Virus

Virus
Virus

Rotavirus

Classification
Type Virus

Rgne Virus Groupes de rang infrieur Groupe I (dsDNA) Groupe II (ssDNA) Groupe III (dsRNA) Groupe IV ((+)ssRNA) Groupe V ((-)ssRNA) Groupe VI (ssRNA-RT) Groupe VII (dsDNA-RT)

Un virus est une entit biologique ncessitant un hte, souvent une cellule, dont il utilise les constituants pour se multiplier. On le considre de plus en plus comme faisant partie des acaryotes. Les virus existent sous une forme extracellulaire (unit matrielle indpendante appele alors virion) ou intracellulaire (virus intgr sous forme dormante ou dtournant activement la machinerie cellulaire au profit de sa rplication). Sous la forme intracellulaire ( l'intrieur de la cellule hte), les virus sont des lments gntiques qui peuvent se rpliquer de faon indpendante par rapport au chromosome, mais non indpendamment de la cellule hte. Sous la forme extracellulaire, les virus sont des objets particulaires, infectieux, constitus au minimum d'un acide nuclique englob dans une capside de protines. Le dbat sur la nature des virus (vivants ou pas) repose sur des notions complexes et reste aujourd'hui ouvert. Cependant, selon certaines dfinitions courantes du vivant (entit matrielle ralisant les fonctions de relation, nutrition, reproduction), les virus ne seraient donc pas des tres vivants.[rf.ncessaire] La virologie est la science qui tudie les virus. Elle est tudie par des virologues ou virologistes.

Virus Le mot virus est issu du latin virus, qui signifie poison . Se terminant par un s, il ne prend pas de marque particulire au pluriel en franais[1].

Dcouverte
Les maladies virales comme la rage, la fivre jaune, la variole, affectent les humains depuis des sicles. Des hiroglyphes mettent en vidence la poliomylite dans l'gypte antique, les crits de lAntiquit grco-romaine et dExtrme-Orient dcrivent certaines maladies virales. la fin du XIXesicle, la conception dagents infectieux qui ntaient ni des bactries, ni des champignons, ni des parasites, invisibles au microscope optique, tait encore difficile. cette poque, les scientifiques isolaient des agents infectieux travers des filtres de porcelaine utiliss pour recueillir les bactries. Entre 1887 et 1892, le botaniste russe Dimitri Ivanovski tudia une maladie vgtale, la mosaque du tabac, et montra que la sve des plantes malades contenait un agent infectieux qui ntait pas retenu par les filtres Chamberland conus par le biologiste du mme nom. Ivanovski pensait quil sagissait dune toxine ou bien dune trs petite bactrie. Cest le chimiste hollandais Martinus Beijerinck qui approfondit ces travaux et, en 1898, carta non seulement lhypothse bactrienne mais aussi l'hypothse toxinique : diluant la sve de plantes infectes il l'inocula des plantes qui dvelopprent la maladie; ritrant la manipulation il put transmettre la maladie de multiples fois et dmontrer que la sve de la dernire plante infecte tait aussi virulente que la premire, effet qu'une toxine, aprs tant de dilutions n'aurait pu produire[2]. Beijerinck appela l'agent Contagium vivum fluidum ('germe vivant soluble'). la mme poque, le virus de la fivre aphteuse est le premier virus identifi par Friedrich Lffler et Paul Frosch. Le virus de la fivre jaune est le premier virus pathogne de lHomme identifi entre 1900 et 1902. Pasteur les nomma infrabactries , d'autres les qualifiaient de virus filtrants ou virus ultrafiltrants . Cest pendant la Premire Guerre mondiale que langlais Frederick Twort et le microbiologiste franco-canadien Flix d'Hrelle mettent en vidence le phnomne de lyse transmissible observable par la lyse des bactries cultives en milieu solide. Ce phnomne est d un virus de bactries que Flix d'Hrelle baptisa bactriophage. Les virus des plantes, des animaux, de lHomme et des bactries taient ainsi dcouverts et leurs listes ne cessrent de sallonger au cours du XXesicle. Vers 1925, la dfinition de virus[3] devint un agent responsable d'une maladie infectieuse, parasite, de nature particulaire et de taille comprise entre 0.01 et 0.3 microns [4]. Lapparition de la microscopie lectronique dans les annes 1930 permit lobservation des virus, mais on ne savait toujours pas cette poque ce quils taient rellement. Le biochimiste amricain Wendell Stanley cristallisa le virus de la mosaque du tabac sous forme de cristal protique en 1935. L'anne suivante, des tudes complmentaires montrrent que ce cristal contenait galement de lARN. Les tudes ultrieures montrrent que selon les virus tudis, ceux-ci taient composs soit de protines et dARN, soit de protines et dADN. Cest en 1957 qu'Andr Lwoff proposa une dfinition[5] claire et moderne des virus. partir des annes 1960, le dveloppement des cultures cellulaires, de la microscopie lectronique, puis de la biologie molculaire, permirent aux scientifiques de progresser dans la comprhension des mcanismes de rplication des virus, dans la ralisation de diagnostics fiables et dans llaboration de vaccins.

