1.

- DATOS DE LA ASIGNATURA Nombre de la asignatura: Microbiologa Carrera: Ingeniera Bioqumica Clave de la asignatura: BQO - 0525 Horas teora-horas prctica-crditos 3-4-10

2.- HISTORIA DEL PROGRAMA

Lugar y fecha de elaboracin o Participantes revisin Instituto Tecnolgico Representantes de las de Tuxtepec del 17 academias de Ingeniera al 21 de Enero de Bioqumica. 2005

Observaciones (cambios y justificacin) Reunin Nacional de Evaluacin Curricular de la Carrera de Ingeniera Bioqumica. de los la de

Academia de Ingeniera Anlisis y enriquecimiento Institutos las propuestas de Tecnolgicos de Bioqumica. programas diseados en Culiacn, Jiquilpan, reunin nacional Tepic evaluacin Abril del 2005

Instituto Tecnolgico Comit de Consolidacin Definicin de los programas de Tepic del 25 al 29 de la carrera de de estudio de la carrera de de abril del 2005 Ingeniera Bioqumica. Ingeniera Bioqumica

3.- UBICACIN DE LA ASIGNATURA a). Relacin con otras asignaturas del plan de estudio Anteriores Asignaturas Bioqumica II Temas Metabolismo del nitrgeno. Replicacin, transcripcin y traduccin de la informacin gentica. Posteriores Asignaturas Temas Cintica qumica y Cintica biolgica microbiana. Aseguramiento de Anlisis de riesgos y la calidad puntos crticos de control.

Qumica Analtica Turbidimetra Potenciometra Espectrofotometra Nefelometra Gravimetra

b). Aportacin de la asignatura al perfil del egresado Proporcionar las herramientas necesarias para la manipulacin y control de los microorganismos en procesos bioqumicos para el aprovechamiento racional de los recursos naturales.

4.- OBJETIVO(S) GENERAL(ES) DEL CURSO Comprender el papel fundamental que desempean los microorganismos en la generacin y resolucin de problemas del entorno.

5.- TEMARIO 1 Introduccin a la Microbiologa. 1.1 Concepto y contenido de la. Microbiologa. 1.1.1 Concepto y su implicacin. 1.1.2 Objeto de estudio de la Microbiologa. 1.1.3 Ubicacin de los microorganismos en los sistemas de clasificacin. Desarrollo histrico de la Microbiologa 1.2.1 Periodo especulativo. 1.2.2 Los primeros microscopistas. 1.2.3 El cultivo de microorganismos. 1.2.4 Winogradsky, Beijerinck, Kluyver y van Niel. Relaciones entre la Microbiologa y otras ciencias biolgicas. 1.3.1 Conexiones entre la Bioqumica y la Microbiologa. 1.3.2 Relacin entre la Gentica y la Microbiologa. Importancia de la Microbiologa. 1.4.1 Perspectivas de la Microbiologa a nivel mundial y nacional. 1.4.2 Aplicaciones en el mbito industrial, alimentario y ambiental.

1.2

1.3

1.4

5.- TEMARIO (Continuacin) 2 Mtodos y tcnicas microbiolgicas bsicas. 2.1 Aislamiento y seleccin de microorganismos. 2.1.1 Reservorio de microorganismos. 2.1.1.1 Agua, suelo y aire. 2.1.1.2 Animales y plantas. 2.1.1.3 Colecciones. 2.1.2 Mtodos y tcnicas de aislamiento y seleccin. 2.1.2.1 Estra en placa. 2.1.2.2 Vertido en placa. 2.1.2.3 Extensin en placa con varilla de vidrio. 2.1.2.4 Enriquecimiento poblacional. 2.1.2.5 Diluciones en serie. 2.1.2.6 Micromanipulacin. 2.1.2.7 Otros. 2.1.3 Seleccin de microorganismos de inters industrial: screening. Cultivo de microorganismos. 2.2.1 Clasificacin de los microorganismos con base a sus requerimientos nutricionales 2.2.2 Tipos de nutrientes. 2.2.2.1 Macronutrientes. 2.2.2.2 Micronutrientes. 2.2.2.3 Factores de crecimiento. 2.2.3 Medios de cultivo. 2.2.3.1 Evolucin y clasificacin de los medios de cultivo. 2.2.3.2 Preparacin de medios de cultivo. 2.2.4 Mtodos de cultivo. 2.2.4.1 Cultivo mixto. 2.2.4.2 Cultivo puro o axnico. 2.2.4.3 Cultivos en ambiente controlado.

