VI Congresso Brasileiro de Engenharia Qumica em Iniciao Cientfica

1/6

UTILIZAO DE TCNICAS DE QUMICA COMPUTACIONAL PARA A ELABORAO DE BANCO DE ESTRUTURAS QUMICAS POLIMRICAS A SEREM UTILIZADAS NO ESTABELECIMENTO DE CORRELAES DE PREDIO DE PROPRIEDADES FSICO-QUMICAS DE POLMEROS Fonseca, F. A. S.1, Trochmann, J.L.2 e Ravagnani, S. P.3* 1 Aluno de Iniciao Cientfica, 2 Aluno de Doutorado, 3 Orientador Departamento de Tecnologia de Polmeros Faculdade de Engenharia Qumica Universidade Estadual de Campinas Cidade Universitria "Zeferino Vaz" - Caixa Postal 6066 - CEP 13081-970 Campinas - SP - Brasil e-mail: ravag@feq.unicamp.br

RESUMO - As propriedades fsico-qumicas de uma certa substncia so conseqncia de sua estrutura molecular. Sabendo disso, possvel inferir as propriedades de uma substncia qualquer conhecendo apenas sua estrutura qumica e, analogamente, prever qual estrutura qumica forneceria certas caractersticas desejadas. Tal conhecimento facilita consideravelmente a busca por materiais com propriedades especficas pois dispensa a produo de diversas substncias diferentes direcionando esforos para um nmero reduzido de molculas. Na tecnologia de polmeros, o projeto ou modificao de uma nova molcula facilitado atravs do uso de modelos quantitativos de predio de correlaes entre estrutura qumica e propriedades fsicas. Esse processo conhecido pela sua sigla em ingls: QSPR (Quantitative Structure Property Relationships). O presente trabalho consiste na realizao das primeiras etapas do mtodo QSPR e tem como objetivo a construo de um extenso banco de dados necessrio para futuros projetos. Para tanto, foram utilizados os softwares ISIS DRAW + NOM. da MDL e HyperChem, verso Demo, produzido pela Hypercube, Inc.

INTRODUO Partindo de propriedades fsicas de substncias conhecidas possvel inferir qual sua estrutura qumica, e vice-versa. Desta maneira, conhecendo uma estrutura qumica prdeterminada, pode-se prever, antes da prpria existncia da molcula, suas propriedades fsicas. Em termos prticos, isso significa que, estando em busca de um material com propriedades especficas, no necessria a

produo de diversas substncias diferentes e a posterior medio direta de suas propriedades. preciso, apenas, prever qual estrutura qumica forneceria tais propriedades desejadas, reduzindo o universo de possibilidades de produo de novas molculas e aumentando, significativamente, as chances de acerto nas etapas experimentais do desenvolvimento deste material. Na tecnologia de polmeros, o projeto ou modificao de uma mol-

VI Congresso Brasileiro de Engenharia Qumica em Iniciao Cientfica

2/6

cula visando novas propriedades feito utilizando-se o mtodo Quantitative Structure Property Relationships, usualmente conhecido pela sigla QSPR (Bicerano, 1996; Katritzky et al., 1998; Krevelen, 1990). O processo de trabalho baseia-se no uso de modelos quantitativos de predio de correlaes entre estrutura qumica e propriedades fsicas e consiste, basicamente, na coleta das propriedades fsicas de interesse em molculas cujas estruturas qumicas sejam conhecidas (Bicerano, 1996) e que sero usadas como base para a regresso quelas propriedades. As estruturas qumicas so, ento, representadas graficamente em sua forma bidimensional e, em seguida, uma imagem tridimensional gerada, atravs de ferramentas computacionais baseadas em clculos vetoriais, respeitando os tamanhos dos tomos, de suas ligaes qumicas e seus ngulos de ligao, assim como as interaes distncia. Essa ltima imagem representa a molcula em uma configurao espacial qualquer. Sabe-se que a ponte entre estrutura qumica e propriedade fsica a representao geomtrica da estrutura e sua energia potencial. Porm, ao se representar uma estrutura molecular, muito pouco provvel que a configurao espacial de menor energia tenha sido respeitada, sendo necessrio, portanto, que tal configurao seja determinada. Infelizmente, essa determinao no simples, pois o campo de energia potencial de uma macromolcula apresenta uma grande quantidade de estados locais de mnima energia. Um mtodo de minimizao de energia busca encontrar um destes mnimos locais, onde a interao entre os tomos constituintes da estrutura em estudo sofra uma fora resultante correspondente temperatura de zero absoluto, ou seja, uma foto congelada do sistema.

