FACULTAD:

MEDICINA HUAMA

ASIGNATURA:

QUIMICA MEDICA

TEMA:

SEMINARIO N 11: NIVELES ESTRUCTURALES EN PROTENAS

AUTORES:

DEZA QUEVEDO, Maricarmen HOYOS LOPEZ, Cristhian HUAMANCHUMO ISIQUE, Cesar NARVA RODRIGUEZ, Jenny YAIPEN SALAZAR, Cristhian

AO:

2012-I

INTRODUCCION: Las protenas son macromolculas complejas desde los punto de vista fisco y funcional, que desempean mltiples funciones importancia crucial. Son polmeros lineales constituidos por subunidades o bloques menores denominados aminocidos. Aunque en la naturaleza se han identificado cientos de aminocidos diferentes, slo veinte de estos, todos -aminocidos de la serie L, forman parte de las protenas. Clsicamente se han descrito las protenas en trminos de estructura primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria. Sin embargo, con los avances de las ltimas dcadas en biologa molecular se han introducido nuevos trminos. 1. La estructura primaria de una protena no es ms que la secuencia de aminocidos que la componen, o lo que es lo mismo, su disposicin lineal. 2. La estructura secundaria involucra la organizacin o arreglo espacial de partes de la secuencia de aminocidos. Para concretar, bsicamente, y en trminos de estructura secundaria, ciertas secuencias de aminocidos se pueden organizar como: hlices , lminas o giros. Estas tres formas de la estructura secundaria son las ms frecuentes en la naturaleza, sin embargo no son las nicas que se pueden dar en los polipptidos o las protenas en general. 3. La estructura terciaria de las protenas es el modo en el que la cadena polipeptdica se pliega en el espacio. Es la disposicin de los dominios en el espacio es decir esta adquiere forma tridimensional de manera precisa como en las proteinas globulares. La estructura terciaria posee cantidades variables de helices-alfa y beta y otras con una estructura flexible que puede cambiar al azar (random coil). La estructura terciaria se realiza de manera que los aminocidos apolares se sitan hacia el interior y los polares hacia el exterior. 4. La estructura cuaternaria deriva de la conjuncin de varias cadenas peptdicas que, asociadas, conforman un ente, un multmero, que posee propiedades distintas a la de sus monmeroscomponentes. Dichas subunidades se asocian entre s mediante interacciones no covalentes, como pueden ser puentes de hidrgeno, interacciones hidrofbicas o puentes salinos. Para el caso de una protena constituida por dos monmeros, un dmero, ste puede ser un homodmero, si los monmeros constituyentes son iguales, o un heterodmero si no lo son. En cuanto a uniones covalentes, tambin pueden existir uniones tipo puente disulfuro entre residuos de cistena situados en cadenas distintas

1.

Respecto a los aminocidos: a. Cuntos aminocidos presentes en la naturaleza se han reportado hasta el momento?

Aminocidos presentes en la naturaleza.

cido Asprtico (Asp) D

Cisterna Cys) C

Isoleucina (IIe) I

Serina (Ser) S

cido Glutmico (Glu)E

Fenilalanina (Phe) F

Leucina (Leu) L

Tirosina (Tyr) Y

Alanina (Ala) A

Glicina (Gly) G

Lisina (Lys) K

Treonina (Thr) T

Arginina (Arg) R

Glutamina (Glu) Q

Metionina (Met) M

Triptfano (Trp) W

Asparagina (Asn) N

Histidina (His) H

Prolina (Pro) P

Valina (Val) V

b.

Cuntos y cules aminocidos forman parte de las protenas?, qu

caractersticas tienen en comn?

