La teora de la evolucin de Darwin es la idea ampliamente sostenida de que la vida est relacionada y que ha descendido de un ancestro comn.

Los pjaros y las bananas, los peces y las flores -- todos estn relacionados. La teora general de Darwin supone el desarrollo de la vida a partir de la no-vida y estresa un "descenso con modificacin" puramente naturalista (no dirigido). Es decir, criaturas complejas evolucionaron de ancestros ms simples naturalmente, con el paso del tiempo. Resumidamente, a medida que ocurren mutaciones genticas al azar dentro del cdigo gentico de un organismo, las mutaciones beneficiales son preservadas, porque ellas ayudan a la sobrevivencia -- un proceso conocido como "seleccin natural." Estas mutaciones beneficiales son pasadas a la siguiente generacin. Con el tiempo, las mutaciones beneficiales se acumulan y el resultado es un organismo completamente diferente (no slo una variacin del original, sino una criatura completamente diferente). Aunque la teora de la evolucin de Darwin es un arquetipo relativamente joven, la visin del mundo evolucionista en s es tan vieja como la antigedad. Antiguos filsofos griegos, tales como Anaximander postularon el desarrollo de la vida a partir de la no-vida y el descenso evolucionista del hombre a partir de animales. Charles Darwin simplemente trajo algo nuevo a la vieja filosofa -- un mecanismo plausible llamado "seleccin natural." La seleccin natural acta para preservar y acumular ventajosas mutaciones genticas menores. Suponga que un miembro de una especie desarroll una ventaja funcional (le crecieron alas y aprendi a volar). Su cra heredara esa ventaja y la pasara a sus cras. Los miembros inferiores (desfavorecidos) de la misma especie morirn gradualmente, dejando slo a los miembros superiores (favorecidos) de las especies. La seleccin natural es la preservacin de una ventaja funcional que permite a la especie competir mejor en su hbitat. La seleccin natural es el equivalente naturalista a la cra domstica. A travs de los siglos, los criadores humanos han producido cambios dramticos en poblaciones animales domsticas al seleccionar individuos para la cra. Los criadores eliminan gradualmente rasgos indeseables con el tiempo. Similarmente, la seleccin natural elimina gradualmente, con el tiempo, a las especies inferiores. La teora de la evolucin de Darwin es un lento proceso gradual. Darwin escribi: "...La seleccin natural slo acta tomando ventaja de pequeas variaciones sucesivas; ella nunca da un salto repentino, sino que debe avanzar con pasos cortos y seguros, aunque lentos.1 De esta manera, Darwin reconoce que: "Si se pudiera demostrar la existencia de cualquier rgano complejo, el cual no pudo haber sido formado por numerosas y pequeas modificaciones sucesivas, mi teora se desbaratara completamente.2 Tal rgano complejo sera conocido como un "sistema irreduciblemente complejo". Un sistema de complejidad irreducible es aquel compuesto de mltiples partes, todas las cuales son necesarias para el funcionamiento del sistema. Si tan slo faltara una parte, el sistema entero dejara de funcionar. Cada parte es integral.3 Por esto, tal sistema no pudo haber evolucionado lentamente, parte por parte. Una trampa comn de ratones es un ejemplo no-biolgico ordinario de complejidad irreducible. Est compuesta de cinco partes bsicas: un gancho (para sostener la carnada), un poderoso resorte, una varilla delgada llamada "el martillo," una barra de seguridad, para mantener al martillo en su sitio, y una plataforma para armar la trampa. Si faltara cualquiera de esas partes, el mecanismo no funcionar. Cada parte es integral. La trampa de ratones es irreduciblemente compleja. La Teora de la Evolucin de Darwin es una teora en crisis a la luz de los tremendos avances que hemos hecho en biologa molecular, bioqumica, y gentica en los pasados cincuenta aos. Ahora sabemos que existen de hecho decenas de miles de sistemas irreduciblemente complejos a nivel celular. La complejidad especificada permea al mundo biolgico microscpico. El bilogo molecular Michael Denton, escribi: "Aunque las ms minsculas clulas bacterianas son increblemente pequeas, pesando menos de 10-12 gramos, cada una es de hecho, una autntica fbrica micro-miniaturizada, conteniendo miles de piezas exquisitamente diseadas de intrincada maquinaria molecular, constituida en su totalidad por cien mil millones de tomos, mucho ms complicada que ningn mecanismo construido por el hombre y absolutamente sin paralelo en el mundo inanimado."

El Ramapitheco fue ampliamente reconocido como un ancestro directo de los humanos. Ahora se ha establecido que era simplemente un tipo extinto de orangutn. El Hombre de Piltdown fue exageradamente promocionado en publicaciones como el eslabn perdido por ms de 40 aos. Era un fraude basado en la parte superior de un crneo humano y la mandbula de un orangutn. El hombre de Nebraska fue un fraude basado en un slo diente perteneciente a un tipo raro de cerdo. El hombre de Java estaba basado en una evidencia incompleta de un fmur, la parte superior de un crneo y tres dientes encontrados alrededor de una extensa rea en el transcurso de ms de un ao. Result que los huesos fueron encontrados en un rea de restos humanos, y ahora el fmur es considerado humano y la parte superior del crneo proviene de un mono grande. El Hombre Neandertal era descrito tradicionalmente como un hombre-mono encorvado. Ahora se ha aceptado que la presunta postura se debi a una enfermedad y que el Neandertal es slo una variacin de la especie humana. El Australopitheco afarensis, o "Lucy," ha sido considerado un eslabn perdido por aos. Sin embargo, estudios del odo interno, crneo y huesos han mostrado que ella era meramente un chimpanc pigmeo que camin un poco ms derecho que otros monos. Ella no estaba en camino de convertirse en humana. El Homo-erectus ha sido encontrado alrededor de todo el mundo. Es ms pequeo que el humano promedio de hoy, con una cabeza y cavidad cerebral proporcionalmente ms pequea. Sin embargo, el tamao del cerebro est dentro del rango de la gente de hoy, y los estudios del odo medio han demostrado que era tan igual al Homo sapiens actual. Sus restos son encontrados por todo el mundo en la misma proximidad de restos de humanos ordinarios, sugiriendo coexistencia. El Australopiteco africano y el Hombre de Pekn fueron presentados como eslabones perdidos de hombres-mono por aos, pero los dos son considerados ahora Homo-erectus. El Homo abilis se considera generalmente hoy que est compuesto de piezas de otros variados tipos de criaturas, tales como el Australopiteco y el Homo erectus, y no es visto generalmente como una clasificacin vlida.