De tomos y Molculas Una introduccin al estudio de los seres vivos

Los seres humanos nos caracterizamos por nuestra infinita capacidad de explorar, reconocer, descubrir y aprender, y gracias a esta condicin se ha acumulado tal cantidad de saberes que nos han brindado la posibilidad de alcanzar un profundo conocimiento de nosotros mismos. Nuestra naturaleza biolgica, tanto a nivel estructural como funcional, ha sido objeto permanente del ojo crtico del investigador, que poco a poco y con paciencia ha buscado desentraar los secretos de la vida y de la muerte. La medicina y quienes la ejercen, se benefician de manera permanente de los nuevos descubrimientos en diversas reas del conocimiento relacionadas con la vida, pues tales avances potencian la capacidad diagnstica y teraputica. As pues para aquellos que pretenden ser conocedores de nuestra biologa, es preciso indicarles que el camino ms efectivo no es necesariamente ni el ms largo ni el ms difcil, es quizs aquel que se recorre con una mente inquieta, una mente que no tema preguntar, que no se avergence de su ignorancia y que busque, al mejor estilo de los sabuesos, las respuestas. Para empezar podramos aventurar algunas preguntas Qu tipo de materiales nos constituyen? Cmo se organizan estos materiales? Qu tipo de fuerzas garantizan la conservacin de nuestra integridad?

Qu Tipo De Materiales Constituyen A Los Seres Vivos?

Todos los seres vivos, incluyendo por supuesto a los humanos, estn constituidos por tomos. El cuerpo humano es el resultado de una organizacin especial de estas partculas que en primera instancia y como resultado de su unin dan lugar a molculas, que a su vez conforman clulas. Las clulas por su parte se organizan en tejidos y stos en rganos. Los sistemas resultan a partir de la unin de rganos y finalmente nuestro organismo se presenta como un complejo constituido por varios sistemas. Hemos citado algunos de los niveles de organizacin de la materia, los cuales se presentaron en orden crecientes de complejidad en la siguiente figura:

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Qu son los tomos?

Talvez la primera definicin que relacionamos con el concepto de tomo nos habla de estas partculas como aquellas unidades estructurales de la materia. Veamos algunos ejemplos de definiciones parecidas que nos aclararan la anterior

Por tanto.

Hagamos una breve pausa para asegurarnos de entender lo que esto significa. Aceptar como cierta la afirmacin anterior implica que todo aquello que consideremos materia est conformado por ATOMOS, as pues si materia es todo aquello que ocupa un lugar en el espacio, al menos estaremos de acuerdo en afirmar que los seres humanos somos materia y por tanto estamos hechos de tomos.

La estructura bsica del tomo ha sido propuesta por diferentes investigadores, entre los que se incluyen Dalton, Thomson, Rutherford, Bohr y Schrondinger. Todos ellos han hecho aportes significativos para la construccin del modelo atmico actual, sin embargo el modelo que sin entrar en contradicciones con los nuevos descubrimientos permite comprender la forma en cmo se unen los tomos para constituir molculas es el que se presenta en la siguiente figura, es decir el modelo de Bohr. Segn este modelo, las subparticulas atmicas, es decir, los protones, los electrones y los neutrones, se organizan de la siguiente manera:

Los protones y los neutrones conforman el ncleo atmico, en tanto los electrones orbitan alrededor de este ncleo.

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Actividad 1
Las respuestas a los ejercicios se presentan al final con el propsito de que realices la retroalimentacin correspondiente. Toda diferencia que encuentres con respecto a las respuestas dadas puede ser discutida en la semana de induccin. 1. Completa el siguiente cuadro con la ayuda de una tabla peridica TIPO DE TOMO Fsforo Sodio 19 S 20 O Hidrogeno 6 7 2. Presenta al menos dos conclusiones obtenidas a partir del ejercicio 3. Organiza en forma ascendente de Z los siguientes tipos de tomos: a. Aluminio b. Bromo c. Cobre d. Fluor e. Hierro f. Yodo SMBOLO Cl NMERO ATMICO (Z) NMERO DE PROTONES NUMERO DE ELECTRONES

Nmero Atmico, Nmero de Masa e istopos

En la actualidad se conocen alrededor de 118 tipos diferentes de tomos. Pero en qu se diferencia un tipo de tomo de otro? Cada tipo de tomo cuenta con un nmero caracterstico de protones, que es igual al nmero de electrones. Los tomos de Los tomos de Los tomos de Los tomos de HIDROGENO LITIO OXIGENO CARBONO cuentan con cuentan con cuentan con cuentan con 1 protn 3 protones 8 protones 6 protones y y y y 1 electrn 3 electrones 8 electrones 6 electrones