Los 20 aminocidos que forman parte de las protenas son: Serina (Ser,S), Treonina (Thr,T), Cistena (Cys,C), Asparagina (Asn,N), Glutamina (Gln,Q) y Tirosina (Tyr,Y), Glicina (Gly,G), Alanina (Ala,A), Valina (Val,V), Leucina (Leu,L), Isoleucina (Ile,I), Metionina (Met,M), Prolina (Pro,P), Fenilalanina (Phe,F) y Triptfano (Trp,W), cido asprtico (Asp,D) y cido glutmico (Glu,E), Lisina (Lys,K), Arginina (Arg,R) e Histidina (His,H)

Que el carbono central esta unido adems a una cadena carbonada a un acido carboxlico y un amino. Es decir lo nicamente diferencial es la cadena R

c. Cmo se clasifican los aminocidos segn: i. el tipo de cadena lateral

Aminocidos alifticos: En esta grupo se encuadran los aminocidos cuya cadela lateral es aliftica, es decir una cadena hidrocarbonada.

La prolinatambien tiene una cadena lateral de naturaleza aliftica, pero difiere de los dems aminocidos en que su cadanalareral est unida tanto al carbono alfa como al nitrgeno del grupo amino.

Aminocidos aromticos:En esta grupo se encuadran los aminocidos cuya cadela lateral posee un anillo aromtico. La fenialalanina es una alanina que lleva unida un grupo fenlico. La tirosina es como la fenilalanina con un hidroxila en su anillo aromtico, lo que lo hace menos hidrofbico y mas reactivo. El triptfano tiene un grupo indol.

Aminocidos azufrados: Hay dos aminocidos cuyas cadenas laterales poseen tomos de azufre, son la cistena, que posee un grupo sulfhidrilo, y la metionina, que posee un enlace tioster.

Aminocidos hidroxilados: Otros dos aminocidos tienen cadenas alifticas hodroxiladas, la serina y la treonina. El grupo hidroxilo hace de estos aminocidos mucha ms hidroflicos y reactivos.

Aminocidos bsicos: Dentro de los aminocidos con cadenas laterales muy polares encontramos tres aminocidos bsicos: lisina,arginina e histidina.

Aminocidos cidos y sus amidas: En este grupo encontramos dos aminocidos con cadenas laterales de naturaleza cida y sus amidas correspondientes. Estos son el cido asprtico y el cido glutmico (a estos aminocidos se les denomina normalmente aspartato y glutamato par resaltar que sus cadenas laterales estn cargadas negativamente a pH fisiolgico). Los derivados sin carga de estos dos aminocidos son la asparragina y la glutamina que contienen un grupo amida terminal en lugar del carboxilo libre.

ii. las propiedades de la cadena lateral

Los aminocidos se clasifican habitualmente segn las propiedades de su cadena lateral:

Neutros polares, polares o hidrfilos :serina (Ser, S), treonina (Thr, T), cistena (Cys, C), glutamina (Gln, Q), asparagina (Asn, N) y tirosina (Tyr, Y).

Neutros no polares, apolares o hidrfobos: glicina (Gly, G), alanina (Ala, A), valina (Val, V), leucina (Leu, L), isoleucina (Ile, I), metionina (Met, M), prolina (Pro, P), fenilalanina (Phe, F) y triptfano (Trp, W).

Con carga negativa, o cidos: cido asprtico (Asp, D) y cido glutmico (Glu, E).

Con carga positiva, o bsicos: lisina (Lys, K), arginina (Arg, R) e histidina (His, H).

Aromticos: fenilalanina (Phe, F), tirosina (Tyr, Y) y triptfano (Trp, W) (ya incluidos en los grupos neutros polares y neutros no polares).

iii. la capacidad de sntesis del organismo

A los aminocidos que necesitan ser ingeridos por el cuerpo se les llama esenciales; la carencia de estos aminocidos en la dieta limita el desarrollo del organismo, ya que no es posible reponer las clulas de los tejidos que mueren o crear tejidos nuevos, en el caso del crecimiento. Para el ser humano, los aminocidos esenciales son: Valina (Val, V) Leucina (Leu, L) Treonina (Thr, T) Lisina (Lys, K) Triptfano (Trp, W) Histidina (His, H) * Fenilalanina (Phe, F) Isoleucina (Ile, I)

