Bioqumica, Tema 1-6

1. Poner un ejemplo de cada uno de los procesos de reaccin siguientes: Sustitucin nucleoflica, Eliminacin, Oxidacinreduccin, Adicin. 2. Citar un aminocido con cadena lateral hidrofbica, otro con grupo polar sin carga, un AA cido y un AA bsico. 3. Considerando los 20 aminocidos proticos codificables calcular el nmero total de tetrapptidos posibles. 4. Indicar a qu nivel de la estructura proteica contribuye cada uno de los siguientes trminos: secuencia de aminocidos, lamina beta, enlace de hidrgeno, puente disulfuro. 5. En relacin con los aminocidos definir los siguientes trminos: carbono alfa, punto isoelctrico (pI), enlace peptdico, aminocido hidrofbico. 6. Un polipptido posee un valor bajo de pI. Sugerir los aminocidos que lo forman. 7. A qu nivel de la estructura protica actan los siguientes agentes desnaturalizantes: calor suave, cido fuerte, solucin salina saturada, disolventes orgnicos tipo cloroformo, agente reductor? 8. Un aminocido tiene un valor de pKR = 10.0 A qu grupo de aminocidos pertenece? Por qu? Cul es su carga neta a pH=7.0?

9. Los valores de los pK de un aminocido son los siguientes: pKa1 = 2.1; pKa2 = 9.8; pKR = 3.9 A qu grupo de aminocidos pertenece? Decir la carga neta que tendr el aminocido a los siguientes valores de pH: 2.1, 3.9, 7.0, 9.8, 13.0 explicando el por qu. Cul es el valor de su pI? 10.Los valores de los pK de un aminocido son los siguientes: pKa1 = 2.2; pKa2 = 9.0; pKR = 12.5 A qu grupo de aminocidos pertenece? Decir la carga neta que tendr el aminocido a los siguientes valores de pH: 2.2, 7.0, 9.0, 12.5 explicando el por qu. Cul es el valor de su pI? 11.Los valores de los pK de un aminocido son los siguientes: pKa1 = 2.2; pKa2 = 9.0; pKR = 12.5 A qu grupo de aminocidos pertenece? Decir la carga neta que tendr el aminocido a los siguientes valores de pH: 2.2, 7.0, 9.0, 12.5 explicando el por qu. Cul es el valor de su pI? 12.En relacin con las propiedades cido-base de los aminocidos: a) Representar la curva de titulacin de un aminocido monoamino y monocarboxilo que tiene los valores de pKa1 = 3.34 y pKa2 = 9.60, especificando las especies inicas predominantes en los puntos clave de la curva. b) Calcular el pI del siguiente tripptido: Gly-Ala-Val siendo: Gly (pKa1=2.34; pKa2=9.6); Ala (pka1=2.34; pKa2=9.69); Val (pKa1= 2.32; pKa2=9.62). c) En qu direccin se mover el tripptido cuando se coloque en un campo elctrico a los valores de pH siguientes: 1, 5, 10, 12.

13.Considere el tetrapptido siguiente: Lys-Ser-Asp-Ala. Los valores de los pK son: pK carboxilo: 2.34; pK amino: 8.95: pKR Asp: 3.86; pKR Lys: 10.79. Determinar: a) El pI del tetrapptido. B) En qu direccin se mover el pptido cuando se coloque en un campo elctrico a pH=4 y a pH=9. 14.La arginina tiene los valores de pKa siguientes: pKa1 = 2.17, pKa2 = 9.04 y pKR = 12.48. Cul es la estructura y la carga neta de la arginina a los siguientes valores de pH?: 1, 4, 7, 10, 12. 15.Definir la P50 para la hemoglobina. Qu efecto cualitativo cabra prever que tuviera cada una de las siguientes modificaciones sobre la P50? a) Aumento de pH de 7.2 a 7.4 y b) Aumento de la presin parcial de CO2 de 20 a 40 mm Hg. 16.Definir la P50 para la hemoglobina. Qu efecto cualitativo cabra prever que tuviera cada una de las siguientes modificaciones sobre la P50? a) Disminucin de pH de 7.4 a 7.2 y b) Disociacin en cadenas polipeptdicas monomrica. 17.Poner un ejemplo de cada uno de los compuestos o estructuras siguientes: a) Epmero; b) Azcar reductor; c) Diastereoismero. 18.Define lo que es un enlace glucosdico y pon un ejemplo. 19.Dibujar esquemticamente la frmula de la glucosa y de la galactosa y sus respectivas proyecciones de Haworth. 20. Cul es el nmero de estereoismeros que posee un monosacrido de 5 tomos de carbono? 21. Se puede ciclar la fructosa como piranosa? Dibuja su estructura. 22.Tienen todos los disacridos poder reductor? monosacridos? Poner ejemplos explicando el por qu. Y los

