UNIVERSIDAD NACIONAL MAYOR DE SAN MARCOS FACULTAD DE CIENCIAS BIOLGICAS ESCUELA ACADMICO-PROFESIONAL DE MICROBIOLOGA Y PARASITOLOGA SYLLABUS SEMESTRE ACADMICO:

2013 I I. DATOS GENERALES 1.1. NOMBRE DEL CURSO 1.2. CDIGO DEL CURSO 1.3. CRDITOS 1.4. AO DE ESTUDIOS 1.5. NMERO DE HORAS 1.6. DURACIN DEL CURSO 1.7. HORARIO Y AMBIENTES 1.7.1.TEORA 1.7.2.PRCTICA : : : : : : : : FUNDAMENTOS DE MICROBIOLOGA B03113 04 III Ciclo (2 Ao) 6 horas (2 hrs. de teora y 4 hrs. de prctica) 17 semanas Martes 10-12 horas (Pab. Docencia, aula 308) Grupo 1: Martes y Jueves de 2-4 p.m. (Pab. Investigacin, Lab.S1) Grupo 2: Martes y Jueves de 4-6 p.m. (Pab. Investigacin, Lab.S1) Biologa Celular Profesora Principal D.E.

1.8. PRE-REQUISITOS : 1.9. PROFESORA RESPONSABLE : M.Sc. Ruth Garca de la Guarda 1.10. PROFESORES COLABORADORES: M.Sc. Dbora Alvarado Iparraguirre Dr. Pablo Ramrez Roca Dra. Egma Mayta Huatuco M.Sc. Enrique Mamani Zapana M. Sc. Tito Snchez Rojas Blgo. Fernando De la Cruz Calvo 1.11. PROFESORES INVITADOS M.Sc. Jorge Soto Villanueva :

Profesora Principal D.E. Profesor Principal D.E. Profesora Principal D. E. Profesor Auxiliar T. C. Profesor Auxiliar T. C. Profesor Auxiliar T. C.

Maestra en Microbiologa Avanzada Facultad de Biologa Universidad Autnoma de Madrid - Espaa : Jane Torres Chati Jos Vctor Licla Pariona Ela Wendy Contreras Panta Joe Hermosilla Jara Carmen Cecilia Matallana Oscar Enrique Panana Rodrguez Jaime Augusto Guzmn Crdova

1.12. ASISTENTES DE PRCTICA Myriam del Carmen Garca Rivera Nataly Roco Len Rojas Carlos Leonardo Quispe Sosa Ivette Alejandra Fuentes Quispe Joseph Vctor Orellana Katherine Margarita Larran Loayza Karen Lisett Orozco Romero

II. SUMILLA El curso enfoca el estudio de las estructuras y la organizacin subcelular de los microorganismos y el conocimiento de las asociaciones supramoleculares (virus, priones, etc.). Se tocarn aspectos bsicos de la diversidad microbiana y su importancia en los ecosistemas. El alumno adquirir destrezas para el manejo y reconocimiento primario de microorganismos dentro de las normas internacionales de bioseguridad y tcnicas generales del laboratorio microbiolgico.