Arginina (Arg, R) * Metionina (Met, M) A los aminocidos que pueden sintetizarse o producirse mediante la sntesis de aminocidos en el organismo se los conoce como no esenciales y son: Alanina (Ala, A) Prolina (Pro, P) Glicina (Gly, G) Serina (Ser, S) Cistena (Cys, C) ** Asparagina (Asn, N) Glutamina (Gln, Q) Tirosina (Tyr, Y) ** cido asprtico (Asp, D) cido glutmico (Glu, E) Estas clasificaciones varan segn la especie. Se han aislado cepas de bacterias con requerimientos diferenciales de cada tipo de aminocido.

2. Respecto a niveles de organizacin de las protenas: a. Qu estructuras puede presentar una protena? Explique cada una de ellas.

Estructura primaria La estructura primaria de las protenas se refiere a la secuencia de aminocidos., es decir, la combinacin lineal de los aminocidos mediante un tipo de enlace covalente, el enlace

peptdico. Los aminocidos estn unidos por enlaces peptdicos siendo una de sus caractersticas mas importante la coplanaridad de los radicales constituyentes del enlace. La estructura lineal del pptido definir en gran medida las propiedades de niveles de organizacin superiores de la protena. Este orden es consecuencia de la informacin del material gentico: Cuando se produce la traduccin del RNA se obtiene el orden de aminocidos que van a dar lugar a la protena. Se puede decir, por tanto, que la estructura primaria de las protenas no es ms que el orden de aminocidos que la conforman.

Estructura secundaria La estructura secundaria de las protenas es la disposicin espacial local del esqueleto proteico, gracias a la formacin de puentes de hidrgeno entre los tomos que forman el enlace peptdico, es decir, un tipo de enlace no covalente, sin hacer referencia a la cadena lateral. Existen diferentes tipos de estructura secundaria: - Estructura secundaria ordenada, ( repetitivos donde se encuentran los hlices alfa y cadenas beta, y no repetitivos donde se encuentran los giros beminocidos estn dispuestas hacia el exterior de la hlice. El grupo amino del aminocido (n) puede establecer un enlace de hidrgeno con el grupo carbonilo del aminocido (n+4). De esta forma, cada aminocido (n) de la hlice forma dos puentes de hidrgeno con su enlace peptdico y el enlace peptdico del aminocido en (n+4) y en (n-4). En total son 7 enlaces de hidrgeno por vuelta. Esto estabiliza enormemente la hlice. Esta dentro de los niveles de organizacin de la protena. Lmina beta La beta lmina se forma por el posicionamiento paralelo de dos cadenas de aminocidos dentro de la misma protena, en el que los grupos amino de una de las cadenas forman

enlaces de hidrgeno con los grupos carboxilo de la opuesta. Es una estructura muy estable que puede llegar a resultar de una ruptura de los enlaces de hidrgeno durante la formacin de la hlice alfa. Las cadenas laterales de esta estructura estn posicionados sobre y bajo el plano de las lminas. Dichos sustituyentes no deben ser muy grandes, ni crear un impedimento estrico, ya que se vera afectada la estructura de la lmina. Estructura terciaria Es el modo en que la cadena polipeptdica se pliega en el espacio, es decir, cmo se enrolla una determinada protena, ya sea globular o fibrosa. Es la disposicin de los dominios en el espacio.

La estructura terciaria se realiza de manera que los aminocidos apolares se sitan hacia el interior y los polares hacia el exterior en medios acuosos. Esto provoca una estabilizacin por interacciones hidrofbicas, de fuerzas de van der Waals y de puentes disulfuro1 (covalentes, entre aminocidos de cistena convenientemente orientados) y mediante enlaces inicos.