2.2

5.- TEMARIO (Continuacin) 2.2.5 Esterilizacin y asepsia. 2.2.5.1 Conceptos e importancia. 2.2.5.2 Mtodos de esterilizacin. 2.2.5.3 Muerte trmica: valores D y Z. Criterios utilizados en la identificacin de microorganismos. 2.3.1 Caracteres morfolgicos y fisiolgicos. 2.3.2 Pruebas bioqumicas. 2.3.3 Caracteres quimiotaxonmicos 2.3.4 Antgenos microbianos. 2.3.5 Caracteres genticos. Preservacin de microorganismos. 2.4.1 Objetivos de la preservacin. 2.4.2 Concepto y utilidad del cepario. 2.4.3 Mtodos de mantenimiento y preservacin y su viabilidad Bacteria (Eubacteria). 3.1.1 Morfologa y estructura bacteriana. 3.1.1.1 Tamao, forma y agrupaciones. 3.1.1.2 Estructuras superficiales. 3.1.1.3 Pared celular. 3.1.1.4 Membrana y transporte. 3.1.1.5 Citoplasma y contenido. 3.1.1.6 Apndices filamentosos. 3.1.1.7 Endosporas bacterianas. 3.1.2 Reproduccin bacteriana. 3.1.2.1 Ciclo celular bacteriano. 3.1.2.2 . Control del ciclo celular.

2.3

2.4

Microorganismos procariotas.

3.1

5.- TEMARIO (Continuacin) 3.1.3 Metabolismo bacteriano. 3.1.3.1 Fuentes de carbono y energa. 3.1.3.2 Diversidad metablica y productos del metabolismo bacteriano. 3.1.4 Clasificacin de las eubacterias. 3.1.4.1 Criterios de clasificacin y nomenclatura. 3.1.4.2 Grupos representativos. 3.1.5 Importancia de las eubacterias. Archae (Archaebacteria). 3.2.1 Caractersticas generales. 3.2.2 Estructura celular. 3.2.3 Metabolismo arqueano. 3.2.4 Metanognicas, halfilas extremas, termfilas extremas. 3.2.5 Importancia de las arqueobacterias. Hongos pluricelulares y unicelulares. 4.1.1 Ubicacin taxonmica. 4.1.2 Tamao y morfologa de mohos y levaduras. 4.1.3 Estructura de mohos y levaduras. 4.1.3.1 Estructuras vegetativas. 4.1.3.2 Pared celular. 4.1.3.3 Membrana citoplsmica. 4.1.3.4 Citoplasma y contenido. 4.1.4 Crecimiento y reproduccin. 4.1.4.1 Crecimiento vegetativo 4.1.4.2 Reproduccin en mohos y levaduras. 4.1.5 Clasificacin de hongos. 4.1.5.1 Criterios utilizados. 4.1.5.2 Principales gneros.

3.2

Microorganismos eucariotas

4.1

5.- TEMARIO (Continuacin) 4.1.6 Actividades metablicas en mohos y levaduras. 4.1.6.1 Produccin de metabolitos intracelulares. 4.1.6.2 Produccin de metabolitos extracelulares. 4.1.7 Importancia aplicada. Algas microscpicas. 4.2.1 Caractersticas generales. 4.2.2 Clasificacin y distribucin natural. 4.2.3 Cultivo de algas. 4.2.4 Importancia ecolgica y agroalimentaria. Protozoos. 4.3.1 Ubicacin taxonmica. 4.3.2 Morfologa, estructura y reproduccin. 4.3.3 Grupos representativos. 4.3.4 Importancia sanitaria y ambiental. Introduccin. Morfologa y estructura de virus. 5.2.1 Forma y tamao. 5.2.2 Estructura del genoma. 5.2.3 Estructura de la cpside. 5.2.4 Envolturas virales y cidos nucleicos. Estrategias de replicacin. 5.3.1 Ciclo ltico. 5.3.2 Ciclo lisognico. Metodologa para el estudio de los virus. 5.4.1 Aislamiento y cultivo. 5.4.2 Deteccin y caracterizacin. Clasificacin de virus. 5.5.1 Criterios para su clasificacin. 5.5.2 Virus animales, vegetales y bacterifagos. Partculas subvirales: viroides, ARNs satlites, virusoides y priones. Importancia aplicada de los virus y partculas subvirales

4.2

4.3

Virus y partculas subvirasicas.

