Epidemiologia

Profa. Dra. Marisa S. A. Renaud Faulin

Conceitos e objetivos

O que epidemiologia? Quais so as populaes importantes para a epidemiologia?

Hospedeiro

Patgeno

Leses

Triangulo da doenas
Hospedeiro

Patgeno

Ambiente

Tetraedro da doena
Homem Hospedeiro Alm da populao do hospedeiro e do patgeno....

Patgeno

Ambiente

Tem outra populao que interfere??

Ambiente e doena
Influencia do ambiente
Favorvel Desfvorvel
PARA QUEM??

A epidemiologia essencialmente uma cincia de campo A. Bergamin Filho (1995)

Todos os estudos epidemiolgicos so feitos a campo?

Ensaios de laboratrio auxiliam o entendimento de epidemias

Ex. de ensaio de laboratrio

( VI ) Influncia da temperatura na eficincia de transmisso por Diaphorina citri
22 C 27 C 32 C

Aquisio em planta fonte

PAA= 4 dias

Inoculao em plantas teste

1 inseto/planta
PAI=24 dias

Avaliaes
qPCR insetos individuais Ef. de aquisio (%) Concentrao bact. no inseto

20 insetos

Casa de vegetao

PCR plantas teste

1- Ca. AM 2- Ca. AS 3- Ca. AS + Ca. AM 4- Planta sadia
Planta teste 10 repeties

Ef. de transmisso (%)

Barbosa et al., 2010

Epidemiologia Epidemia e Endemia

O princpio bsico por trs da epidemiologia que a quantidade de doena no campo determinada pelo balano de dois processos opostos: infeco e remoo A. Bergamin Filho (1995)

O processo infeco O processo remoo

Se: Infeco > remoo = doena aumenta Remoo > infeco = doena no aumenta

Epidemiologia Epidemia e Endemia

Os termos EPIDEMIA e ENDEMIA esto relacionados com o balano dos processos antagnicos infeco e remoo
EPIDEMIA
- Epidemia explosiva - Epidemia tardvaga - Epidemia progressiva - Pandemia

ENDEMIA

Epidemiologia Epidemia e Endemia

Apesar destas diferenas, EPIDEMIA no o oposto de ENDEMIA EPIDEMIA e ENDEMIA se misturam, exibindo uma variao contnua entre os extremos
Vanderplank, 1975

Epidemia cclica Epidemia politica

Epidemiologia: Ciclo da infeco

Didaticamente se pode imaginar a doena como a interao de uma nica planta com uma nica unidade infectiva do patgeno, que resutar na leso A. Bergamin Filho (1995) Ciclo da infeo Tempo do ciclo

Epidemiologia: Ciclo da infeco

Epidemiologia: O monociclo
Doenas monocclicas

Epidemiologia: O policiclo

Doenas policclicas

Monociclo e policiclo no ciclo das relaes patgeno hospedeiro

Disseminao

Infeco

Colonizao

ciclo secundrio

Reproduo Sobrevivncia
ciclo primrio hospedeiro doente
Amorim (1995)

Slide: A. Bergamin Filho

Como crescem as doenas

Doenas de juros simples (monocclicas)

Quais patgenos causam doenas monocclicas?

Murchas, viroses sem vetor, nematides e carves

Verticillium em batata

Como crescem as doenas

Doenas de juros compostos (policclicas) Quais patgenos causam doenas policclicas?
Ferrugens, odios, mldios, antracnoses, manchas foliares em geral, viroses com vetor

Sarna da macieria

Curvas de progresso da doena

a melhor representao de uma doena
Interao entre patgeno, hospedeiro e ambiente Avaliar estratgias de controle Prever nveis futuros de doena

Curvas de progresso da doena

Como a curva de progresso de uma doena de juros simples?

Como a curva de progresso de uma doena de juros compostos?

Curvas de progresso da doena

Fonte: Agrios, 2005

Anlise Espacial
Padres espaciais de doena
o arranjo de entidades doentes umas em relao s outras (Gilligan,1983)
Padres espaciais originam-se das interaes de fatores fsicos, qumicos e biolgicos que influenciam os processos de disperso e infeco. A anlise de padres espaciais pode ser usada para gerar hipteses sobre processos ecolgicos fundamentais (reproduo, disperso...) ou para sugerir como esses processos surgiram.

Anlise Espacial
Alm disso, pode fornecer:
Informao quantitativa populacional do patgeno; da dinmica

Metodologia de amostragem e monitoramento do patgeno; Tomada de patossistema. deciso para o manejo do

Padres espaciais ao acaso e agregado

Ao acaso
Doenas cujos patgenos so veiculados pelo ar

A probabilidade de um esporo cair sobre uma planta hospedeira igual para todas as plantas hospedeiras
Ou seja, a ocorrncia da doena no influenciada pela distncia da fonte de inculo, a fonte pode ser a mesma planta ou uma planta da vizinhana prxima

Padres espaciais ao acaso e agregado

Agregado
Se, em condies naturais, o patgeno for disperso apenas a curtas distncias (respingo de chuva) , a probabilidade de uma planta ser infectada maior para aquelas plantas prximas fonte de inculo do que mais distantes Teremos focos visveis ao redor das fontes primrias de inculo

Padres espaciais ao acaso e agregado

Regularidade ou uniformidade

Numa linha de plantio existem plantas sadias alternadas com plantas doentes
No existe em condies naturais, porm ocorre quando se planta alternadamente variedade suscetvel e variedade resistente

Padres espaciais ao acaso, agregado e regular

ESALQ/USP

Avaliao de doenas de plantas

Patometria: Quantificao de doenas

a medida de intensidade de doenas tem o mesmo papelchave que a diagnose dentro da fitopatologia (Kranz,1988)

Importncia:
avaliar a resistncia de cultivares a patgenos em programas de melhoramento; comparar a eficincia de fungicidas; verificar o efeito das prticas culturais no controle e na intensidade das doenas; construo da curva de progresso da doena; auxiliar na estimativa de danos.