Virus

Caractristiques
Un virus se caractrise par son incapacit se multiplier par division. Il a besoin pour cela d'infecter une cellule hte pour utiliser sa machinerie : un virus est un parasite intracellulaire obligatoire. Il est compos d'une ou plusieurs molcules d'acide nuclique (soit d'ADN, soit d'ARN, simple ou double brin), entoures d'une coque de protines appele capside, parfois d'une enveloppe. Il ne possde en gnral aucune enzyme pouvant produire de l'nergie. Les virus taient historiquement considrs comme des particules organiques de petite taille (infrieure celle d'une bactrie), en rgle gnrale moins de 250 nanomtres. Toutefois de nouveaux virus rcemment dcouverts, comme mimivirus avec sa taille de 400 nm et la possession la fois d'ADN et d'ARN, remettent en cause cette vision historique. La forme libre du virus (ou particule virale) s'appelle le virion.

Structure de base d'un virus.

Nature
Il y a dbat sur la nature des virus. Les virus possdent des constituants en commun avec les cellules vivantes, comme un acide nuclique (ADN ou ARN) et des protines. Cependant, selon la dfinition du biochimiste Wendell Stanley, les virus sont de simples associations de molcules biologiques. Ils sont le fruit dune auto-organisation de molcules organiques et ne sont donc pas vivants. Franois Jacob insiste aussi sur cette caractristique des virus : placs en suspension dans un milieu de culture, ils ne peuvent ni mtaboliser, ni produire ou utiliser de lnergie, ni crotre, ni se multiplier, toutes fonctions communes aux tres vivants[6] . Les virus ne peuvent se multiplier quen utilisant lquipement enzymatique dune cellule vivante. De plus, les virus contiennent bien un acide nuclique, de lADN ou de lARN, mais pas les deux (sauf le mimivirus, voqu plus haut), la diffrence des cellules vivantes. Au cours des dernires annes, des entits intermdiaires sont dcouvertes : le mimivirus, infectant une amibe, possde dans son gnome 1 200 gnes (davantage que certaines bactries). Certains de ces gnes participeraient la synthse protique et des mcanismes de rparation de lADN[7]. Il existe chez le mimivirus une trentaine de gnes prsents habituellement chez les organismes cellulaires mais absents chez les virus. Le virus ATV darches prsente lui aussi des caractristiques tonnantes : ce virus en forme de citron prsente la particularit de se modifier en dehors du contexte cellulaire par un mcanisme actif. Il est capable de sallonger chaque extrmit une temprature de 80C, temprature laquelle vit son hte Acidianus proximit des sources hydrothermales[8]. Nanmoins organes et changes cycliques, donc mtabolisme, restent absents. Les virus ont aussi un rle dans lvolution. Patrick Forterre avance mme lhypothse que les virus seraient les inventeurs de lADN[9]. lorigine de la vie, lARN dominait (hypothse du monde ARN) et assurait la fois les fonctions de stockage et transmission de linformation gntique et de catalyse des ractions chimiques. LADN serait apparu ensuite et slectionn en raison de sa plus grande stabilit. Daprs Patrick Forterre, le premier organisme ADN serait un virus. L'ADN confrerait au virus le pouvoir de rsister des enzymes dgradant les gnomes ARN, arme de dfense probable des protocellules. On retrouve le mme principe chez des virus actuels, qui altrent leur ADN pour rsister des enzymes produites par des bactries infectes. Le dbat sur le caractre vivant ou inerte des virus reste encore aujourdhui ouvert.[rf.ncessaire] Rpondre cette question exige de rpondre au pralable une autre : quest-ce que la vie ? Daprs Ali Sab, la notion du vivant est une notion dynamique, voluant en fonction de nos connaissances. En consquence, la frontire entre la matire inerte et le vivant est tout aussi instable [10]. L'existence ou non d'un mtabolisme, c'est--dire d'un ensemble cohrent de processus chimiques l'homostasie (et non la reproduction) constitue un discriminant possible, en tout