METODOLOGIA De forma simplificada, o mtodo QSPR pode ser descrito pelas seguintes etapas: 1. Escolha das Molculas a serem estudadas; 2. Representao Bidimensional; 3. Representao Tridimensional; 4. Otimizao Geomtrica; 5. Clculo do Descritores; 6. Anlise Estatstica e 7. Validao dos Resultados. O presente trabalho consistiu na realizao das quatro primeiras etapas do mtodo QSPR, gerando um extenso banco de dados que servir de ponto de partida para outros projetos de predio de propriedades de polmeros. Tais projetos visam desenvolver uma ferramenta computacional com o auxlio de modelos estatsticos e de redes neurais, para facilitar a pesquisa de novos compostos polimricos em funo de propriedades especficas. Primeiramente, realizou-se uma ampla pesquisa sobre dados disponveis na literatura para certos valores de propriedades fsicas e, com base nesta anlise, foram escolhidos 500 polmeros a serem estudados. Fez-se, ento, o levantamento das sries homlogas das molculas de interesse e deu-se incio elaborao do Banco de Dados Bidimensional utilizando o software ISIS DRAW + NOM. da MDL.. Para a representao bidimensional das unidades repetitivas foi realizado um amplo estudo das Regras da Nomenclatura Oficial para polmeros, alm de pesquisas em banco de dados j existentes na Literatura e da utilizao de catlogos e sites de empresas produtoras de polmeros, como por exemplo, a SigmaAldrich.

VI Congresso Brasileiro de Engenharia Qumica em Iniciao Cientfica

3/6

Com o Banco de Dados Bidimensional concludo, foi possvel a representao tridimensional das molculas e, em seguida, a otimizao de tais estruturas atravs de clculos para a configurao de menor energia. Para tanto, foi utilizado o pacote computacional HyperChem, verso Demo, produzido pela Hypercube, Inc. Mtodos de Clculo Aps inserir uma estrutura bidimensional no programa necessrio selecionar qual mtodo de clculo ser usado para que se atinja a configurao espacial de menor energia. O HyperChem 7.01 dispe de quatro diferentes mtodos: 1. Mecnica Molecular; 2. Semi-emprico; 3. Ab initio e 4. Density Functional. Para a realizao do projeto, o mtodo escolhido foi o Semi-emprico. O mtodo semi-emprico: Os eltrons de um tomo ou de uma molcula esto associados a uma funo de onda (r ) , que obedece equao de Schrdinger independente do tempo: d 2 (r ) + V (r ) (r ) = E (r ) 2m dr 2
2

(1)

onde E a energia do eltron num campo de energia potencial V (r ) independente do tempo. O mtodo semi-emprico resolve a Equao de Schrdinger, com certas aproximaes, para descrever as propriedades dos eltrons de tomos e molculas. A fim de simplificar e encurtar esses clculos, o mtodo semiemprico faz diversas consideraes e simplificaes, entre elas o de realizar os clculos apenas para os eltrons de valncia, negligenciar as integrais de certas interaes, usar funes base-

adas em orbitais eletrnicos nootimizados e fazer uso de parmetros experimentais. interessante ressaltar que, devido a tais parmetros experimentais, elimina-se a necessidade do clculo de certas quantidades e da correo de erros gerados por aproximaes. H vrios mtodos semiempricos e a maioria deles possui maneiras de eliminar certos clculos para orbitais sobrepostos que consumiriam tempo em demasia. Essa tcnica conhecida pela sigla NDO (Neglect of Differential Overlap), e consiste em negligenciar muitas das integrais que descreveriam as interaes entre eltrons de orbitais sobrepostos. Ao utilizar o programa HyperChem 7.01, tm-se disposio os seguintes mtodos semi-empricos: Extended Hckel, CNDO, INDO, MINDO3, MNDO, MNDO/d, AM1, PM3, ZINDO/1, ZINDO/S, e TNDO. Todos estes mtodos, exceto o Extended Hckel, fazem uso do mtodo de Hartree-Fock (ou mtodo SCF - Selfconsistent field) que, iterativamente, responsvel pelas energias de repulso entre os eltrons na soluo da Equao de Schrdinger. O mtodo SCF torna o trabalho mais simples por considerar que os movimentos dos eltrons so independentes e que um eltron interage com o campo principal de todos os outros eltrons em uma molcula. Um clculo SCF sempre se inicia pela estimativa da funo de onda que descreve os orbitais eltricos e suas respectivas repulses. Baseado nessa estimativa, o programa calcula uma nova funo de onda e compara os dois resultados obtidos. O processo , ento, repetido at que resultado e estimativa convirjam. A cada iterao, o orbital torna-se mais prximo do real, chegando, enfim, ao ponto em que o limite de convergncia alcanado.

VI Congresso Brasileiro de Engenharia Qumica em Iniciao Cientfica

4/6

O mtodo escolhido para a realizao do projeto foi o mtodo PM3, que apresenta parmetros experimentais para diversos elementos dos grupos principais e para alguns metais de transio. Algoritmos de Otimizao Aps a escolha do mtodo, ainda preciso selecionar o algoritmo que ser utilizado para a otimizao geomtrica. Para o mtodo semi-emprico, o HyperChem 7.01 oferece quatro algoritmos diferentes: Steepest Descent, Fletcher-Reeves, Polak-Ribieri e Eigenvector-Following. O algoritmo escolhido para a realizao do projeto foi o de PolakRibiere: uma tcnica de gradiente conjugado que utiliza buscas unidimensionais e apresenta a mais rpida convergncia entre os algoritmos disponveis, exigindo, entretanto, mais memria da mquina que o estiver computando. Parmetros para o fim das Iteraes preciso, ainda, informar ao programa os parmetros que determinaro o fim das iteraes para a minimizao de energia: O gradiente RMS (root-mean-square) e o nmero mximo de ciclos. Um gradiente representa a taxa de variao (primeira derivada) da energia de um sistema molecular em funo da posio de seus tomos, e, computando-se as foras de todos os tomos em um nico valor, encontrase o gradiente RMS. Um gradiente nulo indica que uma configurao de mnimo de energia foi alcanada. Assim, quando as iteraes chegam a um valor para o gradiente RMS menor do que aquele que foi previamente fixado, o programa assume que os resultados convergiram e que a configurao de menor energia foi encontrada. Para a realizao do projeto, o valor fixado

