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Universidad Central de Venezuela Facultad de Medicina Escuela Jos Mara Vargas Ctedra de Bioqumica

cidos Nucleicos

Br. Carlos Pedroza

Flujo de la Informacin Gentica


Dogma Central de la Biologa Molecular Proposicin que se asienta por firme y cierta y como principio innegable de una ciencia. Fundamento o puntos capitales de todo sistema, ciencia, doctrina o religin.

RNA transcriptasa

Flujo de la Informacin Gentica


Eucariota Procariota

Flujo de la Informacin Gentica


Eucariota Procariota

Flujo de la Informacin Gentica


Estructura y Propiedades de los cidos Nucleicos

Organizacin del Material Gentico


Replicacin del DNA Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Metabolismo del RNA

PRIMERA PARTE

ESTRUCTURA Y PROPIEDADES DE LOS CIDOS NUCLEICOS

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

cido Nucleico

responsable de su transmisin de generacin en generacin.

Nucletidos

Es una molcula polimrica que tiene como funcin el reservorio de informacin gentica y es

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos pA C G T AOH pApCpGpTpA pACGTA

ACGTA

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos Puentes de hidrgeno (Interacciones Watson Crick). Apilamientos de bases Fuerzas de van der Waals . Interacciones electrostticas PO4-2 y Mg 2+ y protenas bsicas.

Fuerzas que estabilizan

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Caracterstica

Nucletidos Distancia de Prximas Alejadas las bases Surco mayor No Distinguibles y menor distinguibles Inclinacin respecto al Baja Alto eje de la hlice

Forma B

Forma A

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

palndromo.
(Del gr. , de nuevo, y , carrera).
1. m. Palabra o frase que se lee igual de izquierda a derecha, que de derecha a izquierda; p. ej., anilina; dbale arroz a la zorra el abad.

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Estado natural del DNA Tipo negativo (infraenrollado) Facilita la compactacin del DNA Favorece zonas desnaturalizadas en el DNA que facilitan los siguientes procesos: Replicacin del DNA Transcripcin del DNA

Nucletidos

Caractersticas

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

Vueltas de superhlices levogiras

Vueltas de superhlices dextrogiras

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

Topoisomerasa I

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

Topoisomerasa II

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

Topoisomerasa II

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

Topoisomerasa II

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Nucletidos

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

pA C G U AOH pApCpGpUpA pACGUA

ACGUA

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

RNA ribosomal

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

RNA ribosomal

Eucariotas
28S 18S

Procariotas
23S 16S

5,8S
5S

5S

S Svedberg Unidad de sedimentacin en centrifugaciones

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

RNA de transferencia

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

RNA de transferencia

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

RNA de transferencia

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

RNA mensajero

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Caractersticas
Longitud Cadena Conformacin Pentosa Nucletidos Enlaces Pentosa Grupo fosfato Enlaces Pentosa Base nitrogenada Interacciones entre bases

ADN
Mayor longitud Doble cadena B Desoxiribosa A, G, C y Timina

ARN
Menor longitud Simple cadena A Si se encuentra en una cadena doble Ribosa A, G, C y Uracilo

Enlaces Fosfodister Enlaces B-N-glucosdico Interacciones Watson y Crick

En general las semejanzas ocurren entre las estructuras primarias de las molculas

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Acidez Viscosidad Tautomera Absorcin de luz ultravioleta (UV) Desnaturalizacin y Renaturalizacin Temperatura de fusin (Tm)

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Acidez Viscosidad Tautomera Absorcin de luz ultravioleta (UV) Desnaturalizacin y Renaturalizacin Temperatura de fusin (Tm)

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Acidez Viscosidad Tautomera Absorcin de luz ultravioleta (UV) Desnaturalizacin y Renaturalizacin Temperatura de fusin (Tm)

Consiste en la resistencia que presenta un fluido a moverse cuando se le aplica una fuerza
El DNA posee una de las ms altas debido a su gran longitud y rigidez.