Virus cas commode.

Structure
Une particule virale complte, appele virion, est compose dun filament dacide nuclique, gnralement stabilis par des nucloprotines basiques, enferm dans une coque protique protectrice appele capside. La forme de la capside est la base des diffrentes morphologies des virus. La taille des virus se situe entre 10 et 400 nm. Les gnomes des virus ne comportent que de quelques gnes 1 200 gnes. Le plus petit virus connu est le virus delta, qui parasite lui-mme celui de l'hpatite B. Il ne comporte qu'un seul gne. Le plus gros virus connu est le mimivirus, avec un diamtre qui atteint 400 nanomtres et un gnome qui comporte 1 200 gnes. Le virus a une forme microscopique variable, si la reprsentation "usuelle" lui donne l'image du V.I.H., les diffrentes espces sont de formes allants de la sphre l'apparence insectode. Acide nuclique Le filament d'acide nuclique peut tre de l'ADN ou de l'ARN. Il reprsente le gnome viral. Il peut tre circulaire ou linaire, bicatnaire (double brin) ou monocatnaire (simple brin). Le gnome sous forme d'ADN est gnralement bicatnaire. Le gnome sous forme d'ARN est gnralement monocatnaire et peut tre polarit positive (dans le mme sens qu'un ARN messager) ou polarit ngative (complmentaire d'un ARN messager). Le peloton central d'acide nuclique est dnomm nuclode. Capside La capside est une coque qui entoure et protge l'acide nuclique viral. La capside est constitue par l'assemblage de sous-units protiques appeles capsomres. L'ensemble de la capside et du gnome est nomm nuclocapside. La structure de la capside peut prsenter plusieurs formes. On distingue en gnral deux groupes principaux de virus : les virus symtrie cubique (ou capside icosadrique) et les virus symtrie hlicodale. Enveloppe De nombreux virus sont entours d'une enveloppe (ou pplos) qui prend naissance au cours de la traverse des membranes cellulaires. Sa constitution est complexe et prsente un mlange d'lments cellulaires et d'lments d'origine virale. On y trouve des protines, des glucides et des lipides. Les virus possdant une enveloppe sont les virus envelopps. Les virus ne possdant pas d'enveloppe sont les virus nus.
Virus icosadriques La capside icosadrique entrane une apparence sphrique du virus. Les protomres sont organiss en capsomres, disposs de manires rgulires et gomtriques. Une capsomre est compose de cinq ou six protomres : appeles pentons aux sommets et hexons au niveau des faces et des arrtes. Parmi les virus icosadriques, les parvovirus ont une capside forme de 12 capsomres, les poliovirus 32 capsomres, les papillomavirus 72 capsomres tandis que la capside des adnovirus est constitue de 252 capsomres.

virions icosadriques au microscope lectronique. Virus hlicodaux

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Ces virus sont de longs cylindres (300 400 nm), creux, composs dun type de protomre enroul en spirale hlicodale formant des anneaux appels capsomres. Ils peuvent tre rigide ou flexible. Le matriel gntique est log lintrieur du tube. Le virus de la mosaque du tabac est un exemple de virus hlicodal trs tudi.