Patometria
Mtodos diretos de avaliao de doenas
Incidncia
Severidade Sensoriamento remoto
Quando devemos avaliar os danos causados por uma doena atravs da incidncia ou severidade?

Intensidade

Quantificao da Incidncia
Nmero de espigas com carvo

Nmero de frutos de pssego com podrido

Nmero de berinjela com murcha de Verticillium

Quantificao da Severidade
Chaves descritivas
Escala para avaliao da severidade dos sintomas de MSC

0 = planta sadia ou aparentemente sadia 1 = planta com sintoma inicial da doena (folhas da copa perderam o brilho e a colorao verde-escura) 2 = planta com sintoma severo (desfolha parcial e com poucas brotaes internas) 3 = planta morta

Slide: Marcel Bellato Spsito - Fundecitrus

Quantificao da Severidade
Escalas diagramticas
Escalas para avaliao da severidade da Mancha Marrom de Alternaria em citros

Quantificao da Severidade
Anlise por imagens de vdeo por computador

Slide: Marcel Bellato Spsito - Fundecitrus

Quantificao da Severidade
Anlise por imagens de vdeo por computador

DISPRO - Programa computadorizado de treinamento de avaliao de doenas foliares do amendoim, Iowa Univ., EUA
DISTRAIN - Programa computadorizado de treinamento de avaliao da severidade de doenas foliares de cereais, USDA, EUA QUANT - Software para quantificao de doenas de plantas Autores: Vale, F.X.R; Liberato, J.R.; Fernandes, E.Instituio: Universidade Federal de Viosa, 2003

Slide: Marcel Bellato Spsito - Fundecitrus

Intensidade
Intensidade x incidncia Intensidade x severidade

MORAES, S.A. de Quantificao de doenas de plantas. 2007.

Sensoriamento Remoto
As informaes da radiao refletida pelas plantas formas uma espcie de assinatura espectral do dossel

Decorrente das interaes das radiaes transmitidas, absorvidas e refletidas

Plantas doentes plantas sadias e entre diferentes doenas

Sensoriamento Remoto
Plantas sadias possuem baixa reflectncia na luz visvel (400 a 700nm) e infravermelho curto (1200 a 2400nm) e alta reflectncia no infravermelho prximo (700 a 1200nm) Medidos por fotografias areas (filmes, filtros e cmeras), radimetros e imagens areas) H problemas

Sensoriamento remoto

www.guiaverde.com

Mtodos indiretos de avaliao de doenas

Usados quando h reduo de vigor, enfezamento ou mesmo diminuio da produo Indexao e tcnicas sorolgicas: vrus Contagem de indivduos: nematides Distribuio espacial: fungos disseminados pelo ar Produo: dano/perda

Amostragem
Tcnica de amostragem:
Aps a escolha do mtodo de avaliao, a amostragem uma das etapas fundamentais para que avaliao das doenas seja representativa da populao original, devendo ser feita de maneira criteriosa. Estimativa errada da quantidade de doena (amostragem incorreta) decises de controle no adequadas (perdas na produo)

Amostragem
A escolha da tcnica de amostragem depende da distribuio da doena no campo
As principais tcnicas so: Amostragem ao acaso doenas com distribuio uniforme no campo. Raro

Amostragem sistemtica as amostras so coletadas segundo determinados critrios pr-determinados, em funo do tipo de distribuio da doena, da finalidade, etc. Ex: a cada 10 linhas atravessar o talho coletando uma planta a cada 20m

Amostragem
A escolha da tcnica de amostragem depende da distribuio da doena no campo
Amostragem estratificada: populao heterognea (distribuio de plantas doentes em agregados). Para isso a populao de plantas deve ser dividida em estratos homogneos (diminuir variabilidade e aumentar acurcia)

Amostragem

Amostragem
Unidade amostrada e tamanho da amostra:
A unidade e o tamanho da amostra dependem da caracterstica da doena, do objetivo do levantamento (avaliaes em parcelas experimentais, manejo integrado das doenas, caracterizao do nvel de resistncia, etc.) e do modelo de disperso da doena.

Amostragem
Devem-se estabelecer previamente alguns critrios, como: -tipo de amostra (folhas, fololos, ramos, planta inteira, frutos, sementes, etc.)

-tamanho da amostra (nmero de folhas, ramos, etc. ou pontos de amostragem)

- local ou pontos de amostragem (coleta representativa da planta, rea experimental ou da cultura, marcao de plantas ou ramos).

Amostragem
-poca de amostragem estdios de crescimento da cultura, em funo da caracterstica de cada doena. - nmero de amostragens durante o ciclo da planta em funo da finalidade, estdio fenolgico da planta, curvas de progresso da doena, etc.

A tabela abaixo mostra o estado da arte dos tratamentos localizados relacionados fitossanidade

Fonte: Oerket, 2010

Considerando a tabela anterior

Plantas daninhas o fator mais prximo do emprego de tecnologias de preciso em proteo de plantas, seguidas dos nematides, pragas e das doenas; No Brasil, muitos nematides, pragas e doenas j possuem nveis de dano aceitveis, formas de monitoramento, bem como diagnstico e prognstico estabelecido. Haver no futuro uma evoluo da anlise psprocessada (off-line) para a anlise em tempo real (sensores) Foco em servios de gesto da variabilidade data management fatores espaciais e temporais