De esta manera todos los tomos pueden ser identificados por el nmero de protones que contienen, es decir, por el numero atmico (Z). Sabemos que un tomo es de Nitrgeno cuando confirmamos que su nmero atmico es 7, en otras palabras, cada tomo en el universo que contenga 7 protones es un tomo de nitrgeno. En una tabla peridica es posible consultar el nmero atmico de los diferentes tipos de tomos. El nmero de masa (A) es otro parmetro importante para conocer algunas propiedades del tomo. En este caso A corresponde al peso atmico que equivale a la suma de los protones y neutrones presentes en el ncleo de un tomo. Los electrones no aportan un peso significativo a la masa atmica y por esa razn no son considerados.

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Masa de las partculas subatmicas Partcula Electrn Protn Neutrn Masa (g) 9.10939 x 10-28 1.67262 x 10-24 1.67493 x 10-24

De lo anterior se pueden deducir las siguientes equivalencias: Masa Atmica (A) = Numero de protones + Nmero de neutrones Masa Atmica (A) = Nmero atmico (Z) + Nmero de neutrones Aun cuando todos los tomos de un mismo tipo tienen el mismo numero de protones y electrones, NO todos tienen el mismo nmero de neutrones. Por esta razn NO todos los tomos de un mismo tipo tienen la misma masa. As cuando encontramos dos tomos de un mismo tipo que tienen el mismo Z, pero que difieren en A decimos que son Istopos. La forma aceptada para denotar el nmero atmico y el nmero de masa de un tomo X es como sigue:

Por ejemplo, existen tres istopos de hidrogeno que se muestran a continuacin: ISTOPO Propio o Hidrgeno normal Hidrogeno - 1 Deuterio o Hidrgeno pesado Hidrogeno - 2 Tritio o Hidrgeno superpesazo Hidrgeno - 3 DENOTACIN NMERO DE ELECTRONES 1 NMERO DE PROTONES 1 NMERO DE NEUTRONES 0 MASA ATMICA A 1

Las propiedades qumicas de los tomos, entre las que se incluyen principalmente los tipos de reacciones en las que ellos participan, estn determinadas principalmente por los protones y electrones.

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Actividad 2
4. Teniendo en cuenta las siguientes equivalencias establece una formula para determinar el numero de neutrones a partir de Z y A. Denomina N al nmero de neutrones. Masa Atmica (A) = Numero de protones + Nmero de neutrones Masa Atmica (A) = Nmero atmico (Z) + Nmero de neutrones 5. Segn la definicin de Istopo presentada Cul de los siguientes aspectos varia entre dos istopos? a. El nmero atmico b. El nmero de electrones c. La masa atmica d. El nmero de protones 6. completa el siguiente cuadro con sus conocimientos sobre istopos Tipo de tomo Carbono Carbono - 14 Nitrgeno Nitrgeno-18 Denotacin Nmero Atmico Masa Atmica Nmero de Protones Nmero de Neutrones Nmero de Electrones

6 18 8 15 16 32 18
Por qu los tomos forman molculas?

Fsforo

15

Fsforo

Fsforo

Pareciera una pregunta innecesaria pero responderla nos permitir comprender las fuerzas que estn presentes al momento de conformarse una molcula a partir de la unin de dos o ms tomos iguales o diferentes. Al finalizar las siguientes sesiones la respuesta ser fcil de deducir.

Configuracin electrnica y electrones de valencia

Los tomos tal como los hemos estudiado hasta ahora, cuentan con partculas subatmicas llamadas electrones, que se caracterizan por poseer carga negativa. Estos electrones se encuentran acomodados alrededor del ncleo atmico en las denominadas capas o niveles energticos.

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Existen 7 capas o niveles de energa y cada una de ellas cuenta con subniveles (que pueden ser de cuatro tipos: s, p, d, f). En cada subnivel hay un numero determinado de orbitales. Se ha establecido que para el subnivel s hay 1 orbital, para el subnivel p hay 3 orbitales, para el subnivel d hay 5 orbitales y para el subnivel f hay 7 orbitales.

Actividad 3
7. Teniendo en cuenta que cada orbital admite mximo 2 electrones, completa la siguiente tabla: Nivel 1 Subnivel Orbital s s s s px 2 p py pz s s px p py pz 3 dxy dyz d dxz dx2-y2 dz2 Nota: el nmero mximo de electrones por nivel puede calcularse con la expresin 2n2, donde n es el nivel. Numero mximo de electrones en los orbitales Numero mximo de electrones por subnivel Numero mximo de electrones por nivel

Actividad 4
8. Deduce al menos tres conclusiones de la tabla anterior.