23.Cules de los siguientes azcares son reductores y cules no: Almidn, celulosa, fructosa, sacarosa, ribosa. 24.Dibujar mediante la proyeccin de Haworth los compuestos siguientes: a) -D-glucopiranosa y -D-glucofuranosa. b) Sacarosa y c) D-lactosa, d) cido silico. 25.Dibujar la estructura de una molcula de D-glucosamina unida a la treonina a travs de un enlace -glucosdico. 26.Dibuje los compuestos siguientes: a) anmeros y de la galactosa. b) Acido aldnico, urnico y derivados del cido aldrico de la galactosa. c) Galactitol. d) Lactona del cido galactnico. 27.Determinar cules de los siguientes pares de azcares son enantimeros, diastereoismeros, epmeros o par aldosa/cetosa. a) D-Eritrosa y D-treosa. b) D-glucosa y D-manosa. c) D-ribosa y Lribosa. d) D-alosa y D-galactosa. e) D-gliceraldehdo y dihidroxiacetona. 28.Estructura general de un glicerofosfolpido y esfingofosfolpido. Son los glucolpidos esfingolpidos? de un

29.Considerando estos componentes moleculares: glicerol, cido graso, fosfato, alcohol de cadena larga e hidrato de carbono, responder a lo siguiente: Qu dos de ellos estn presentes en las ceras y en la esfingomielina? Qu dos de ellos estn presentes en las grasas y en la fosfatidilcolina?Cules de ellos estn presentes en un ganglisido pero no en una grasa? 30.Qu funcin desempean las lipoprotenas plasmticas en el cuerpo humano?Por qu requieren un componente protico para realizar la funcin?

31.De qu cido graso proceden la mayora de los eicosanoides? Relacionar varias alteraciones mdicas en las que puede parecer ventajoso suprimir su sntesis. 32.Tipos de enlaces que aparecen en un nucletido. Y en un polinucletidos? 33.Representar esquemticamente el siguiente oligonucletido: ACTGA 34.Cmo se sintetizan los polinucletidos? En qu direccin? 35.En qu condiciones y cmo se forma un DNA-H de triple hlice? 36.Definir temperatura media de fusin para el DNA y explicar de qu factores depende. 37.Explicar cmo influye la fuerza inica sobre el fenmeno de la desnaturalizacin del DNA. 38.Una muestra de DNA contiene un 21 % de adenina Cul es su composicin porcentual en bases? 39.Describir cmo contribuye a la estructura helicoidal estable del DNA cada una de las interacciones no covalentes. 40.Cmo afectan cada una de las sustancias o condiciones siguientes a la estructura del DNA? a) Etanol b) Calor c) Dimetil sulfato d) cido nitroso e) Quinacrina. 41.Dar una relacin de 3 diferencias entre el DNA procariota y eucariota. Describir las diferencias estructurales entre el RNA y el DNA. 42.Qu condiciones fsicas producen la desnaturalizacin del DNA?

43.Transformar matemticamente la ecuacin de Michaelis-Menten en la de los dobles inversos de Lineweaver-Burk. 44.Escribir la ecuacin de Michaelis Menten para un ihhibidor competitivo, no competitivo y acompetitivo. 45.Representar segn la grfica de los dobles inversos de LineweaverBurk la cintica de una reaccin cuyas constantes son: Vmax = 4 mol/s y KM = 0.5 mM. 46.La presencia de un inhibidor en una reaccin enzimtica tipo Michaelis-Menten hace que el valor de la KM aumente 3 veces cuando la concentracin del mismo es de 10 mM. De qu tipo de inhibidor se trata? Cuntas veces aumentar la KM si el inhibidor se encuentra a una concentracin de 20 mM? 47.En un tipo de inhibicin reversible denominada acompetitiva el inhibidor se une solo al complejo ES y bloquea la catlisis al hacerlo. Deducir la ecuacin cintica para este caso y dibujar la representacin de los dobles inversos. 48.Calcular los valores de Km y Vmax de la cintica de las reacciones enzimticas representadas por las rectas A y B Qu relacin guardan ambas rectas? De qu tipo de inhibicin se trata?

49.Concepto y significado de las constantes cinticas KM, Vmax, Kcat y Ki Qu es lo que define la eficiencia de un enzima? 50.Calcular los valores de Km y Vmax de la cintica de las reacciones enzimticas representadas por las rectas A y B Qu relacin guardan ambas rectas?

51.La presencia de un inhibidor en una reaccin enzimtica tipo Michaelis-Menten hace que el valor de la Vmax disminuya 5 veces cuando la concentracin del mismo es de 20 mM. De qu tipo de inhibidor se trata? Cuntas veces disminuir la Vmax si el inhibidor se encuentra a una concentracin de 40 mM? 52.La siguiente grfica muestra la representacin de Lineweaver-Burk para una misma reaccin enzimtica en diferentes condiciones A, B y C (Los nmeros representan los lugares de corte con los correspondientes ejes) Responder a las siguientes cuestiones: Calcular los valores de KM y Vmax para cada una de las rectas A, B y C. Qu relacin guardan las rectas entre s? De qu tipo de inhibicin se trata? Explicar de forma particular qu sucede en los casos B y C.