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Acidez Viscosidad Tautomera Absorcin de luz ultravioleta (UV) Desnaturalizacin y Renaturalizacin Temperatura de fusin (Tm)

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Acidez Viscosidad Tautomera Absorcin de luz ultravioleta (UV) Desnaturalizacin y Renaturalizacin Temperatura de fusin (Tm)

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Acidez Viscosidad Tautomera Absorcin de luz ultravioleta (UV) Desnaturalizacin y Renaturalizacin Temperatura de fusin (Tm)

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Acidez Viscosidad Tautomera Absorcin de luz ultravioleta (UV) Desnaturalizacin y Renaturalizacin Temperatura de fusin (Tm)

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Acidez Viscosidad Tautomera Absorcin de luz ultravioleta (UV) Desnaturalizacin y Renaturalizacin Temperatura de fusin (Tm)

Factores que desnaturalizan


Temperaturas extremas Valores de pH extremos Solventes orgnicos como cetonas, alcoholes. Agentes como la urea, amidas, etc.

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Acidez Viscosidad Tautomera Absorcin de luz ultravioleta (UV) Desnaturalizacin y Renaturalizacin Temperatura de fusin (Tm)

Efecto hipercrmico

Efecto hipocrmico

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Acidez Viscosidad Tautomera Absorcin de luz ultravioleta (UV) Desnaturalizacin y Renaturalizacin Temperatura de fusin (Tm)

Es la temperatura en la cual el DNA se ha desnaturalizado en un 50%


Variables que afectan la Tm del DNA
La composicin de bases: % de (G + C) y (A + T). Longitud de la cadena Valores de pH

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Acidez Viscosidad Tautomera Absorcin de luz ultravioleta (UV) Desnaturalizacin y Renaturalizacin Temperatura de fusin (Tm)

PRIMERA PARTE

Estructura y Propiedades

Acidez Viscosidad Tautomera Absorcin de luz ultravioleta (UV) Desnaturalizacin y Renaturalizacin Temperatura de fusin (Tm)

SEGUNDA PARTE

ORGANIZACIN DEL MATERIAL GENTICO

SEGUNDA PARTE

Organizacin del Material Gentico

SEGUNDA PARTE

Organizacin del Material Gentico

Virus Genoma Nmero de cromosomas Complejo proteico DNA RNA 10-300 genes

Procariotas DNA 3000-20000 nico de doble cadena circular + plsmidos Nucleoide con protenas HU
Ms compactos (sin secuencias no codificantes) y continuos (sin intrones) y menor capacidad codificante

Eucariotas +20000 Ms de uno Doble cadena lineal Protenas bsicas, histonas


Menos compactos (slo <5% codifica) y discontinuos (con intrones) mayor capacidad codificante

Genes

CentrmeroTelmero

Presenta centrmerotelmeros

SEGUNDA PARTE

Organizacin del Material Gentico

SEGUNDA PARTE

Organizacin del Material Gentico

Secuencia no codante Secuencia reguladora Gen 1

Regiones Intergnicas Gen 2

SEGUNDA PARTE

Organizacin del Material Gentico

SEGUNDA PARTE

Organizacin del Material Gentico

Bacterifago T2 (virus)

Escherichia coli

SEGUNDA PARTE

Organizacin del Material Gentico

SEGUNDA PARTE

Organizacin del Material Gentico

Niveles de compactacin

SEGUNDA PARTE

Organizacin del Material Gentico

Niveles de compactacin

SEGUNDA PARTE

Organizacin del Material Gentico

Niveles de compactacin

SEGUNDA PARTE

Organizacin del Material Gentico

Niveles de compactacin

SEGUNDA PARTE

Organizacin del Material Gentico

Niveles de compactacin

SEGUNDA PARTE

Organizacin del Material Gentico

Niveles de compactacin

SEGUNDA PARTE

Organizacin del Material Gentico

SEGUNDA PARTE

Organizacin del Material Gentico

Caractersticas del cromosoma mitocondrial (mtDNA)


Su secuencia es diferente al DNA nuclear y representa < del 0,1% del DNA celular. Es de doble cadena circular cerrado covalentemente. En animales posee menos de 17 Kb (17.000 pb). El 95 % de sus protenas estn codificadas por el DNA nuclear. Se acepta que las mitocondrias con su DNA es un vestigio de bacterias que se integraron al citoplasma de clulas husped (teora endosimbitica)

TERCERA PARTE

REPLICACIN DEL DNA

Flujo de la Informacin Gentica

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Dogma Central de la Biologa Molecular Proposicin que se asienta por firme y cierta y como principio innegable de una ciencia. Fundamento o puntos capitales de todo sistema, ciencia, doctrina o religin.