Estructura cuaternaria La estructura cuaternaria deriva de la conjuncin de varias cadenas peptdicas que, asociadas, conforman un ente, un multmero, que posee propiedades distintas a la de sus monmeros componentes. Dichas subunidades se asocian entre s mediante

interacciones no covalentes, como pueden ser puentes de hidrgeno, interacciones hidrofbicas o puentes salinos. Para el caso de una protena constituida por dos monmeros, un dmero, ste puede ser un homodmero, si los monmeros constituyentes son iguales, o un heterodmero, si no lo son.

b. Qu fuerzas estabilizan la estructura tridimensional de una protena?

La estructura de las protenas esta estabilizada por diferentes tipos de enlaces, como enlaces covalentes (enlace peptdico, enlace por puentes disulfuro), enlaces por puentes de hidrgeno (interacciones dipolo-dipolo), interacciones hidrofbicas, enlaces salinos (interacciones electrostticas) o las fuerzas de los contactos de Van der Waals. Todos estos tipos de enlaces juegan un importante papel en la estabilizacin de la estructura tridimensional de las protenas. La fuerza de atraccin de los diferentes enlaces que intervienen en la estabilizacin de las protenas se expresa en kcal/mol, y corresponde a la energa liberada al formar el enlace, o la energa que debe suministrarse para romper el enlace que es:

Tipo de enlace Covalente Inico o salino Puentes de Hidrgeno Van der Waals Hidrofbico

Fuerza (kcal/mol) -50 a 100 -1 a 80 -3 a 6 -0,5 a 1 -0,5 a 3

Un ejemplo de un pptido de 12 aminocidos pertenecientes a la estructura de la quimotripsina (desde la glicina193 a la asparragina204), servir para ilustrar los diferente tipos de enlaces que se dan para estabilizar la estructura de las protenas. La quimotripsina est formada por cuatro cadenas polipeptdicas ( A, B, C, D). El esqueleto polipeptdico se representa en color azul, mientras que las cadenas laterales de los aminocidos se representan con los colores tpicos C , H, N, O, P, S

Enlaces por puente disulfuro Este tipo de enlaces se establece al oxidarse dos cistenas para formar una cistina, unin de los dos azufres. Este tipo de uniones se conocen con el nombre de puentes disulfuro. CH2-S-S-CH2-. Por ejemplo el puente disulfuro entre la Cys201 y la Cys136.

Enlaces salinos Los aminocidos bsicos y cidos de las protenas presentan a pHs fisiolgicos carga. Al poderse encontrar en el esqueleto polipeptdico aminocidos cidos (Glu y Asp) que presentan carga negativa; y aminocidos bsicos (His, Lys, Arg) que presentan carga positiva; hay distintas regiones de las protenas con carga opuesta que se atraen por fuerzas electrostticas, interacciones que se conoce con el nombre de enlace salino. Los aminocidos que presentan carga en su cadena lateral se suelen localizar ms en la parte exterior de la protena, que en el interior de la misma, en esta localizacin se encuentran mayoritariamente los aminocidos hidrofbicos. Aunque es raro encontrar aminocidos cargados en el interior de la protena, si estn, juegan un papel importante ya que la distancia y fuerza de este tipo de enlace se aproxima a los valores del enlace covalente (2,8 ). En el modelo propuesto como ejemplo, el grupo cido de la cadena lateral del Asp194 interacciona con el grupo amino terminal de la cadena B, corresponiente a una Ile16. Los grupos cargados normalmente se encuentran en la superficie de la protena, y determinan el correcto plegamiento de la protena al poder interaccionar con el agua de solvatacin. Las molculas de agua interaccionan con las cargas de las cadenas laterales (o grupo amino y carboxilo terminal). Son ejemplos de este tipo de interaccin las Lys202 y Lys203 con las molculas de agua de solvatacin.

Puentes de hidrgeno En la estructura de las protenas hay diferentes tipos de enlaces por puentes de hidrgeno, dependiendo de los tomos que intervienen en el mismo: Las cadenas laterales de dos aminocidos de la cadena polipeptdica La Ser195 en el modelo peptdico est situado de tal manera que interacciona con la His57 a travs de un puente de hidrgeno, el grupo -OH de la Ser comparte el hidrgeno con un N de la cadena lateral del anillo de la His57.