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La distribucin de los electrones de un tomo en los distintos niveles de energa se conoce como configuracin electrnica de dicho tomo. Los electrones pertenecientes al tomo se organizan en los distintos niveles y subniveles por orden creciente de energa hasta ocuparlos completamente. El siguiente grfico nos indica dicho orden: En la nomenclatura empleada,

y se lee hay 1 electrn presente en el subnivel s del nivel 1

Una configuracin electrnica de 1s2 2s1 por ejemplo, nos expresa varias cosas: 1. Que el tomo tiene 3 electrones 2. Que los 3 electrones estn distribuidos en dos niveles. 3. Que en el ltimo nivel solo hay 1 electrn y est ubicado en el subnivel s 4. Que el tomo tiene Z=3 (Z: Nmero Atmico)

Cmo se describe la configuracin electrnica de un tomo?

La mejor manera de responder a esta pregunta es ejemplificando el proceso. Veamos pues la construccin de la configuracin electrnica del Calcio, cuyo Z = 20. 1. El nmero atmico nos indica que este tomo tiene 20 protones y por consiguiente cuenta con 20 electrones. 2. Los 20 electrones se organizarn en los distintos niveles y subniveles en orden ascendente de energa. 3. En primer lugar se completa el nivel 1, que cuenta con un subnivel s, el cual tiene una capacidad mxima para 2 electrones: 2

1s

4. A continuacin se ocupa el nivel 2, que cuenta con un subnivel s y tres subniveles p, lo cual le permite albergar hasta 8 electrones (dos en el subnivel s y dos en cada uno de los tres subniveles p)

5. Hasta este punto se ha descrito la forma en como se organizaron los primeros 10 electrones. Los 10 restantes ocuparan los dems niveles considerando siguiendo el principio de construccin de Aufbau, segn el cual solo se pueden ocupar los orbitales con un mximo de dos electrones, en orden creciente de energa orbital: los orbitales de menor energa se llenan antes que los de mayor energa. A contnuacin se ofrece el orden creciente de energa orbital, incluyendo el nmero mximo de electrones por subnivel:

1s2 2s2 2p6 3s2 3p6 4s2 3d10 4p6 5s2 4d10 5p6 6s2 4f14 5d10 6p6 7s2 5f14 6d10 7p6
Fundamentos Biolgicos de la Vida Humana 7

6. Asi pues la configuracin electrnica del Calcio es: 2 2 6 2

1s 2s 2p 3s 3p64s2

El conocer la configuracin electrnica de un tomo nos permite establecer cuantos electrones existen en el nivel ms externo, lo cual es muy importante pues son precisamente estos electrones, llamados electrones de valencia, los que intervienen en los enlaces con otros tomos para formar molculas. Ejemplo: el oxgeno tiene Z=8, es decir tiene 8 protones y por tanto 8 electrones. Siguiendo la indicacin del grfico anterior, la configuracin electrnica de este tipo de tomos ser:

1s22s22p4
De lo anterior podemos observar lo siguiente: 1. Que de los 8 electrones presentes en los tomos de oxgeno, 6 estn ubicados en el ltimo nivel, en este caso el nivel 2, es decir, hay 6 electrones de valencia. 2. Que aunque el subnivel p acepta 6 electrones, en este caso solo se ocuparon 4 posiciones 3. Que haran falta 2 electrones para completar todos los espacios disponibles.

Actividad 5
9. Completa la siguiente tabla: Numero de electrones de valencia

tomo

Smbolo

Configuracin electrnica

Numero de niveles ocupados

Carbono Oxgeno 2 7

1s22s22p6 3s23p3
Potasio

1s22s22p63s1
Hidrgeno 3 7

Regla del Octeto

La regla del octeto propuesta por Lewis establece que un tomo diferente del hidrgeno tiende a formar enlaces hasta estar rodeado por ocho electrones de valencia pues es en este momento cuando alcanza su mxima estabilidad. Teniendo en cuenta esto ya nos es fcil empezar a comprender lo que explica la unin entre dos o ms tomos para constituir las molculas. Dicho de otro modo, en este afn por estabilizarse algunos tomos cedern sus electrones, otros los recibirn e incluso compartirn electrones con otros tomos. Cada

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operacin de estas ceder, aceptar o compartir electrones genera la interaccin de los tomos que al mantenerse unidos conforman enlaces qumicos. Si bien es cierto que la regla del octeto funciona principalmente para los elementos del segundo perodo de la tabla peridico, no es propsito de esta gua hacer alusin a las excepciones.

