Exame de Bioqumica

(2 valores) 1. A figura esquematiza uma clula.

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a) Indique a que tipo de organismo a clula pertence. b) Preencha 3 elementos da legenda da figura. c) Indique, com base no tipo de organismo onde decorrem as seguintes cinco vias metablicas: gliclise, ciclo dos cidos tricarboxlicos, beta-oxidao de cidos gordos, transcrio e traduo. (1,5 valores) 2. O grupo -carboxilo do cido glutamico (glutamato) tem um pKa = 4.3. a) Que fraco destes grupos esto desprotonados (i.e., na forma -COO-) em soluo diluda de cido glutmico a pH = 5.0. b) E a pH = 3.8. c) Calcule as cargas formais do glutamato para os valores de pH das alneas anteriores. (0,5 valores cada questo) 3. Entre que grupos qumicos dos aminocidos se estabelece a ligao peptdica na formao de um pptido ou protena? 4. Qual a molcula que funciona na transferncia de informao do ncleo para o citoplasma? 5. Defina anabolismo 6. Como que regulada a actividade hidroltica da ATP sintase? Para que serve esta regulao. 7. Resuma as funes atribudas via dos fosfatos de pentose. 8. O ATP a unidade energtica da clula. Que tipo de biomolcula ? Indique os seus componentes.

(6 valores) 6. Diga se verdadeiro ou falso, e justifique ou corrija se falso. a) As hlices e folhas so tipos de arranjos estruturais que as cadeia peptdicas adoptam e so elementos da estrutura terciria de uma protena. b) Para a replicao do DNA so necessrias vrias enzimas, incluindo a DNA polimerase,a topoisomerase, a helicase e a primase. c) A RNA polimerase II responsvel pela transcrio dos genes que codificam protenas nos procariotas d) A traduo o processo atravs do qual se sintetiza uma molcula de RNA a partir da mensagem contida no DNA. e) O trocador aninico bicarbonato-cloreto uma protena intrnseca da membrana que actua como transportador antiporte de ies sdio e cloreto. f) Os triglicridos eo colesterol esterificado no fazem parte da bicamada lipdica. g) O colesterol e seus derivados so uma classe de lpidos chamados esterides. h) A Maltose (O--D-glucopiranosil-(1,4)- ou -D glucopiransido) e a celobiose (O--D-glucopiranosil(1,4)- ou -D glucopiransido) so disidos resultantes da degradao da celulose e do amido, respectivamente. i) Uma hexocetose um glcido composto por um esqueleto de 5 carbonos que tem um grupo aldedo. j) Se a clula estiver a degradar cidos gordos pela beta-oxidao, o fluxo da gliclise aumenta. k) O enzima piruvato cinase, que cataliza o ltimo passo da via, modulado por aco feed forward positivo. A entrada de glucose na clula activa-o directamente. l) A citrato sintase um enzima que pertence via da gliconeognese e que conjuga um acetil-CoA com um oxaloacetato dando origem a citrato. (1 valores) 7. Um estudante desenvolveu vrios passos para purificar a ribonuclease, uma protena que possui massa molecular aproximadamente de 13 000 Da. Quando analisou uma fraco da protena, por electroforese em gis de poliacrilamida contendo SDS, observou a presena de dois polipptidos contaminantes. O polipptido A com massa molecular de 14 000 e o polipptido B com massa molecular 75 000. A anlise dos polipptidos por focagem isoelctrica revelou que o polipptido A possui um ponto isoelctrico 4 unidades mais acdico do que o da ribonuclease, enquanto que o polipptido B possui um pI idntico ao da protena que se pretende purificar. a) Indique uma tcnica de cromatografia que permita separar a ribonuclease do contaminante A. Fundamente a sua resposta com base nos princpios da tcnica que escolheu. b) Esquematize o resultado que esperaria ver num gel bidimensional se aplicasse a fraco da ribonuclease com os dois contaminantes (A e B).

(1,5 valores) 8. Os triglicridos ou triacilglicridos so biomolculas que servem de armazenamento energtico nos eucariotas. a) Indiquea que tipo de biomolculas pertencem. b) Indique a sua estrutura bsica. c) Diga que componente pode servir para a clula obter energia e atravs de que via metablica. (2 valores) 9. Um fragmento de DNA resultante de um corte EcoRI foi clonada num plasmdeo. O plasmdeo resultante tem 8 kb.

a) b) c) d)

Com base no mapa de restrio diga o tamanho do insert. Se fizer um digesto do plasmdeo com HindIII quantos produtos obtm , e de que tamanho Diga a que linha no gel de agarose corresponde a digesto do plasmdeo com HindIII. Imagine que o insert corresponde a um gene. Quantos aminocidos ter a protena resultante?

(3 valores) 10. Com base no esquema apresentado indique:

a) Que via metablica est representada. b) Classifique o tipo de via (ex., anablica e linear). c) Preencha os metabolitos (nmeros) e enzimas (letras) d) Indique um tipo de biomolculas cuja degradao pode alimentar este ciclo. e) Indique quais os enzimas que so pontos de regulao desta via. f) Se houver nveis elevados de ATP na clula esta via ser activada ou inibida.