Los tomos de la cadena lateral de los aminocidos y las molculas de agua de solvatacin El Asn204 contiene en la cadena lateral un grupo carboxilo, grupo que puede formar un puente de hidrgeno con el agua de disolucin en la superficie de la protena.

Los tomos de la cadena lateral de los aminocidos y los tomos del esqueleto polipeptdico La Gly193 forma un enlace de hidrgeno a travs del grupo carboxilo con un grupo NH de la cadena lateral de laHis40.

Los tomos del esqueleto polipeptdico La mayora de los enlaces por puente de hidrogeno estn formados por el esqueleto polipeptdico de la protena entre los grupos amino (N-H) y carbonilo (C=O), que forman las hlices a o las lmina . En el modelo polipeptdico (residuos 193-204) es una lmina un lmina que est formando puentes de hidrgeno con

antiparalela (residuos 205-214). As se establecen dos puentes de

hidrgeno entre los tomos de la cadena polipeptdica en la Leu199 y la Gly211.

Interacciones hidrofbicas Las interacciones hidrofbicas se dan entre las cadenas laterales de los aminocidos hidrofbico, estos aminocidos suelen disponerse en el interior de la protena, evitando de esta manera las interacciones con el agua. Este tipo de fuerzas hidrofbicas intervienen en el correcto plegamiento de la protena. Las uniones hidrofbicas suelen darse en el interior, corazn hidrofbico de la protena, donde la mayora de cadenas laterales puede asociarse estrechamente y se encuentran protegidas de las interacciones con el disolvente. As la Pro198 y la Val200 son dos de los seis aminocidos hidrofbicos del modelo polipeptdico. Estos dos aminocidos se asociacin de manera estrecha con las cadenas hidrocarbonadas de Leu209, Val121 y Trp207. Este tipo de interacciones ayudan a mantener la estructura tridimensional de las protena. Aunque no todos los aminocidos hidrofbicos se encuentran en el interior de las protenas, cuando las cadena lateral hidrofbicas estn expuestas a las molculas polares del agua usualmente involucran un enlace hidrofbico externo. Podemos observar la unin hidrofbica entre la Pro24 y Phe71.

Fuerzas de Van der Waals Las fuerzas de Van der Waals, son atracciones elctricas dbiles entre diferentes tomos. Estas fuerzas son el resultado de las fuerzas atractivas y repulsivas que se establecen al acercarse los tomos, de manera que existe una distancia en que la atraccin es mxima. Esta distancia se encuentra en lo que se conoce con el nombre de radios de Van der Waals. Estas fuerzas se deben a que cada tomo posee una nube electrnica que puede fluctuar, creando de esta manera dipolos temporales. El dipolo transitorio en un enlace puede inducir un dipolo complementario en otro enlace, provocando que dos tomos de los diferentes enlaces se mantengan juntos. Estos dipolos transitorios provocan una atraccin electrosttica dbil: las fuerzas de Van der Waals.

Los puntos alrededor de los tomos representan el radio de Van der Waals. Estas atracciones de Van der Waals, aunque transitorias y dbiles son un componente importante en la estructura de las protenas porque su nmero es importante. La mayora de los tomos de una protena estn empaquetados lo suficientemente prximos unos de otros para involucrar estas fuerzas transitorias.

3.

Qu condiciones afectan el plegamiento correcto de las protenas?