Electronegatividad y enlaces qumicos

Por ltimo y para cerrar nuestra comprensin de la formacin de los enlaces es preciso hacer referencia al concepto de electronegatividad. Durante la formacin del enlace qumico entre dos tomos, los electrones son cedidos, aceptados o compartidos, pero an en este ltimo caso puede presentarse que un tomo atraiga con mayor fuerza los electrones, generando una carga negativa de manera temporal a su alrededor. As pues se dice que la electronegatividad es un indicador de la fuerza con la que un tomo atrae los electrones hacia s. A continuacin se presenta el aumento de las electronegatividades de los elementos en la tabla peridica:

Los valores de las electronegatividades de los elementos oscilan desde 1.0 hasta 4.0 segn la escala propuesta por Linus Pauling. Entre los principales tipos de enlaces observados en las biomolculas se incluyen: El enlace inico: es aquel que se establece a partir de la atraccin electrosttica (entre cargas opuestas) entre dos tomos en donde uno ha cedido electrones (quedando con carga positiva catin) y el otro los ha aceptado (quedando con carga positiva anin). Ejemplo: Formacin del Cloruro de Sodio (NaCl) Elemento Nmero Atmico Configuracin electrnica Electrones de valencia electronegatividad Estructura de Lewis Sodio (Na) Elemento Nmero Atmico Configuracin electrnica Electrones de valencia electronegatividad Estructura de Lewis Cloro (Cl)

11 1s22s22p63s1
1 0.9

17 1s22s22p63s23p5
7 3.0

La estructura de Lewis es til cuando se discute sobre enlaces qumicos, debido a que solo muestra los electrones de valencia, que son los que precisamente se ven implicados en tales enlaces. Los puntos o asteriscos alrededor del smbolo indican el nmero de electrones de valencia.

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Al entrar en contacto el sodio con el cloro, ste ltimo atrae con mayor fuerza el nico electrn del sodio (note la diferencia de electronegatividades) y de esa manera se constituye en un anin. El sodio por su parte resulta un catin y la atraccin se presenta inevitablemente.

El enlace covalente: es un enlace en el que dos electrones son compartidos por dos tomos. El grado en el que estos tomos comparten dichos electrones da lugar a los enlaces que se conocen como covalentes polares y covalentes no polares. Un ejemplo de enlace covalente no polar es el que se verifica entre dos hidrgenos:

Los enlaces covalentes polares son aquellos que se presentan entre tomos que tienen distinta electronegatividad como el que se da entre el carbono y el oxigeno en el dixido de carbono:

La siguiente tabla nos es til a la hora de predecir el tipo de enlace que se dar entre dos tomos, considerando tan solo la diferencia de electronegatividades: Diferencia de electronegatividades entre los tomos del enlace Igual a cero 0.1 1.6 Mayor o igual a 1.7 NOTA: Los valores incluidos en esta tabla pueden variar de un autor a otro. Tipo de enlace Covalente no polar Covalente polar inico

Actividad 6
10. Establece la estructura de lewis para las siguientes molculas: a. NH3 (Amonio) b. H2O (Agua) c. BrCl (Cloruro de Bromo) d. H3PO4 (cido Fosfrico) Dato clave: consulte sobre los enlaces covalentes coordinados e. CH4 (Metano) f. HCl (cido clorhidrico)

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11. Clasifica los siguientes enlaces como inicos, covalentes polares o covalentes no polares a. KF (Fluoruro de Potasio) b. O2 (Oxgeno) c. HBr (cido bromhidrico) Para los puntos 11 a 15 tenga en cuenta el siguiente grfico que corresponde a la formula molecular del aminocido cisteina: 12. Tipo de enlace: ____________________ 13. Tipo de enlace: ____________________ 14. Tipo de enlace: ____________________ 15. Tipo de enlace: ____________________ 16. Tipo de enlace: ____________________ 17. Entre los enlaces 11 a 15 de la grfica seale el enlace covalente ms polar: ___ 18. Entre los enlaces 11 a 15 de la grfica seale el enlace covalente menos polar: ___ 19. Entre los enlaces 11 a 15 de la grfica seale los enlaces inicos: ___ Indique en los siguientes puntos, si las afirmaciones son falsas (f) o verdaderas (v): 20. Todos los hidrgenos presentes en la molcula resultan con carga positiva permanente. 21. Los enlaces covalentes no polares observados en la molcula solo se presentan entre dos carbonos.