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

En procariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

En procariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

En procariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Protagonistas de la Elongacin
DNA polimerasas III y I Protenas SSB Helicasas (DnaB) Primasa (DnaG) Primosoma

Elongacin

Terminacin

Topoisomerasas DNA ligasa

En procariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

En procariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

En procariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

En procariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

En procariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

En procariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

DNA polimerasa
Iniciacin Subunidades DNApol I 1 DNApol II 4 Yes Yes DNApol III 10 Yes Yes

Polimerizacin 53
Elongacin Act. Exonucleasa 35 (proofreading) Terminacin Act. Exonucleasa 53 Procesividad

Yes
Yes Yes 3-200

No 1,500

No 500,000

En procariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

En procariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Entonces las hebras se sintetizan a destiempo?

Terminacin

En procariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

En procariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

En procariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

En procariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

En procariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

En procariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

En procariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

En procariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

En procariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

En procariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

En eucariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Eucariotas Se inicia en varios puntos Secuencias ARS (Secuencias de replicacin autnoma) Fragmentos de Okazaki ms pequeos

Procariotas Se inicia en un slo punto Orgenes de replicacin OriC Fragmentos de Okazaki ms grandes

Elongacin

Terminacin

Intervienen 5 enzimas DNA polimerasas (, , , , ).

Intervienen 3 enzimas DNA polimerasas (I, II y III).

En eucariotas

Compartimiento celular

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Ncleo No

Ncleo

Ncleo Yes

Ncleo Mitocondria

Iniciacin

Tiene primasa asociada?


Funcin Biolgica

Replicacin Reparo Replicacin Replicacin de la hebra del del DNA de la hebra retardada DNA mitocondrial lder 160-185 Moderate Moderate 40 Low Low 125 High High 125 Low High

Replicacin
210-230 125-140 High High

Elongacin

Subunidades Procesividad inherente Procesividad con PCNA Actividad Exonucleasa 35

Terminacin

No

Yes

En eucariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

En eucariotas

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Iniciacin

Elongacin

Terminacin

Replicacin de Genomas Lineales

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Replicacin de Genomas Lineales

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Replicacin de Genomas Lineales

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Replicacin de Genomas Lineales

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

Replicacin de Genomas Lineales

TERCERA PARTE

Replicacin del DNA

CUARTA PARTE

MUTACIONES Y MECANISMOS DE REPARACIN

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Mutaciones gnicas Insercin, Delecin, Transiciones y Transversiones Bases moleculares


Espontneas Formas tautomricas Alineamientos incorrectos Despurinacin Desaminacin Dao por oxidacin Directa Fotorreactivacin Enzimas alquiltransferasas Protena AlkB Inducidas Mutgenos qumicos Mutgenos fsicos

Mecanismos de Reparacin
Reparacin por escisin Sistema UvrABC ABC escinucleasa. Sistema DNA-N-glicosilasa

Mutaciones gnicas

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Clasificacin de las Mutaciones gnicas


Insercin Delecin Transiciones Transversiones Integracin en una secuencia de un par de nucletidos adicional Prdida de un par de nucletidos dentro de una secuencia Cambio de un par Purina-pirimidina por una Purinapirmidina (A-T G-C) (G-CA-T) Cambio de un par Purina-pirimidina por una PirimidinaPurina (A-T C-G) (G-CT-A)

Mutaciones gnicas

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Mutaciones gnicas

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Mutaciones gnicas Insercin, Delecin, Transiciones y Transversiones Bases moleculares


Espontneas Formas tautomricas Alineamientos incorrectos Despurinacin Desaminacin Dao por oxidacin Directa Fotorreactivacin Enzimas alquiltransferasas Protena AlkB Inducidas Mutgenos qumicos Mutgenos fsicos

Mecanismos de Reparacin
Reparacin por escisin Sistema UvrABC ABC escinucleasa. Sistema DNA-N-glicosilasa

Base molecular de las Mutaciones gnicas


Formas tautomricas

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Base molecular de las Mutaciones gnicas


Formas tautomricas

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Base molecular de las Mutaciones gnicas


Formas tautomricas

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Base molecular de las Mutaciones gnicas