El plegamiento de protenas es el proceso por el que una protena alcanza su estructura tridimensional. La funcin biolgica de una protena depende de su correcto plegamiento. Si una protena no se pliega correctamente ser no funcional y, por lo tanto, no ser capaz de cumplir su funcin biolgica. El proceso inverso es conocido como desnaturalizacin de protenas. Una protena desnaturalizada no es ms que una cadena de aminocidos sin una estructura tridimensional definida ni estable. A menudo, las protenas desnaturalizadas pierden su solubilidad y precipitan. En algunos casos los procesos de plegamiento y desnaturalizacin son reversibles, aunque en otros no. Las condiciones que afectan el plegamiento correcto de las protenas son: Entropa conformacional

Se define entropa conformacional del plegado como la disminucin de la entropa, de la aleatoriedad en definitiva, durante el paso desde una multitud de conformaciones de ovillo aleatorio hasta una nica estructura plegada. Interacciones carga-carga

Las interacciones carga-carga se dan entre grupos polares y cargados de las cadenas laterales de los aminocidos componentes del polipptido, puesto que los grupos carboxilo y amino del carbono alfa estn implicados en el enlace peptdico.

Enlaces de hidrgeno internos

Dos molculas relacionndose mediante cuatro puentes de hidrgeno, representados mediante lneas de puntos. Las cadenas laterales de muchos aminocidos se comportan como donadores o como aceptores de enlaces de hidrgeno (es el caso de los grupos hidroxilo de la serina y los grupos amino de la glutamina, por ejemplo). Interacciones de van der Waals

El denso empaquetamiento en el ncleo de las protenas globulares facilita la interaccin dbil entre grupos moleculares sin carga. Dichos enlaces son de baja energa, pero su abundante nmero suple su debilidad.

4.

Cmo est formado el sistema de control de plegamiento en los organismos?

Dos de los componentes fundamentales de los sistemas de control del plegamiento son: -Las chaperonas moleculares.- Esta clase de protenas, muy conservadas entre las diferentes especies, unen reversiblemente a las molculas de protena de reciente sntesis y, mediante mecanismos diversos que pueden requerir la hidrlisis de ATP, las ayudan a plegarse en su estado nativo . Algunas chaperonas pueden revertir el plegamiento de las molculas que estn plegadas incorrectamente, dndoles una nueva oportunidad de iniciar el proceso y potencialmente alcanzar su estado nativo funcional. -Las proteasas, cuya funcin est coordinada con la de las chaperonas, degradan a las molculas de protenas plegadas incorrectamente, generalmente una vez que chaperonas especficas las han desplegado convenientemente. La va fundamental de eliminacin de las protenas incorrectamente plegadas en el compartimiento citoplasmtico es el complejo del proteosoma. Este sistema degrada a las protenas que

han sido marcadas para tal fin mediante la unin covalente a su estructura de un nmero variable de molculas de ubiquitina . La va del proteosoma es tambin el destino de algunas de las protenas sintetizadas en los ribosomas unidos al retculo endoplsmico y que por alguna razn no alcanzaron su estado nativo. 5. Qu es la amiloidosis?

La amiloidosis es una enfermedad de etiologa desconocida, que se caracteriza por el depsito de sustancia amorfa (amiloide), en los espacios extracelulares de diversos rganos y tejidos condicionando alteraciones funcionales y estructurales segn la localizacin e intensidad del depsito. Alrededor del 75% de los pacientes que la padecen tienen una amiloidosis primaria, el 5% del total presenta amiloidosis secundaria, y menos del 5% desarrolla una amiloidosis familiar. Las manifestaciones clnicas son inespecficas, determinadas por el rgano o el sistema afectado. La evolucin de la amiloidosis, es difcil de comprobar debido a que casi nunca se conoce con precisin el inicio de la misma. En cuanto al tratamiento mdico, se observa respuesta favorable con melfaln ms prednisona, respecto al trasplante de rganos, no se cuenta con un protocolo de aceptacin universal, este depende de cada caso, extensin y estadio evolutivo de la enfermedad. 6. A que se denomina precursor amiloide?

La Protena precursora amiloidea es una protena integral de membrana, y es expresada en muchos tipos de tejidos, y est concentrada en la sinapsis entre neuronas. Participa como regulador frente a la sinapsis neuronal. La APP es conocida por ser la molcula precursora del -amiloide, un peptido de 42 aminocidos, que es el principal componente de las placas amiloideas presentes en el tejido cerebral de pacientes que sufren de la Enfermedad de Alzheimer.