para o gradiente RMS foi de 0,1 kcal/ mol. Porm, h situaes em que a configurao da molcula no converge para um mnimo de energia. Ento, para evitar que se perca tempo em demasia com clculos que no conduziro a um resultado vlido, insere-se no programa um nmero mximo de ciclos permitidos para as iteraes. Quando esse nmero alcanado, as iteraes cessam e o programa indica que no foi possvel calcular a configurao de mnima energia. Para a realizao deste projeto, o nmero mximo de ciclos utilizado foi o sugerido pelo prprio HyperChem 7.01, ou seja, quinze vezes o nmero de tomos presente na molcula em estudo. RESULTADOS As Figuras 1, 2 e 3 exemplificam monmeros presentes no Banco de Dados de Estruturas Qumicas Bidimensionais.

Figura 1: Poly (p-n-propoxy-methyl styrene)

As Figuras 4, 5 e 6 exemplificam monmeros presentes no Banco de Dados de Estruturas Qumicas Tridimensionais.

VI Congresso Brasileiro de Engenharia Qumica em Iniciao Cientfica

5/6

Figura 2: Poly (n-benzyl methacrylamide)

Figura 5: Poly (n-benzyl methacrylamide)

Figura 3: Poly (n-vinyl carbazole)

Figura 6: Poly (n-vinyl carbazole)

Figura 4: Poly (p-n-propoxy-methyl styrene)

Para algumas molculas, a visualizao bidimensional das estruturas otimizadas pode ser um exerccio complexo. Portanto, interessante que o banco dados 3D seja mantido em um software tridimensional, para que a molcula possa ser constantemente rotacionada, facilitando sua visualizao.

Alm de fornecer a representao tridimensional da estrutura, o HyperChem gera, ao fim de cada otimizao, um arquivo com todos os dados referentes s iteraes e com diversas anlises acerca da molcula em estudo. De tais arquivos pode-se obter diversas informaes teis, entre as quais o nmero total de eltrons e de orbitais, a populao de eltrons em cada orbital, a carga total do sistema, a carga de cada tomo isoladamente, as coordenadas cartesianas (em Angstroms) que localizam quaisquer dos tomos presentes na molcula e o gradiente de energia para cada tomo em cada uma das direes do plano cartesiano.

VI Congresso Brasileiro de Engenharia Qumica em Iniciao Cientfica

6/6

CONCLUSO Ao fim dos trabalhos, o projeto alcanou seus objetivos principais. Foram gerados dois grandes bancos de dados: O primeiro, de estruturas bidimensionais, foi gerado com ajuda do software ISIS DRAW + NOM. da MDL e est, portanto, armazenado em arquivos com extenso .skc (referente a este programa). J o segundo banco de dados, de estruturas tridimensionais em suas configuraes de menor energia, foi gerado com a ajuda do software HyperChem 7.01 da HyperCube Inc. e est armazenado em arquivos com extenso .hin (referente a este programa). interessante ressaltar que o HyperChem 7.01 no um software livre, o que dificulta a utilizao dos arquivos de extenso .hin (banco de dados tridimensional) em trabalhos posteriores. Felizmente, o HyperChem fornece um arquivo com as coordenadas cartesianas de todos os tomos presentes na molcula, tornando possvel a reconstituio da estrutura otimizada em qualquer software tridimensional. Portanto, mais importante que o banco de dados de arquivos .hin o banco de dados dos arquivos de extenso .log (formato texto) gerados durante a otimizao das molculas. Assim, o projeto cumpriu o seu

papel, gerando extensos bancos de dados que sero posteriormente utilizados em projetos de pesquisa que visam estabelecer novas correlaes para a predio de propriedades fsicoqumicas de polmeros. REFERNCIAS BICERANO, J. (1996), Prediction of Polymers Properties, Marcel Dekker Inc., New York. KATRITZKY, A. R. ; SILD, S.; LOBANOV, V. ; KARELSON, M., Quantitative Structure Property Relationships (QSPR) Correlations of Glass Transition Temperature of High Molecular Weight Polymers J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1998, 38, 300-304 KREVELEN, D. W. v. (1990), Properties of Polymers; Their Correlation with Chemical Structure; Their Numerical Estimation and Prediction From Additives Groups Contribution, 3rded. Elsevies. AGRADECIMENTOS FAPESP, pela bolsa Iniciao Cientfica concedida. de