Las interacciones moleculares y la biologa

3/4/2013 y 10/4/2013

Alberto Gonzalez Fsica Biolgica (2013)

Evaluaciones (600 puntos en total)

3 exmenes parciales (50%): terico-prcticos, no cumulativos, en mayo, agosto y noviembre. (300p.=100p.*3) 12 cuestionarios al comienzo de la clase (20%). (120p.=10p.*12) 6 trabajos prcticos de resolucin de problemas. Una semana. (30%). (180p.=30p.*6) Puntaje extra: Proyecto especial optativo (60p.). Regularizacin: 360 puntos
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Clase 3: Las interacciones moleculares y la biologa (C. 6 ECE)

1) 2) 3)

4) 5) 6)

Las cuatro fuerzas fundamentales del universo. Propiedades fsicas del agua. Enlaces qumicos y fuerzas intermoleculares: enlace covalente, enlace inico, enlaces de hidrgeno, fuerzas de van der Waals y efecto hidrofbico. Molculas en solucin. Unidades de energa: kcal, Joule, eV. Reacciones qumicas y energas de activacin.

Las cuatro fuerzas fundamentales del universo

1) 2) 3) 4)

Fuerza gravitatoria Fuerza electromagntica Fuerza nuclear fuerte Fuerza dbil

La fuerza dbil y la asimetra derechaizquierda.

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Digresin: Agua en el Planeta Tierra

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Cunta agua hay en el planeta Tierra?

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Distribucin del agua en la Tierra

http://es.wikipedia.org/wiki/Agua

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Contenido de agua del cuerpo humano ~71% en peso

Sangre: ~>90% Riones: ~82% Msculos: ~75% Hgado: ~69% Huesos: ~22%

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Propiedades fsicas del agua (1 de 2)

Estado

lquido a temperatura ambiente. Agua vs. metano. Calor especfico inusualmente grande. Calor latente inusualmente grande:
Barril de agua en un invernadero. Cubitos de hielo para refrigerar.
Expansin

trmica peculiar: entre 0C y 3,98C el agua aumenta su densidad.

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Propiedades fsicas del agua (2 de 2)

Solvente

universal. Tensin superficial alta. Constante dielctrica alta.

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Densidad del agua vs. temperatura

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Agua: Punto de ebullicin inusualmente alto

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Agua: Punto de fusin inusualmente alto

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La molcula de agua

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 Enlace

covalente: ~100 kcal/mol. Molcula POLAR:

Distancia enlace H-O: ~1

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Enlace puente de hidrgeno

~3 kcal/mol
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Importancia del enlace puente de hidrgeno

Propiedades

fsicas del agua. Replicacin del ADN. Estructura de protenas.

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Etanol y agua

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Amidas y agua

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No todas las molculas son polares

Ej.: octano

(gasolina)

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Enlace inico
Una

carga electrnica entera cedida (perdida). Fuerte en los slidos. Dbil en solucin.

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Fuerzas de van der Waals

Entre

dos dipolos permanentes (Fuerza de Keesom). Entre un dipolo permanente y un dipolo inducido (Fuerza de Debye). Entre dos dipolos inducidos (Fuerza de London).

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Fuerzas de van der Waals

~1 kcal/mol
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Potencial de Lennard-Jones (L-J) (emprico)

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Algunas limitaciones del potencial de L-J

Dos

parmetros. Simtrico. Sin justificacin terica para el exponente 12 de la parte repulsiva.

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Las fuerzas de van der Waals y los gecos

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Molculas en solucin: Solvatacin

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Efecto hidrofbico

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Efecto hidrofbico: explicacin

Entropa: cantidad fsica relacionada con el nmero de estados diferentes posibles. Las molculas de agua, alrededor de la molcula no-polar tienen MENOS entropa (MENOS opciones, MS ordenadas). Los sistemas tienden a maximizar la entropa (el nmero de estados diferentes posibles que pueden ocupar). La agregacin de molculas no-polares entre ellas minimiza el nmero de molculas de agua con menos entropa (las que estn sobre las molculas no-polares), maximizando por lo tanto la entropa del sistema.

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Aclaracin: Si bien es cierto que las molculas no-polares de octano pierden entropa al juntarse (es decir, estaran ms desordenadas si estuviesen separadas), esta prdida de entropa no contrarrestra el aumento de entropa del sistema que resulta de liberar las molculas de agua de la jaula alrededor de las molculas nopolares.

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Efecto hidrofbico: resumen

Se

observa cuando tenemos molculas nopolares inmersas en un medio acuoso. Las molculas no-polares NO pueden formar puentes hidrgeno con las molculas de agua. Las molculas de agua alrededor de las molculas no-polares estaran en un estado ms ordenado. La fuerza hidrofbica no es en realidad una fuerza, ni un enlace. El efecto hidrofbico aumenta con la temperatura.
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Covalente

Hidrgeno Inico

van der Waals

Hidrofbico

Energa necesaria para romperlo ~100 kcal/mol ~3

~5

~1

~3

Electrones compartidos fuerte

Agua-agua orgnicoagua orgnicoorgnico dbil

Transferencia de carga Puede atraer enlace H Fuerte en cristales dbil

Dipolo inducido fluctuante Corto alcance dbil

No es un enlace efecto entrpico slo funciona en agua dbil

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Magnitud: Energa Unidades: kcal, kJ, eV

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Uniones qumicas y transferencia de energa

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Los enlaces qumicos almacenan la energa que se us para formarlos: verdadero o falso?

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Tarea
Leer

el captulo 3 (ECE).

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