Schma dune capside hlicodale. Virus envelopps En plus de la capside, certains virus sont capables de sentourer dune structure membranaire emprunte la cellule hte. Cette enveloppe membranaire est compose dune bicouche lipidique qui peut possder des protines codes par le gnome viral ou le gnome de lhte. Cette enveloppe donne quelques avantages aux virions par rapport ceux composs dune capside seule, comme la protection vis--vis denzymes ou de composs chimiques. Les virus envelopps sont par contre plus fragiles dans l'environnement extrieur, sensibles aux dtergents et la dessiccation. Les glycoprotines, formant des spicules, fonctionnent comme des rcepteurs permettant de se fixer sur des cellules htes spcifiques. Le virus de la grippe (famille des Orthomyxoviridae), le VIH, virus du SIDA (famille des Retroviridae), sont des exemples de virus envelopps. Schma dun virus envelopp : le VIH. Virus complexes Ces virus possdent une capside symtrique qui nest ni hlicodale, ni vraiment icosadrique. Les bactriophages comme le phage T4 dEscherichia coli sont des virus complexes possdant une tte icosadrique lie une queue hlicodale laquelle sont attachs des poils et des fibres caudales. Le poxvirus (variole, vaccine) est aussi un exemple de virus complexe. C'est le virus animal parmi les plus grands (250 350 nm de long sur 200 250 nm de large). Certains virus se prsentent sous formes bacillaires. C'est le cas du virus de la rage (famille des Rhabdoviridae) et du virus Ebola.

Schma dun bactriophage.

Rplication
Multiplication virale Les virus ne peuvent se rpliquer quau sein de cellules vivantes. Cest linteraction du gnome viral et de la cellule hte qui aboutit la production de nouvelles particules virales. Linfection dune cellule par un virus, puis la multiplication du virus peuvent se rsumer en diffrentes tapes. Toutefois, aprs pntration du virus dans la cellule, ces tapes peuvent diffrer selon la nature du virus en question et notamment selon quil sagit dun virus ADN ou dun virus ARN. 1. Adsorption du virus au contact de la membrane de la cellule infecte, grce des rcepteurs spcifiques 2. Pntration dans la cellule 3. Dcapsidation (libration de l'acide nuclique)

Virus 4. 5. 6. 7. Rplication du gnome viral Synthse de protines virales Assemblage et encapsidation des particules virales produites Libration des virions hors de la cellule-hte

Culture des virus Afin de mieux connatre leur biologie, leur multiplication, leur cycle de reproduction et ventuellement afin de prparer des vaccins, il est ncessaire de cultiver les virus. Ceux-ci peuvent se multiplier uniquement au sein de cellules vivantes. Les virus infectant les cellules eucaryotes sont cultives sur des cultures de cellules obtenues partir de tissus animaux ou vgtaux. Les cellules sont cultives dans un rcipient en verre ou en plastique, puis sont infectes par le virus tudi. Les virus animaux peuvent aussi tre cultivs sur ufs embryonns et parfois chez lanimal, lorsque la culture in vitro est Culture de virus : technique des plages de lyse. impossible. Les virus bactriens peuvent galement tre cultivs par inoculation dune culture bactrienne sensible. Les virus de vgtaux peuvent aussi tre cultivs sur des monocouches de tissus vgtaux, des suspensions cellulaires ou sur des plantes entires. Les virus peuvent ensuite tre quantifis de diffrentes manires. Ils peuvent tre compts directement grce la microscopie lectronique. Dans le cas des virus bactriens, la technique des plaques (ou plages) est trs utilise pour valuer le nombre de virus dans une suspension. Une dilution de suspension virale est ajout une suspension bactrienne, puis lensemble est rparti dans des botes de Petri. Aprs culture, des zones claires (plages) la surface de la glose sont la consquence de la destruction dune bactrie et des bactries adjacentes par un virion. Les virus peuvent tre purifis grce diverses mthodes de biochimie (centrifugation diffrentielle, prcipitation, dnaturation, digestion enzymatique).