5.1 5.2

5.3 5.4

5.5

5.6 5.7

5.- TEMARIO (Continuacin) 6 Crecimiento y propagacin 6.1 de microorganismos. Conceptos bsicos. 6.1.1 Crecimiento individual y poblacional. 6.1.2 Tasa de crecimiento y tiempo de generacin. 6.1.3 Crecimiento exponencial y sincrnico. Determinacin del crecimiento. 6.2.1 Medida de masa microbiana. 6.2.1.1 Mtodos directos. 6.2.1.2 Mtodos indirectos. 6.2.2 Medida del nmero de individuos. 6.2.2.1 Mtodos directos. 6.2.2.2 Mtodos indirectos. Tipos de Cultivo. 6.3.1 Cultivo sumergido. 6.3.2 Cultivo en medio slido. Factores fsicos y qumicos que influyen en el crecimiento microbiano. El genoma microbiano. 7.1.1 Organizacin de los genes diferencias entre procariotas y eucariotas. 7.1.2 Plsmidos: tipos y funciones. Variabilidad gentica en microorganismos. 7.2.1 Mutacin. 7.2.2 Recombinacin. 7.2.3 Secuencias de insercin, transposones e integrotes. Transmisin de caracteres genticos entre bacterias. 7.3.1 Restriccin y modificacin del DNA. 7.3.2 Transformacin: incorporacin del DNA. 7.3.3 Transduccin: generalizada y especializada. Conjugacin bacteriana: plsmidos conjugativos y transferencia de genes cromosmicos.

6.2

6.3 6.4 7 Gentica microbiana. 7.1

7.2

7.3

7.4

5.- TEMARIO (Continuacin) 7.5 Manipulacin gentica de microorganismos y mejora de cepas industriales. 7.5.1 Mtodos clsicos. 7.5.1.1 Mutagnesis: aislamiento de mutantes. 7.5.1.2 Recombinacin. 7.5.1.3 Seleccin. 7.5.2 Ingeniera Gentica. 7.5.2.1 Introduccin. 7.5.2.2 Expresin heterloga. 7.5.2.3 Generalidades de la Ingeniera metablica. 7.5.2.4 La reaccin en cadena de la polimerasa (PCR) 7.5.2.5 Regulacin gentica. 7.5.2.6 La Ingeniera gentica como herramienta en la investigacin microbiolgica y biotecnolgica. 7.5.2.7 Legislacin sobre la manipulacin gentica y la utilizacin de microorganismos modificados.

6.- APRENDIZAJES REQUERIDOS

El agua como disolvente biolgico Rutas alternativas de la gluclisis y del ciclo del cido ctrico Degradacin y biosntesis de biomolculas Turbidimetra, potenciometra, espectrofotometra, nefelometra y gravimetra

7.- SUGERENCIAS DIDCTICAS

Fomentar el uso de tecnologas de la informacin Fomentar el trabajo en equipo y la participacin activa Motivar a los estudiantes con actividades ldicas (maratones del conocimiento, sociodramas, crucigramas), entre otras. Inducir a la investigacin documental y de campo Fomentar la asistencia a eventos acadmicos (congresos, seminarios, entre otros) Generar la reflexin crtica a travs de seminarios y sesiones de discusin Fomentar la investigacin cientfica, creatividad y actitud emprendedora Introducir al estudiante en los mtodos y modos de razonamiento propios de la investigacin cientfica y la discusin crtica de resultados de trabajos cientficos publicados. Vincular los conocimientos tericos con situaciones reales mediante prcticas de laboratorio, experimentos demostrativos en el aula, talleres de solucin de casos, visitas a empresas y centros de investigacin, entre otros. Inducir a la formulacin de ensayos y resmenes Inducir a los estudiantes a realizar exposiciones Brindar ejemplos de hechos recientes relacionados con la Microbiologa que tengan inters e impacto social. Fomentar los valores ticos.