Alineamientos incorrectos durante la replicacin

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Base molecular de las Mutaciones gnicas


Despurinacin

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Desaminacin

Base molecular de las Mutaciones gnicas


Despurinacin

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Desaminacin

Base molecular de las Mutaciones gnicas


Dao por oxidacin

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Base molecular de las Mutaciones gnicas


Dao por oxidacin

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Base molecular de las Mutaciones gnicas


Dao por oxidacin

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Mutaciones gnicas Insercin, Delecin, Transiciones y Transversiones Bases moleculares


Espontneas Formas tautomricas Alineamientos incorrectos Despurinacin Desaminacin Dao por oxidacin Directa Fotorreactivacin Enzimas alquiltransferasas Protena AlkB Inducidas Mutgenos qumicos Mutgenos fsicos

Mecanismos de Reparacin
Reparacin por escisin Sistema UvrABC ABC escinucleasa. Sistema DNA-N-glicosilasa

Mutaciones inducidas

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Anlogos de base Agentes alquilantes Agentes intercalantes (colorantes) Agentes no alquilantes: cido nitroso

Luz ultravioleta (UV) Rayos gamma Rayos X

Mutaciones inducidas
Mutgenos qumicos

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Anlogos de base Agentes alquilantes Agentes intercalantes (colorantes) Agentes no alquilantes: cido nitroso

Mutaciones inducidas
Mutgenos qumicos Anlogos de base

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

2-Aminopurina Adenina

5-Bromouracilo Timina

Mutaciones inducidas
Mutgenos qumicos Anlogos de base

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

5-Bromouracilo Adenina o con Guanina 2-Aminopurina Timina o con Citosina

Mutaciones inducidas
Mutgenos qumicos Agentes alquilantes

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Metano sulfonato de etilo

Mutaciones inducidas
Mutgenos qumicos Agentes alquilantes

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Metano sulfonato de etilo

Mutaciones inducidas
Mutgenos qumicos Agentes intercalantes

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Bromuro de etidio

Mutaciones inducidas
Mutgenos qumicos Agentes intercalantes

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Mutaciones inducidas
Mutgenos qumicos Agentes no alquilantes

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

HNO2 Promueve la desaminacin de las bases

Precursores del xido Nitroso

Mutaciones inducidas
Mutgenos qumicos

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Luz ultravioleta (UV) Rayos gamma Rayos X

Mutaciones inducidas
Mutgenos fsicos Luz ultravioleta

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Mutaciones inducidas
Mutgenos fsicos Luz ultravioleta

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Mutaciones inducidas
Mutgenos fsicos Luz ultravioleta

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Mutaciones gnicas Insercin, Delecin, Transiciones y Transversiones Bases moleculares


Espontneas Formas tautomricas Alineamientos incorrectos Despurinacin Desaminacin Dao por oxidacin Directa Fotorreactivacin Enzimas alquiltransferasas Protena AlkB Inducidas Mutgenos qumicos Mutgenos fsicos

Mecanismos de Reparacin
Reparacin por escisin Sistema UvrABC ABC escinucleasa. Sistema DNA-N-glicosilasa

Mutaciones inducidas
Directa Fotorreactivacin

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Mutaciones inducidas
Directa Enzimas alquiltransferasas

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Mutaciones inducidas
Directa Protena AlkB

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Mutaciones inducidas
Reparacin por escisin

CUARTA PARTE

Mutaciones y Mecanismos de Reparacin

Sistema DNA-Nglicosilasa Suprime bases de Suprime dmeros de uracilos en el DNA timina Suprime dmeros de Suprime bases alquiladas timina Suprime bases alquiladas

Sistema UvrABC (ABC Escinucleasa)

QUINTA PARTE

METABOLISMO DEL RNA

Flujo de la Informacin Gentica


Principales caractersticas

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Dogma de molde. la Se efecta en direccin 53 Central antiparalela al DNA Enzima importante RNA polimerasa, NO requiere cebador. Biologa Molecular Fases Iniciacin, elongacin y terminacin. Dentro de los segmentos transcritos, una de las hebras del Proposicin queslo se asienta DNA sirve de molde para una molcula de y RNA determinada. por firme y cierta como Secuencias reguladoras en el DNA indican el inicio y fin de la principio innegable de una transcripcin. ciencia. Est limitada a cortos segmentos de la molcula de DNA Es Fundamento o puntos selectiva En un momento dado, solo son transcritos genes o capitales todo sistema, grupos de genes, y algunas de regiones del genoma nunca son ciencia, doctrina o religin. transcritas. Alta procesividad.