7.

Cules son las caractersticas generales de los amiloides?

El material amiloide es de origen proteico, insoluble y resistente a la protelisis. El material amiloide est formado en un 95% por fibrillas de amiloide. El otro 5% del material amiloide corresponde a factores que, probablemente, contribuyen a la estabilizacin de las fibrillas, de los cuales los ms importantes son el componente srico P (una molcula de la familia de las pentraxinas, muy similar a la protena C reactiva) y proteoglucanos y glicosaminglicanos, procedentes de la matriz extracelular del tejido de depsito.

8.

Mencione las estructuras proteicas involucradas en las amiloidosis humanas

conocidas? Amiloidosis es el estado de una protena que se encuentra en condiciones de estrs fsico, qumico y funcional que enfrentan tanto en el interior como en el exterior de la clula. Se ha demostrado que numerosas enfermedades humanas y de los animales, reunidas bajo el trmino de amiloidosis, estn asociadas a alteraciones del plegamiento de un grupo particular de protenas que se depositan en el espacio extracelular en forma de agregados fibrilares insolubles; siendo estos los formadores de los amiloides. En ciertas circunstancias, las protenas pueden formar agregados que son muy diversos, tanto por su morfologa al microscopio electrnico como por su orden interno. Estas diferencias se reflejan en sus propiedades bioqumicas y en su capacidad para interactuar, con muy diversas consecuencias, con diferentes estructuras y componentes celulares.

9. Qu modelos se postulan para el posible mecanismo de conversin del estado nativo al estado fibrilar de una protena amiloidea?

HIPOTESIS SOBRE EL PLEGAMIENTO DE PROTEINAS (I)

Paradoja de Levinthal

Debido a los grados de libertad de una cadena polipeptdica, encontrar el estado nativo de una protena mediante bsqueda aleatoria entre todas las configuraciones posibles llevara muchsimo tiempo, mientras que las protenas se pliegan en nanosegundos. Ejemplo Polipptido de 100 Si cada pudiera adoptar 2 conformaciones (rotacion de los angulos y ), sin tener en cuenta las conformaciones de las cadenas laterales: 2100 1030 conformaciones Si la interconversin entre dos conformaciones durase 10-12s: Tiempo para que ocurra el plegamiento: 1030 * 10-12 = 1018s 1010 aos HIPTESIS SOBRE EL PLEGAMIENTO DE PROTENAS (II)

Consecuencia: El plegamiento de protenas no puede tener lugar por un proceso de prueba y error (trial & error). Solucin a la Paradoja de Levinthal El plegamiento de protenas est guiado por la formacin de interacciones locales entre aminocidos que actan como ncleos de plegamiento. Prueba a favor de esta hiptesis. Se han encontrado estados intermedios en el plegamiento de una protena. HIPTESIS TERMODINMICA: DOGMA DE AFISEN.

Autoensamblamiento La estructura nativa de una protena viene determinada por su secuencia de aminocidos, es nica, estable y se corresponde con un mnimo de energa libre. Hiptesis vlida para protenas globulares. Ejemplo

La ribonucleasa pancretica presenta 4 puentes disulfuro (Cys26 -Cys84, Cys58 Cys110, Cys40 - Cys95 & Cys65-Cys72). Desnaturalizacin con urea y mercaptoEtOH: se reducen los enlaces disulfuro. Renaturalizacin progresiva: se forman los enlaces disulfuro correctos. La RNasa pancretica se renaturaliza espontneamente.

CONCLUSIONES: Conocer los aspectos bsicos de una protena, siendo esta una de las biomoleculas ms importantes en el cuerpo humano. Identificar y diferenciar cada estructura de la protenas. Asi tambin , conocer las patologas que se presenta al no encontrarse protenas en el organismo, siendo esto una prueba de amiloidosis.