8.- SUGERENCIAS DE EVALUACIN Tipos de evaluacin: diagnstica, formativa y sumativa Autoevaluacin, coevaluacin y heteroevaluacin Participacin individual y en grupo Resmenes, ensayos, cuadros sinpticos, entre otros. Exposiciones Exmenes escritos Desarrollo de las prcticas de laboratorio y reportes de las mismas Reporte de visitas industriales y centros de investigacin Planteamiento y resolucin de problemas Desarrollo y presentacin de proyectos de investigacin en foros

9.- UNIDADES DE APRENDIZAJE UNIDAD 1.- Introduccin a la Microbiologa. Objetivo Educacional Analizar los hechos sobresalientes que dieron origen a la Microbiologa, sus relaciones con otras ciencias, as como sus perspectivas actuales y futuras. Fuentes de Informacin 1,2,3,5,6,7,8, Elaborar y explicar un mapa conceptual, jerarquizando el 9,11. desarrollo histrico de la Microbiologa y sus aportaciones a otras ciencias biolgicas. Formular y entregar un resumen sobre la clasificacin de los microorganismos a travs del tiempo y discutirlo en clase. Leer artculos de publicaciones recientes sobre los avances de la Microbiologa tanto en el mbito internacional como nacional. Analizar y discutir la informacin en sesin plenaria; entregar conclusiones de la discusin Actividades de Aprendizaje

UNIDAD 2.- Mtodos y tcnicas microbiolgicas bsicas. Objetivo Educacional Conocer, seleccionar y aplicar las metodologas empleadas en el estudio, caracterizacin, identificacin y preservacin de los microorganismos. Fuentes de Informacin Realizar prcticas en el laboratorio, 1,2,5,6,7,8,10 11. elaborar y entregar reportes. Analizar en sesin plenaria, los mtodos y tcnicas de aislamiento, seleccin, cultivo, identificacin y conservacin de microorganismos. Actividades de Aprendizaje

UNIDAD 3.- Microorganismos procariotas. Objetivo Educacional Identificar la estructura, fisiologa, clasificacin de eubacterias y arqueobacterias y, analizar su importancia en los diferentes mbitos. Fuentes de Informacin 1,2,5,6,7,8,11 Construir un cuadro sinptico relacionando cada parte estructural de las eubacterias con su funcin y discutirlo en clase. Realizar prcticas en el laboratorio, elaborar y entregar reportes. Realizar investigacin documental sobre la clasificacin de las eubacterias y arqueobacterias; redactar y entregar un resumen del tema; analizarlo y discutirlo en sesin plenaria. Analizar y discutir en sesin plenaria, la importancia de las eubacterias y arqueobacterias en los distintos mbitos; desarrollar y entregar las conclusiones de la discusin. Actividades de Aprendizaje

UNIDAD 4.- Microorganismos eucariotas. Objetivo Educacional Identificar la estructura, fisiologa y criterios de clasificacin de microorganismos eucariotas y analizar su importancia en los diferentes mbitos. Fuentes de Informacin Recabar informacin documental 1,2,5,6,7,8,11 sobre la clasificacin de microorganismos eucariotas; elaborar un resumen del tema y discutirlo en clase. Construir una tabla comparativa relacionando cada parte estructural de clulas microbianas eucariotas, con su funcin y discutirla en clase. Realizar prcticas en el laboratorio, elaborar y entregar reportes. Elaborar un ensayo sobre la importancia de mohos, levaduras, algas y protozoos en los diferentes mbitos y discutirlo en sesin plenaria. Actividades de Aprendizaje

UNIDAD 5.- Virus y partculas subvirasicas. Objetivo Educacional Conocer las caractersticas relevantes de los virus y partculas subvirasicas y analizar su aplicacin en el mejoramiento de cepas. Fuentes de Informacin Realizar una revisin documental 1,2,3,4,5,6,7, sobre los virus y partculas 8,11. subvirsicas. Exponer por equipos, el tema correspondiente. Resolver un cuestionario con informacin de las exposiciones realizadas por el grupo. Actividades de Aprendizaje