Origine
Tout tre vivant peut tre infect par un virus. Il existe des virus de bactries (les bactriophages), des virus d'Archaea, des virus d'algues (Phycodnaviridae), des virus de plantes, des virus fongiques, des virus d'animaux, parmi lesquels on trouve de nombreux agents pathognes, et mme des virus de virus[11]. Il existe plusieurs hypothses concernant l'origine et l'volution des virus. Il est probable que tous les virus ne drivent pas d'un anctre commun et les diffrents virus peuvent avoir des origines diffrentes. Les virus et les cellules ont pu apparatre dans la soupe primordiale en mme temps et voluer paralllement. Dans ce scnario, au dbut de lapparition de la vie, les plus anciens systmes gntiques d'auto-rplication (probablement de l'ARN) sont devenus plus complexes et se sont envelopps dans un sac lipidique pour aboutir au prognote l'origine des cellules. Une autre forme rplicative aurait pu garder sa simplicit pour former des particules virales. Les virus pourraient driver de cellules ayant subi une rgression. D'aprs cette hypothse, les anctres des virus auraient t des tres vivants libres ou des micro-organismes devenus des prdateurs ou des parasites dpendants de leur hte. Les relations de parasitisme entranent la perte de nombreux gnes (notamment les gnes pour le mtabolisme apports par l'hte). Cet organisme aurait co-volu avec la cellule hte et n'aurait conserv que sa capacit rpliquer son acide nuclique et le mcanisme de transfert de cellule cellule. Cette hypothse s'appuie notamment sur l'existence des rickettsies, petites bactries ayant rgress un tel point qu'elles ne peuvent survivre que dans une cellule hte, et rappelant les virus.

Virus Les virus peuvent avoir pour origine des morceaux d'acides nucliques qui se sont chapps du gnome cellulaire pour devenir indpendants. Ce phnomne pourrait avoir eu lieu lors derreurs au cours de la rplication du matriel gntique. Les virus pourraient aussi avoir pour origine des plasmides (molcules dADN circulaires) ou des transposons (squences d'ADN capables de se dplacer et de se multiplier dans un gnome).

Rle dans l'volution

Les virus ont un rle naturel important de vhicule pour le transfert de gnes entre des espces diffrentes, ce qui accroit la diversit gntique, et permet de dissminer des innovations gntiques au-del de la descendance de l'individu porteur de cette mutation gntique[12]. On pense que les virus ont jou un rle central dans les premiers temps de l'volution, avant la diversification entre bactries, archaea et eucaryotes et l'poque du Dernier anctre commun universel de la vie sur terre. Les virus sont encore l'un des plus grands rservoirs sur la Terre de diversit gntique inexplore[13].

Virus et maladies
Les virus possdent diffrents mcanismes leur octroyant diverses possibilits stratgiques d'infection, dont l'incidence provoque ventuellement des maladies. Le virion pntre une cellule hte plus ou moins spcifique o il se dsagrge, librant son contenu qui en s'activant prend le pas sur les fonctions cellulaires normales. ce niveau, les effets cytopathognes des virus peuvent entraner divers effets nfastes. Les capacits de synthse protique de la cellule infecte peuvent tre dtournes ou inhibes, tandis que la chromatine est fragmente par des enzymes virales. Des particules virales saccumulent dans le cytoplasme avant de s'assembler en virions. La surcharge virale endo-cellulaire provoque enfin la mort de la cellule hte par lyse, librant les virions qui vont ensuite dissminer. Lorsque le virus pntre dans une cellule non permissive, il ne peut pas se multiplier. Son gnome peut cependant subsister sous la forme dun pisome libre ou intgr au gnome cellulaire. Il y a transformation cellulaire virale lorsque le gnome du virus entre en interaction avec lADN du gnome cellulaire. On appelle ces virus des virus oncognes. Parmi ceux-ci, les rtrovirus, en sintgrant dans le gnome cellulaire, peuvent devenir tumorigne et ventuellement entraner des cancers. La capacit dun virus dentraner une maladie est dcrite en termes de pouvoir pathogne tandis que son intensit est exprime en termes de virulence. La classification des principaux groupes de virus, et leurs correspondances en pathologie, se trouvent dans l'encyclopdie mdicale Vulgaris. Cette classification est notamment base sur le type de molcule d'acides nucliques (ARN ou ADN) dont est constitue le virion.[14]

Maladies humaines
Le rhume, la grippe, la varicelle, la rougeole, la mononuclose infectieuse sont des exemples de pathologies humaines relativement courantes d'origine virale. On connat d'autres exemples plus nocifs comme le SIDA, le SRAS, la grippe aviaire, la variole, ou le virus Ebola qui entrane des fivres hmorragiques. Quelques exemples de virus pathognes pour Homo sapiens : VIH, virus du SIDA Rtrovirus Coxackie A virus Ebola Virus de la variole Virus de la grippe Virus de la fivre jaune
Virus Ebola.