III. OBJETIVOS DEL CURSO Al finalizar el curso el estudiante ser capaz de: Comprender y explicar la morfologa, estructura y funcin celular y subcelular de los procariontes y microorganismos eucariticos. Comprender y explicar aspectos bsicos de la estructura y diversidad viral, as como de las partculas subvirales denominadas viroides y priones. Comprender y explicar los fundamentos cientficos de la evolucin y diversidad microbiana, incluyendo la sistemtica y taxonoma. Comprender y explicar los aspectos bsicos de fisiologa, gentica, genmica y ecologa de los microorganismos. Conocer la biodiversidad de los principales grupos de microorganismos patgenos y de aquellos usados en la industria, agricultura y biorremediacin. Conocer y aplicar los principios de la seguridad biolgica y no biolgica en el laboratorio de microbiologa. Manipular correctamente los microorganismos en el laboratorio. Preparar adecuadamente los materiales usados en el laboratorio de microbiologa. Conocer los principios y aplicar los mtodos de esterilizacin y desinfeccin en el laboratorio de microbiologa. Conocer los fundamentos de los procedimientos y protocolos para el estudio de los microorganismos. Aplicar e interpretar los resultados de los procedimientos y protocolos para el estudio de los microorganismos. IV. EVALUACIN Se tomarn dos exmenes tericos y prcticos parciales cancelatorios para evaluar la capacidad de comprensin y de anlisis del alumno. La calificacin tendr una escala vigesimal (0-20). Los informes de prctica son grupales, se califican de 0 a 20 y debern ser entregados en formato electrnico (CD) una semana despus de terminada dicha prctica. Los informes consistirn de una breve introduccin (fundamento de la prctica), procedimiento empleado, resultados obtenidos, discusin (anlisis de sus resultados comparando con bibliografa), conclusiones y referencias bibliogrficas. Se tomarn pasos de prctica de 15 minutos con calificacin de 0-20. Primer examen terico y prctico : martes 14 de mayo (10-12 horas, aula 308) Segundo examen terico y prctico: martes 9 de julio (10-12 horas, aula 308) Examen sustitutorio : martes 16 de julio (10-12 horas, aula 308) Slo se podr sustituir un examen terico. No habr examen de prctica sustitutorio. El promedio final se obtendr aplicando la siguiente ponderacin: -Promedio de los exmenes tericos: 50% -Promedio de los exmenes prcticos: 40% -Promedio de los informes de prctica: 5% -Promedio de los pasos de prctica: 5% La asistencia es OBLIGATORIA. El alumno con 30% de inasistencias no tendr derecho a evaluacin final de acuerdo con las disposiciones vigentes de la UNMSM. V. METODOLOGA Para el desarrollo del curso se emplearn exposiciones tericas y clases prcticas de laboratorio. Las exposiciones tericas se harn con la finalidad de proporcionar al alumno los conceptos y fundamentos cientficos del tema a desarrollar segn lo programado en el syllabus. Las clases prcticas de laboratorio se harn para reforzar la informacin terica dada y para generar en el alumno destrezas manuales y habilidades requeridas para el trabajo cotidiano en el laboratorio de microbiologa. Los estudiantes sern distribuidos en grupos de trabajo cada uno de los cuales estarn bajo permanente supervisin de un profesor de prctica. Para ingresar al laboratorio es obligatorio que los estudiantes porten su mandil, guantes y mascarilla, como medida de bioseguridad. Cada uno de los estudiantes debe traer sus asas de siembra, encendedor, plumn marcador indeleble y pinza de madera o plstico para el trabajo de laboratorio. Asimismo, al finalizar la prctica los estudiantes deben usar jabn y alcohol para la higiene de sus manos.

VI. PROGRAMACIN
CALENDARIZACIN POR SEMANAS DE LAS CLASES TERICAS SEMANA TEORA DESCRIPCIN 1 Introduccin T1 La Microbiologa como ciencia. Comparacin entre clula procaritica y eucaritica. Virus, viroides, priones. 2 T2 Historia de la Microbiologa: desde van Leeuwenhoek hasta la Microbiologa molecular. 3 Estructura y funcin celular de procariontes: Bacteria T3-T4 Morfologa celular: Forma, tamao y agrupamiento celular. Estructura celular: paredes celulares, membrana externa de los gramnegativos. Filamentos de MreB (citoesqueleto). Biosntesis de peptidoglucano, formas defectuosas (formas L: protoplastos y esferoplastos). Membranas: funciones, sistemas de transporte y de exportacin. 4 T5-T6 Estructuras de superficie: Fimbrias, pili, adhesinas. Glicoclix: cpsula y slim layer. Flagelos, estructura y sntesis. Motilidad: flagelar, deslizante y otras. Quimiotaxis, fototaxis y otras taxias. Estructuras internas: Endosporas, estructura, esporulacin y germinacin. Organelos, grnulos de almacenamiento, vesculas de gas. 5 Estructura y funcin celular de procariontes: Archaea T7-T8 Morfologa celular. Estructura celular: paredes celulares, pseudopeptidoglucano, capas S o paracristalinas. Membranas: estructura y funcin. Diferencias y semejanzas con las Bacteria. Estructuras de superficie y estructuras internas. Genoma. Hbitat. Importancia de su estudio. 6 Estructura y funcin celular de los microorganismos eucariticos. Morfologa celular y estructuras caractersticas de los microorganismos T9-T10 eucariticos. Estructuras de superficie, esporas, motilidad. Hongos y protozoarios. 7 Los virus, viroides y priones. T11-T12 Morfologa y estructura viral. Elementos de replicacin viral. Diversidad viral. Partculas sub-virales: viroides y priones. Importancia. 8 14 / 05 PRIMER EXAMEN PROFESOR(A) Ruth Garca Dbora Alvarado