UNIDAD 6.- Crecimiento y propagacin de microorganismos. Objetivo Educacional Propagar cultivos microbianos; cuantificar el crecimiento y evaluar el efecto de los factores fsicos y qumicos sobre ste. Fuentes de Informacin 1,2,5,6,7,8,11 Investigar, analizar y contrastar los mtodos utilizados para la medicin del crecimiento microbiano. Elaborar un resumen y discutir en clase la informacin. Realizar las prcticas en el laboratorio, elaborar y entregar reportes. Actividades de Aprendizaje

UNIDAD 7.- Gentica microbiana. Objetivo Educacional Comprender los mecanismos genticos y analizar la aplicacin de los microorganismos en Ingeniera Gentica. Fuentes de Informacin Estructurar y explicar una tabla 3,4,5,9,10,11 comparativa de la organizacin de los genes en procariotas y eucariotas. Investigar sobre: los mecanismos de variabilidad gentica en microorganismos; los tipos de elementos genticos en bacterias y su papel en la fisiologa celular. Elaborar un resumen y discutirlo en sesin plenaria. Buscar en Internet simulaciones de transferencia y recombinacin gentica. Exponer y analizar la informacin en clase. Leer artculos de publicaciones recientes sobre la transferencia y recombinacin gentica en bacterias y el papel de los plsmidos en la conjugacin; analizar los artculos en clase. Realizar investigacin documental y entregar conclusiones del anlisis de los siguientes temas: o La legislacin en la aplicacin de los microorganismos manipulados genticamente. o El impacto de la biotecnologa en los diferentes mbitos. Actividades de Aprendizaje

10. FUENTES DE INFORMACIN Corts, Jos A. Ensayos Microbiolgicos. Manual de Laboratorio. Volumen I y II. Barcelona, Espaa: Revert, 2002. 2. Daz, R. Gamazo, C. y Lpez-Goi. Manual prctico de Microbiologa. Mxico, DF. 2. edicin. Masson. 1988. 3. Ingraham, J.L. y C.A. Ingraham. Introduccin a la Microbiologa. Barcelona, Espaa: Revert, 1998. 4. Izquierdo Rojo. Ingeniera gentica y transferencia gnica. Barcelona, Espaa: Acribia,1999. 5. Jimnez Snchez, A. y Jimnez Martnez, J. Gentica Microbiana. Madrid, Espaa: Ediciones Agapea, 1988. 6. Madigan, M.T., J.M. Martinko y J. Parker. Brock: Biologa de los microorganismos. Madrid, Espaa: 10 edicin. Pearson-Prentice-Hall, 2003. 7. Mc, Kane and Kandel. Microbiologa. Mxico DF: 4. Edicin. McGrawHill Interamericana, 2000. 8. Messley, K. y Norrell, S. Microbiology Lab Manual. 2 ed. Prentice Hall International, 2003. 9. Prescott, L.M., Harley, J.P. y Klein, D.A.. Micorbiologa. Madrid, Espaa: 5. McGraw-Hill Interamericana, 2004. 10. Primrose et. al. Principles of gene manipulation. 6. ed. Blackwell Scientific Publ. 2002. 11. Snyder, L. and Champness, W. Molecular Genetics of Bacteria. Washington, DC. American Society for Microbiology Press. 2nd. Ed. 2003. 12. Tortora, G.J.; Funke, B. R. & Case, L. C. Microbiology: An Introduction. Portland, USA. Eighth edition. Ed. Book News, Inc., 2001. 1.

11. PRCTICAS Clasificacin, preparacin, esterilizacin y manejo del material utilizado en el laboratorio. Diferenciacin, preparacin y esterilizacin de medios de cultivo Determinacin de los parmetros de letalidad trmica: valores D y z Obtencin de cultivos puros, utilizando las diversas tcnicas de aislamiento. Observacin colonial y microscpica de cultivos bacterianos Aplicacin de los mtodos de preservacin de microorganismos y diseo de un cepario. Cultivo de microorganismos en anaerobiosis Identificacin bioqumica de enterobacterias Aislamiento, cultivo y observacin colonial y microscpica de hongos filamentosos y levaduriformes. Produccin de cidos orgnicos por hongos Pruebas de identificacin para levaduras Recuento en placa Tcnica del nmero ms probable (NMP) Curva de crecimiento poblacional en cultivo sumergido Efecto de los agentes fsicos y qumicos sobre el crecimiento microbiano Reaccin en cadena de la polimerasa (PCR)