Virus Virus du Nil occidental Cytomgalovirus Rotavirus Virus de l'Hpatite C Virus simien 40 ou SV40

Prvention et traitements
tant donn que les virus utilisent la machinerie cellulaire de lhte pour se reproduire lintrieur mme de la cellule, il est difficile de les liminer sans tuer la cellule hte. Des mdicaments antiviraux permettent cependant de perturber la rplication du virus. Une autre approche est la vaccination qui permet de rsister linfection. Divers mdicaments permettent de traiter les symptmes lis linfection. Les patients demandent souvent[rf.ncessaire] leurs mdecins quils leurs prescrivent des antibiotiques, mais ils sont sans effet sur les virus. Les antibiotiques interfrent en effet avec des constituants ou le mtabolisme des bactries et permettent donc de traiter seulement les maladies dorigine bactrienne et non les maladies d'origine virale. Diverses mthodes de dsinfection in vitro permettent dinactiver les virus (hypochlorite de sodium 1 %, thanol 70 %, glutaraldhyde 2 %, formaldhyde).

Le virus de la polio.

Biotechnologie
Les virus prsentant en gnral un matriel gntique simpliste, ce sont d'excellents outils dans ltude de la biologie molculaire et la biologie cellulaire. Ils permettent la manipulation de fonctions cellulaires, ce qui permet d'en approfondir notre comprhension et d'luder certains mcanismes molculaires de la gntique comme la rplication de l'ADN, la transcription, les modifications post-transcriptionnelles de lARN, la traduction, le transport des protines et limmunologie. Les virus peuvent tre utiliss comme vecteur de gne au sein de cellules cibles. Outil utilis par exemple pour faire acqurir une cellule la capacit de produire une protine d'intrt ou pour tudier leffet de lintroduction du nouveau gne dans le gnome. Certains virus sont utiliss en thrapie gnique pour soigner diverses maladies d'origine gntique. Il s'agit par exemple de remplacer un gne dfectueux provoquant des troubles fonctionnels ou mcaniques. Les virus sont galement utiliss dans la lutte contre le cancer. Certains virus sont capables de dtruire spcifiquement des cellules cancreuses.[rf.ncessaire]

Virus

Classification
Les virus sont classifis selon la nature de l'acide nuclique de leur gnome (ADN ou ARN), la structure de l'acide nuclique (monocatnaire ou bicatnaire), la forme de l'acide nuclique (linaire, circulaire, segment ou non). Les donnes morphologiques peuvent galement tre prises en compte (prsence ou absence d'enveloppe, symtrie de la capside). Souvent, le srogroupage est encore utilis pour raffiner la dfinition des diffrences entre virus trs proches.

Virus de procaryotes
Il existe deux catgories de virus de procaryotes selon le type dhte quils parasitent. La premire catgorie regroupe ceux qui infectent les bactries et sont appels bactriophages. La deuxime catgorie regroupe ceux qui infectent les Archaea. Il existe quatre grands groupes morphologiques de virus de procaryotes. Les virus symtrie binaire. Ce groupe reprsente prs de 96 % des virus de procaryotes et correspond aux familles des Myoviridae, des Siphoviridae et des Podoviridae. Les virus symtrie cubique avec une capside icosadrique mais pas de queue comme les Microviridae. Les virus symtrie hlicodale qui ont une forme de filaments comme les Inoviridae comme le phage M13. Les virus plomorphes, sans capsides vritable mais possdant une enveloppe. Ce groupe rassemble six familles de virus dont cinq regroupent des virus infectant seulement les arches. Certains virus darches sont plomorphes, alors que dautres ont des formes de bouteilles, de citron, de fuseau[15]. Les bactriophages possdent un rle dans les cosystmes. Par exemple, dans les cosystmes aquatiques, ils participent au contrle de labondance et de la diversit bactrienne[16].

