du processus infectieux..." (V. de Lavergne - La
Maladie infectieuse - 1951).
La pathognicit est une notion trs relative et isoler une bactrie d'un individu ne fait pas la preuve d'une infection ... encore
moins d'une maladie ! En gnral, il y a beaucoup plus de "porteurs sains" que de malades ... et le mdecin doit se garder de
dcouvrir et traiter des malades qui n'en sont pas.
Pour le bactriologiste, cependant, les entrobactries sont des germes d'un prodigieux intrt : nombreux genres, nombreuses
espces, nombreux biovars, srovars et lysovars font de ces bactries de passionnants sujets d'tude.
L'antibiologie, la biologie molculaire, le gnie gntique et avec elles toute la bactriologie moderne leur doivent beaucoup. Les
entrobactries mritent respect et considration.
Pasteur ne pensait-il pas aux entrobactries quand il affirmait :
"Messieurs, ce sont les microbes qui auront le dernier mot !