Ruth Garca Ruth Garca

Ruth Garca

Jorge Soto

Dbora Alvarado

Egma Mayta Ruth Garca

SEMANA TEORA DESCRIPCIN PROFESOR(A) 9 Biologa molecular, gentica y genmica microbiana T13 El cromosoma y los plsmidos. Conceptos de secuencias IS, transposones, Ruth Garca integrones e islas genmicas. T14 Recombinacin gentica: conceptos de transformacin, transduccin y Pablo Ramrez conjugacin. Ingeniera Gentica: conceptos de clonamiento molecular, vectores, PCR, enzimas de restriccin. Conceptos de genmica, metagenmica y protemica. 10 Nutricin, metabolismo y crecimiento microbiano T15 Requerimientos nutricionales. Fuentes de carbono y energa. Tipos Ruth Garca nutricionales. Diversidad metablica de los microorganismos. T16 11 T17 T18 12 T19 T20 13 14 T23-T24 T21-T22 Divisin celular y crecimiento exponencial bacteriano. Ciclo del crecimiento. Efecto del O2, pH, temperatura y disponibilidad de agua sobre el crecimiento. Antibiticos y quimioterpicos Definicin de antibiticos y quimioterpicos. Clasificacin. Mecanismos de accin. Fundamentos de la resistencia de los microorganismos a los antibiticos y quimioterpicos. Evolucin microbiana y diversidad Origen de la vida. Teora endosimbitica. Mtodos para determinar las relaciones evolutivas. Evolucin microbiana. Sistemtica y taxonoma. Concepto de especie. El rbol de la vida. Filogenia de Bacteria , Archaea y Eukarya . Diversidad de Bacteria. Diversidad de Archaea y de microorganismos eucariticos (Eukarya). Ecologa microbiana Ecosistemas microbianos. Microbiologa de suelos. Microbiologa de aguas continentales y marinas. Importancia de los microorganismos en su ambient e natural. Microbiologa aplicada Principales microorganismos patgenos de humanos, animales y plantas. Principales microorganismos usados en la industria, agricultura, biorremediacin y como herramientas para la ciencia. SEGUNDO EXAMEN EXAMEN SUSTITUTORIO Ruth Garca

Ruth Garca Ruth Garca

Dbora Alvarado Dbora Alvarado Dbora Alvarado

Dbora Alvarado

15 T25-26

Ruth Garca Ruth Garca Ruth Garca Ruth Garca

16 17

09 / 07 16 / 07

CALENDARIZACIN POR SEMANAS DE LAS CLASES PRCTICAS

SEMANA PRCTICA

1 2 3 P1 P2 P3 4 P4 P5 5 P6 P7 6 P8 P9 7 P10 P11 8 9 14 / 05 P12 P13 10 P14 P15 11 P16 P17 12 P18 P19 13 P20 P21 14 P22 P23 15 P24 P25

DESCRIPCIN Organizacin de las prcticas. Bioseguridad en el laboratorio de microbiologa. Lavado y preparacin de material microbiolgico. Control del Crecimiento Microbiano. Parte I. Mtodos de esterilizacin y desinfeccin en laboratorio. Preparacin de medios de cultivo. Distribucin de los medios de cultivo preparados y su control de calidad. Mtodos de siembra para el aislamiento de microorganismos, obtencin de cultivos puros y mantenimiento de cepas. Tcnicas aspticas. Caractersticas culturales: Morfologa de colonias. Actividad hemoltica. Crecimiento en caldo y en plano inclinado. Coloraciones microbianas: Gram y Ziehl Neelsen. Coloraciones especiales: endosporas. Estudio microscpico de hongos. Mtodos de cultivo: siembra en placas. Coloraciones especiales: flagelos, cpsula, pared celular, corpsculos metacromticos. Estudio microscpico de hongos. Lectura: caractersticas culturales. Microcultivos de hongos: Siembra. PRIMER EXAMEN Microcultivos de hongos: lectura. Sistemas de propagacin viral. Cultivo de microorganismos anaerobios. Siembra. Cultivo de microorganismos anaerobios. Lectura. Medicin del crecimiento microbiano: Enumeracin directa, enumeracin de microorganismos viables. Siembra. Medicin del crecimiento microbiano: Enumeracin directa, enumeracin de microorganismos viables. Lectura. Metabolismo microbiano: Hidrlisis de protenas y aminocidos. Siembra. Metabolismo microbiano: Hidrlisis de protenas y aminocidos. Lectura. Metabolismo microbiano: Hidrlisis de carbohidratos. Siembra. Metabolismo microbiano: Hidrlisis de carbohidratos. Lectura. Metabolismo microbiano: Hidrlisis de compuestos nitrogenados y enzimas de xido reduccin. Siembra. Metabolismo microbiano: Hidrlisis de compuestos nitrogenados y enzimas de xido reduccin. Lectura. Control del crecimiento microbiano. Parte II. Efecto de los agentes fsicos, qumicos, antibiticos y quimioterpicos. Siembra. Control del crecimiento microbiano. Parte II. Efecto de los agentes fsicos, qumicos y antibiticos. Lectura.