Virus d'eucaryotes
Virus d'animaux En principe spcifique d'une espce ou d'un groupe de phylums gntiquement proches, les virus ont tendance infecter un type cellulaire ou tissulaire principal ou exclusif. Cependant, il existe de nombreux virus, comme la rage, qui sont moins spcifique un hte par comparaison avec d'autres virus comme la maladie de Carr, le virus de limmunodficience fline ou la variole. Les virions se propagent principalement par contact direct entre individus, mais peuvent aussi diffuser sous forme arosol ou par les excrtions diverses (vomis, urines, selles, larmes...) et d'ventuels parasites (moustiques, tiques, puces...). Virus des plantes

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La structure des virus des plantes ou phytovirus, est similaire celle des virus bactriens et animaux. Beaucoup de virus vgtaux se prsentent sous la forme de minces et longues hlices. La majorit ont un gnome compos dARN. Les virus de vgtaux peuvent tre dissmins par le vent ou par des vecteurs comme les insectes et les nmatodes, parfois par les graines et le pollen. Les virus peuvent aussi contaminer la plante par lintermdiaire dune blessure ou dune greffe. Diffrents types de symptmes peuvent apparatre sur la plante infecte. Les virus peuvent provoquer des taches ou des fltrissements sur les feuilles et les fleurs. Des tumeurs peuvent survenir sur les tiges ou les feuilles. Le virus de la mosaque du tabac (TMV ou tobamovirus) est un exemple trs tudi de virus de vgtaux.

Microscopie lectronique de particules du virus de la mosaque du tabac.

Virus des insectes Les baculovirus sont des virus dinsectes trs tudis. Ils infectent principalement les lpidoptres. La larve de linsecte sinfecte en ingrant de la nourriture. partir du tube digestif, linfection peut se transmettre aux autres tissus. L'utilisation de virus pathognes d'invertbrs dans la lutte contre les insectes ravageurs des cultures et des forts pourraient tre l'un des moyens pour limiter ou remplacer les insecticides chimiques. Les baculovirus sont aussi utiliss en biologie molculaire pour exprimer un gne tranger (protine recombinante) dans des cultures de cellules d'insecte. Par ailleurs, certains virus de vgtaux sont transmis par des invertbrs mais ne se multiplient pas chez ces vecteurs. Virus des myctes Les virus des champignons sont particuliers car ils se propagent lors de la fusion cellulaire. Il n'y a pas de virions extracellulaires. Chez les levures comme Saccharomyces, les virus sont transmis au moment du brassage cytoplasmique lors de la fusion cellulaire. Les champignons filamenteux comme Penicillium ou le champignon de Paris Agaricus bisporus peuvent galement tre infects par des virus.ce qui peut entraner des problmes lors de production. Il a t imagin d'utiliser ces virus dans le cadre d'une lutte biologique contre des champignons pathognes.

Virus de virus
Rcemment dcouvert (2008)[17], Sputnik [18] est un cas part capable d'infecter un autre virus (Mamavirus) appartenant la classe des virus gants [19] (gnome de plus de 300 000 pb et taille suprieure 0,2 m). On connait aussi d'autres virophages comme Mavirus[20] associ CroV roenbergensis).
[21]

(un virus gant infectant Cafeteria

Notes et rfrences
[1] Le pluriel latin de virus n'est pas connu. Bien que se terminant par "-us", on le considre comme un nom neutre de la 2e dclinaison; son pluriel serait alors "vira". La forme "viri" est une faute grammaticale: c'est le pluriel des mots masculins de la 2e dclinaison; "virii" est un barbarisme. En anglais, la marque du pluriel pour un mot se terminant par "s" est "-es"; la forme "viruses" se retrouve d'ailleurs le plus souvent dans la littrature mdicale et professionnelle. [2] Page 111 du livre Une histoire des microbes (http:/ / books. google. fr/ books?id=yMIuk-q4hbcC& lpg=PA111& dq="Martinus Beijerinck" toxine liquide& pg=PA111#v=onepage& q="Martinus Beijerinck" toxine liquide& f=false) de Patrick Berche, 2007, ISBN 978-2-7420-0674-8

Virus
[3] La premire mention du terme virus apparat chez Virgile avec le sens de "liquide sanieux et purulent" (http:/ / www. persee. fr/ web/ revues/ home/ prescript/ article/ pharm_0035-2349_1998_num_86_318_4639_t1_0218_0000_1) [4] http:/ / hal. archives-ouvertes. fr/ docs/ 00/ 04/ 59/ 36/ PDF/ tel-00004194. pdf [5] LWOFF J Gen Microbiol. 1957 Oct; 17(2):239-53.