**Es importante que finalizado el estudio de esta gua escribas al menos 5 conclusiones.

** No olvides traer tu tabla peridica para el examen que presentaras en la semana de induccin. Bibliografa
CHANG, R. Y COLLEGE, W. Qumica. 2002. 7 Edicin. McGraw-Hill. MORRISON, R Y BOYD, R. Qumica Orgnica. 1998. 5 Edicin. Addison Wesley Longman

La mayor nobleza de los hombres es levantar su obra en medio de la devastacin, sostenindola infatigablemente, a medio camino entre el desgarro y la belleza Ernesto Sbato. Antes del fin

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Solucin a los ejercicios

1. Completa el siguiente cuadro con la ayuda de una tabla peridica Tipo de tomo Fsforo Cloro Sodio Potasio Azufre Calcio Oxigeno Hidrogeno Carbono Nitrgeno Nmero Atmico (Z) 15 17 11 19 16 20 8 1 6 7 Nmero de Protones 15 17 11 19 16 20 8 1 6 7 Numero de electrones 15 17 11 19 16 20 8 1 6 7

Smbolo P Cl Na K S Ca O H C N

2. Presenta al menos dos conclusiones obtenidas a partir del ejercicio a. A partir del nmero atmico de un tomo puede determinarse el nmero de protones de dicho tomo b. Al conocer el nmero de electrones de un tomo es posible saber su nmero atmico c. Los distintos tipos de tomos se diferencian unos de otros por su nmero atmico 3. Organiza en forma ascendente de Z los siguientes tipos de tomos: a. 13 Aluminio b. 9 Fluor c. 26 Hierro d. 29 Cobre e. 35 Bromo f. 53 Yodo 4. Teniendo en cuenta las siguientes equivalencias establece una formula para determinar el numero de neutrones a partir de Z y A. Denomina N a el nmero de neutrones. Masa Atmica (A) = Numero de protones + Nmero de neutrones Masa Atmica (A) = Nmero atmico (Z) + Nmero de neutrones Respuesta: N=A-Z

5. Segn la definicin de Istopo presentada Cul de los siguientes aspectos varia entre dos istopos? a. El nmero atmico b. El nmero de electrones c. La masa atmica d. El nmero de protones

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6. completa el siguiente cuadro con sus conocimientos sobre istopos Tipo de tomo Carbono Carbono - 14 Nitrgeno Nitrgeno-18 Oxgeno Oxgeno -15 Fsforo Fsforo 31 Fsforo Fsforo 32 Fsforo Fsforo - 33 7. Teniendo en cuenta que cada orbital mximo 2 electrones, completa la siguiente tabla: Nivel 1 Subnivel Orbital Numero mximo de electrones en los orbitales Numero mximo de electrones por subnivel 2 2 6 2 6 18 10 Numero mximo de electrones por nivel 2 15 33 15 18 15 15 32 15 17 15 15 31 15 16 15 8 15 8 7 8 7 18 7 9 7 DENOTACIN Nmero Atmico 6 Masa Atmica 14 Numero Protones 6 Nmero Neutrones 8 Nmero Electrones 6

s s p s p

s s px py pz s px py pz dxy dyz dxz dx2-y2 dz2

2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2

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8. Deduce al menos tres conclusiones de la tabla anterior: a. Los orbitales pueden ser ocupados por mximo dos electrones. b. El subnivel s puede ser ocupado por mximo dos electrones, mientras que en los subniveles p y d es posible organizar 6 y 10 electrones respectivamente. c. A mayor nivel de energa, mayor capacidad para contener electrones. 9. Completa la siguiente tabla: Numero de electrones de valencia 4 6 7 5 1 1 1 7

tomo

Smbolo

Configuracin electrnica

Numero de niveles ocupados 2 2 2 3 4 3 1 3

Carbono Oxgeno Nitrogeno Fosforo Potasio Sodio Hidrgeno Cloro

C O N P K Na H Cl

6 8 7 15 19 11 1 17

1s22s22p2 1s22s22p4 1s22s22p5 1s22s22p6 3s23p3 1s22s22p6 3s23p64s1 1s22s22p63s1 1s1 1s22s22p63s23p5

10. Establece la estructura de lewis para las siguientes molculas (no se incluyen respuestas) 11. clasifica los siguientes enlaces como inicos, covalentes polares o covalentes no polares a. inico b. covalente no polar c. covalente polar 12. 13. 14. 15. 16. enlace covalente no polar enlace polar enlace covalente no polar enlace polar enlace polar 17. 18. 19. 20. 21. enlace 15 enlaces 11 y 13 no hay enlaces inicos falso falso

**Cualquier diferencia en las respuestas podr discutirse en la primera semana del inicio de semestre.

Preparado y revisado por Magali Narvez Coordinadora Ciencias Bsicas F.U.S.M - Julio 2010

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