PROFESOR(A)* / ASISTENTES
R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz D. Alvarado, R. Garca, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz T. Snchez, R. Garca, D. Alvarado, E. Mamani, F. De la Cruz / J. Orellana, C. Matallana. F. De la Cruz, R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani T. Snchez, R. Garca, D. Alvarado, E. Mamani, F. De la Cruz / O. Panana, K. Orozco, K. Larran E. Mamani, R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, F. De la Cruz / O. Panana, K. Orozco, K. Larran T. Snchez, R. Garca, D. Alvarado, E. Mamani, F. De la Cruz / N. Len, O. Panana, K. Larran R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz / M. Garca, A. Fuentes, O. Panana T. Snchez, R. Garca, D. Alvarado, E. Mamani, F. De la Cruz / E. Contreras, K. Larran, K. Orozco D. Alvarado, R. Garca, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz / J. Hermosilla, A. Fuentes, J. Licla R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz / M. Garca, N. Len, E. Contreras D. Alvarado, R. Garca, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz / J. Hermosilla, A. Fuentes, J. Licla, J. Torres R. Garca D. Alvarado, R. Garca, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz / J. Hermosilla, A. Fuentes, J. Licla, J. Torres E. Mamani, R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, F. De la Cruz / E. Contreras, C. Matallana, J. Guzmn R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz / M. Garca, N. Len, C. Quispe, O. Panana R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz / M. Garca, N. Len, C. Quispe, O. Panana D. Alvarado, R. Garca, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz / N. Len, J. Licla, J. Torres, J. Orellana D. Alvarado, R. Garca, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz / N. Len, J. Licla, J. Torres, J. Orellana E. Mamani, R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, F. De la Cruz / N. Len, C. Quispe, K. Larran, J. Guzmn E. Mamani, R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, F. De la Cruz / N. Len, C. Quispe, K. Larran, J. Guzmn R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz / M. Garca, J. Torres, J. Hermosilla, K. Orozco R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz / M. Garca, J. Torres, J. Hermosilla, K. Orozco F. De la Cruz, R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani / A. Fuentes, E. Contreras, J. Orellana, C. Matallana F. De la Cruz, R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani / A. Fuentes, E. Contreras, J. Orellana, C. Matallana F. De la Cruz, R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani / J. Torres, J. Licla, C. Quispe, J. Guzmn E. Mamani, R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, F. De la Cruz / J. Torres, J. Licla, C. Quispe, J. Guzmn R. Garca R. Garca

SEGUNDO EXAMEN 16 09 / 07 EXAMEN SUSTITUTORIO 17 16 / 07 *Se ha subrayado el nombre del profesor (a) responsable de organizar la prctica.

VII. BIBLIOGRAFA RECOMENDADA TEXTOS: BAUMAN R. 2007. Microbiology. 2nd Edition. Pearson Education, Inc. USA. 778pp. BROOKS G.F., BUTEL J.S., MORSE S.A. Jawetz, Melnick, & Adelberg's Medical Microbiology, 23 edicin. The McGraw-Hill Companies. USA. DWORKIN M., FALKOW S., ROSENBERG E., SCHLEIFER K. H., STACKEBRANDT E. 2006. The Prokaryotes. A handbook on the biology of bacteria. 3 edicin. Vol.1-6. Springer Science+Business Media, Inc. New York, USA. MADIGAN, M.T., MARTINKO, J.M. 2006. Brock Biology of Microorganisms. 11 edicin. Pearson Education, Inc. USA. 992pp. MAC FADDIN, J. 2003. Pruebas bioqumicas para la identificacin de bacterias de importancia clnica. 3 Edicin, Editorial Mdica Panamericana, S.A. Madrid, Espaa, 850pp. NESTER, E., ANDERSON, E., ROBERTS, C., PEARSALL, N., NESTER, M., HURLEY, D. 2004. Microbiology. A Human Perspective. 4 edicin. McGraw-Hill, New York. 890pp. OGUNSEITAN O. A. 2005. Microbial Diversity: Form and Function in Prokaryotes. Blackwell Publishing. USA. 300pp. WIN W.C., ALLEN S.D., JANDA W.M., KONEMAN E.W., PROCOP G.W., SCHRECKENBERGER P.C., WOODS G.L. 2008. Koneman Diagnstico Microbiolgico: Texto y atlas en color. 6 edicin. Editorial Mdica Panamericana. Buenos Aires, Argentina. 1475pp.

ALGUNOS SITIOS WEB DE INTERS

www.biomedcentral.com www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/

www.cdc.gov/ www.nih.gov/ www.who.int/ www.microbelibrary.org

www.asm.org/