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1/ les virus ne contiennent quun seul type dacide nuclique (ADN ou ARN) qui constitue le gnome viral. 2/ les virus se reproduisent partir de leur matriel gntique et par rplication. 3/ les virus sont dous de parasitisme intracellulaire absolu.
[6] Franois Jacob, Quest-ce que la vie ? in La Vie, Universit de tous les savoirs, Editions Odile Jacob, 2002. [7] Raoult D., Audic S., Robert C., Abergel C., Renesto P., Ogata H., La Scola B., Suzan M., Claverie J.-M., The 1.2-megabase genome sequence of Mimivirus, Science, 2004 Nov 19;306(5700):1344-50. [8] M. Haring et al., Independant virus development outside a host, Nature, vol. 436, p.1101-1102, 2005 [9] Patrick Forterre, Three RNA cells for ribosomal lineages and three DNA viruses to replicate their genomes : a hypothesis for the origin of cellular domain, PNAS, vol. 103 (10), pp. 3669-3674, 2006 [10] Ali Sab, Les virus, inertes ou vivants ? in Pour la Science, dcembre 2006. [11] dcouverte d'un virophage (http:/ / www. techno-science. net/ ?onglet=news& news=5672) [12] Canchaya C, Fournous G, Chibani-Chennoufi S, Dillmann ML, Brssow H ; Phage as agents of lateral gene transfer, Curr. Opin. Microbiol.,volume 6, issue 4, pages 41724 (Aot 2003) ,pmid 12941415, doi 10.1016/S1369-5274(03)00086-9 [13] Forterre P, Philippe H;"The last universal common ancestor (LUCA), simple or complex?", The Biological Bulletin, volume 196, issue 3, pages 3735, 3757, Juin 1999, pmid 11536914, doi 10.2307/1542973, (http:/ / www. biolbull. org/ cgi/ pmidlookup?view=long& pmid=11536914) [14] http:/ / www. vulgaris-medical. com/ encyclopedie/ virus-4811. html [15] Prangishvili, D., P. Forterre, and R. A. Garrett. 2006. Viruses of the Archaea: a unifying view. Nat Rev Microbiol 4:837-48. [16] K. E. Wommack and R. R. Colwell (2000) Virioplankton: Viruses in Aquatic Ecosystems. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 64, 69-114 [17] Virology: A Virus gets a Virus (http:/ / www. nature. com/ nrmicro/ journal/ v6/ n10/ full/ nrmicro2002. html), Nature Reviews, 2008 [18] Siyang Sun, Structural Studies of the Sputnik Virophage, Journal of Virology, Journal of Virology, vol.84, no2, janvier2010, p.894897 [ lien PMID (http:/ / www. ncbi. nlm. nih. gov/ pubmed/ 19889775), lien DOI (http:/ / dx. doi. org/ 10. 1128/ JVI. 01957-09)] [19] Correspondance, Nature Reviews Microbiology, vol.7, pp. 615-625, 2009 [20] Fischer MG, Matthias G. and Curtis A. Suttle (2011) A virophage at the origin of large DNA transposons. Science 332 (6026) 231-234 [21] Matthias G. Fischer, Michael J. Allen, William H. Wilson, and Curtis A. Suttle, Giant virus with a remarkable complement of genes infects marine zooplankton, Proceedings of the National Academy of Sciences, vol.107, no45, 2010, p.1950819513 [ lien PMID (http:/ / www. ncbi. nlm. nih. gov/ pubmed/ 20974979), lien DOI (http:/ / dx. doi. org/ 10. 1073/ pnas. 1007615107)]

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