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Transcripcin
Secuencias en un gen

Procesamiento y maduracin del RNA

RNA polimerasa - Procariotas

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Subunidad
Ncleo core 2, , y

Funcin
Proceso de sntesis de la molcula de RNA Iniciacin, elongacin y terminacin

Factor sigma 70

Se une transitoriamente al ncleo de la RNA polimerasa y dirige la enzima hacia sitios especficos de unin en el DNA. Una vez se reconoce la secuencia promotora, sta suele disociarse. El tipo unido (70, 32, etc.) determina el promotor al que se unir la RNA polimerasa en el siguiente ciclo de sntesis.

RNA polimerasa - Eucariotas

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

RNA polimerasa I II III

Funcin Sntesis de los precursores de rRNA 18S, 5,8S y 28S Sntesis de mRNA y algunos RNA especializados Sntesis de tRNA, rRNA 5S y algunos RNA especializados

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Transcripcin
Secuencias en un gen

Procesamiento y maduracin del RNA

DNA molde

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Transcripcin
Secuencias en un gen

Procesamiento y maduracin del RNA

Secuencias en un gen

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

UNIDAD TRANSCRIPCIONAL Secuencia promotora + Secuencia codificante + Secuencia terminadora


Secuencia promotora

Secuencias en un gen

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

UNIDAD TRANSCRIPCIONAL Secuencia promotora + Secuencia codificante + Secuencia terminadora


Secuencia promotora

Secuencias en un gen

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

UNIDAD TRANSCRIPCIONAL Secuencia promotora + Secuencia codificante + Secuencia terminadora


Secuencia codificante

Mnemotecnia EXones Se EXpresan INtrones Se quedan :S

Secuencias en un gen

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

UNIDAD TRANSCRIPCIONAL Secuencia promotora + Secuencia codificante + Secuencia terminadora


Secuencia terminadora

Secuencias en un gen

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

UNIDAD TRANSCRIPCIONAL Secuencia promotora + Secuencia codificante + Secuencia terminadora


Secuencias activadoras corriente arriba (Upstream, UAS) Secuencias ubicadas cercanas o lejanas al sitio de inicio donde se unen factores corriente arriba que pueden mejorar la transcripcin Reguladoras Secuencias donde se une activadores o represores (operadores) de la transcripcin Elementos de Donde se une factores inducibles semejantes a los factores corriente arriba, con un Respuesta papel regulador de la transcripcin Shine-Dalgarno o Secuencia del mRNA situada unos 6 7 nucletidos antes del codn de inicio de la Kozak en traduccin, y regula la iniciacin de sta. Es importante en el prximo tema de Sntesis eucariotas de Protenas :D Potenciadores Intensificadores

Para el inicio de la transcripcin no solamente se requieren los eventos reguladores de la secuencia promotora, hay otros elementos que tambin pueden afectarla, bien sea bloquendola, disminuyendo su velocidad o aumentndola.

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Transcripcin
Secuencias en un gen

Procesamiento y maduracin del RNA

Iniciacin y elongacin

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Terminacin

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Rho () independiente

Rho () dependiente

Ciclo de la subunidad

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Transcripcin en Eucariotas
Protena TBP TFIIA TFIIB TFIIE TFIIF

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

TFIIH
de Elongacin ELL, pTEFb TFIIS, Elongina

Funcin Reconoce especficamente la caja TATA Estabiliza la unin de TFIIB y TBP al promotor Se une a TBP, recluta el complejo RNA polimerasa II-TFIIF Recluta TFIIF, posee actividad helicasa y ATPasa Se une fuertemente a la RNA polimerasa II, se une a TFIIB e impide la unin de la enzima a secuencias de DNA inespecficas Desenrolla el DNA en el promotor (actividad helicasa), fosforila la RNA polimerasa II (dentro del dominio carboxilo terminal de la subunidad mayor de la enzima [CTD]), recluta el complejo de reparacin por escicin de nucletido. Suprimir la pausa o detencin de la transcripcin del complejo RNA polimerasa-TFIIF

Transcripcin en Eucariotas

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Es importante recordar que el reconocimiento inicial del promotor no lo hace la enzima, es mediado por una serie de factores transcripcionales (la TBP y la TFIIB que forman un complejo y que dirigen al complejo TFIIF-RNA polimerasa II hacia el promotor).

Transcripcin en Eucariotas

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Es importante recordar que el reconocimiento inicial del promotor no lo hace la enzima, es mediado por una serie de factores transcripcionales (la TBP y la TFIIB que forman un complejo y que dirigen al complejo TFIIF-RNA polimerasa II hacia el promotor).

Transcripcin en Eucariotas

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Es importante recordar que el reconocimiento inicial del promotor no lo hace la enzima, es mediado por una serie de factores transcripcionales (la TBP y la TFIIB que forman un complejo y que dirigen al complejo TFIIF-RNA polimerasa II hacia el promotor).

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Transcripcin
Secuencias en un gen

Procesamiento y maduracin del RNA

Inhibidores de la Transcripcin

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Inhibidor Actinomicina D y Acridina Rifampicina Cordisepina -Amanitina

Organismo Eucariotas y Procariotas Procariotas Eucariotas y Procariotas Eucariotas

Accin
Poseen una porcin plana en su estructura que actan como elementos intercalantes entre las bases del DNA donde predominan pares de GyC e impiden el movimiento de la RNA polimerasa y la continuacin de la transcripcin. Inhiben la fase de elongacin. Se unen a la subunidad de las RNA polimerasas procariotas, bloqueando la formacin del primer enlace fosfodister e impide el desalojo del promotor en la transcripcin. Anlogo de nucletido que le falta el OH en el C3, impide la formacin del enlace fosfodister y no se puedan adicionar nuevos nucletidos. Bloquea la RNA polimerasa II, y a concentraciones ms altas, tambin la RNA polimerasa III.

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Transcripcin
Secuencias en un gen

Procesamiento y maduracin del RNA

Modificaciones post-transcripcionales de los mRNA

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Modificaciones post-transcripcionales de los mRNA Extremo 5 Adicin de un residuo de GTP en una orientacin inversa (casquete 5 o 7-metilguanosina). Extremo 3 Adicin de una secuencia de poli(A). Escisin cataltica de los intrones mediante corte y empalme.

Modificaciones post-transcripcionales de los mRNA

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Modificaciones post-transcripcionales de los mRNA Extremo 3

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Extremo 5

Modificaciones post-transcripcionales de los mRNA


Grupo I
Nombre Caracterstica principal

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Grupo II
Autocatalticas

Grupo III con splicing asistidos por espliceosoma Requiere formacin del espliceosoma
mRNA nuclear

Grupo IV con splicing asistidos por endonucleasas Requiere de una endonucleasa


Ciertos tRNA

Ubicacin

ATP Requerimientos

Reacciones

S requieren Ribonucleoprotenas Endonucleasa nucleares Rotura de los enlaces Dos reacciones de transesterificacin, en las que un Igual mecanismo de fosfodister de los grupo de una ribosa realiza un ataque nucleoflico formacin de lazo de los extremos del intrn y sobre un fosfato, formndose un nuevo enlace intrones del grupo II unin de los exones fosfodister a expensas del anterior. entre s

rRNA, mRNA y mRNA de mitocondrias o tRNA nucleares, cloroplastos, en hongos, mitocondriales y de algas y plantas. cloroplastos No necesita Adenina que se encuentra Guanina dentro del intrn

Modificaciones post-transcripcionales de los mRNA Corte y Empalme Grupo 1

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Modificaciones post-transcripcionales de los mRNA Corte y Empalme Grupo 2

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Modificaciones post-transcripcionales de los mRNA Corte y Empalme Grupo 4

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Procesamiento diferencial de los mRNA


Patrones de Corte y Poliadenilacin alternativos

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Procesamiento diferencial de los mRNA


Patrones de Corte y Splicing alternativos

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Transcripcin
Secuencias en un gen

Procesamiento y maduracin del RNA

Modificaciones post-transcripcionales de los rRNA

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

Transcripcin
Secuencias en un gen

Procesamiento y maduracin del RNA

Modificaciones post-transcripcionales de los tRNA

QUINTA PARTE Metabolismo del

RNA

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