elemente macrobiogene (macroelemente) 99% (hidrogenul, oxigenul, carbonul,
azotul, fosforul i calciul)
elemente oligobiogene (oligoelemente) 0,05-1% (magneziu, sodiu, potasiu, fier, sulf, clor); elemente microbiogene (microelemente), (cupru, cobalt, zinc, mangan, fluor, iod, molibden, etc). COMPOZIIA CHIMIC A MATERIEI VII BIOELEMENTE Combinaii minerale apa i electrolii Rolul apei: mediu pentru reaciile biologice, solvent pentru numeroi metabolii vehicul n organism, component structural al anumitor constitueni ai materiei vii. Srurile minerale structural, catalitic, fizico-chimic, influennd echilibrul osmotic, acido- bazic i electric n esuturi. Combinaii organice constitueni organici fundamentali glucide, lipide, proteine, acizi nucleici, efectori biochimici enzime, hormoni, vitamine, mediatori chimici ai influxului nervos, Organismul poate fi considerat ca un sistem eterogen dispers, mediul de dispersie fiind apa. CAPITOLUL I - PROTEINE 1. Aspecte generale 2. Aminoacizii 3. Peptide 4. Proteine 4.1. Structura proteinelor 4.1.1. Structura primara 4.1.2. Structura secundara 4.1.3. Structura tertiara 4.1.4. Structura cuaternara 1. Aspecte generale
definitie = macromolecule de natur polipeptidic, constituenii cei mai caracetristici ai materiei vii, cu cel mai nalt grad de complexitate, varietate molecular i specificitate. denumirea grec proteios primul, cel dinti, primordial rolul biologic morfo-funcional Enzime hormonii transportori specifici pentru diferite molecule sau ioni proprieti mecanice Anticorpilor intervin i n transmiterea semnalelor intra- i intercelulare prin intermediul unor receptori de natur proteic. contracia muscular Din punct de vedere chimic conin obligatoriu patru elemente: C, H, O, N, foarte des i S, mai rar P i alte elemente Fe, Cu, Zn, Mg, Ca, etc. Unitile fundamentale = aminoacizii
2. Aminoacizi
Definitie = substane organice cu funciuni mixte, amino (-NH 2 ) i carboxil (-COOH) Dintre cei 200 aminoacizi gsii n natur, 20 sunt specificai prin codul genetic Caracteristici -aminoacizi au activitate optic, aminoacizii naturali L-aminoacizi. Clasificare
A. Alifatici B. Ciclici I. Simplii a. monoaminomonocarboxilici I. Aromatici b. monoaminodicarboxilici II. Heterociclici c. diaminomonocarboxilici II. Micti a. hidroxiaminoacizi b. tioaminoacizi dup posibilitatea de a fi sau nu sintetizai de organism: Aminoacizi eseniali 8 aminoacizi: Val, Leu, Ile, Thr, Met, Phe, Lys, Trp. Aminoacizi semieseniali Arg i His Aminoacizi neeseniali
Glicina (Gly) Alanina (Ala) Valina (Val) H 3 N CH COO CH H 3 C CH 3 + - H 3 N CH COO CH 3 + - H 3 N CH 2 COO + - Leucina H 3 N CH COO + - CH 2 CH H 3 C CH 3 Izoleucina (Ile) H 3 N CH COO CH 3 + - CH 2 CH CH 3 - H 3 N CH COO + - CH 2 C O O Acidul aspartic (Asp) Asparagina (Asn) H 3 N CH COO + - CH 2 C O NH 2 Acidul glutamic (Glu) - H 3 N CH COO + - (CH 2 ) 2 C O O + - Glutamina (Gln) H 3 N CH COO (CH 2 ) 2 C O NH 2 Arginina (Arg) + - H 3 N CH COO (CH 2 ) 2 CH 2 NH C NH 2 + N H 2 Lizina (Lys) (CH 2 ) 3 + CH 2 N H 3 + - H 3 N CH COO Serina (Ser) + - H 3 N CH COO CH 2 OH Threonina (Thr) CH 3 CH OH + - H 3 N CH COO Cisteina (Cys) + - H 3 N CH COO CH 2 SH Metionina (Met) + - H 3 N CH COO CH 2 CH 2 S CH 3 Fenil alanina (Phe) CH 2 + - H 3 N CH COO Tirozina (Tyr) CH 2 + - H 3 N CH COO OH NH H N + - CH 2 CH COO N H 3 + Histidina (His) Triptofan (Trp) NH - CH 2 CH COO N H 3 + Prolina (Pro) NH - COO 1. Glicina -n cantiti mari n colagen, gelatin, elastinsi glutation. Conjug acizii biliari 2. Alanina face legtura ntre metabolismul proteic i cel glucidic. 3. Valina - albuul de ou, globulinele serice i cazeina conin cantiti mari de Val. 4. Leucina - globina din Hb 5. Acidul aspartic - rol important n biosinteza ureei, a nucleotidelor purinice i pirimidinice; este un neurotransmitor excitator. 6. Acidul glutamic -cazein, proteinele din SN, proteinele vegetale intr n structura glutationului; este un neurotransmitor excitator. 7. Serina - intr n structura situsului catalitic a multor enzime hidrolitice 8. Cisteina - grupareaSH din cistein reprezint centrul activ al tiolenzimelor 9. Triptofanul -in organism este transformat n nicotinamid (vit. PP), serotonin i melatonin.
3. Peptide
Definitie = substane compuse din dou sau mai multe molecule de aminoacizi, legate ntre ele prin legturi peptidice (-CO-NH-).
Peptidele difer ntre ele, n afar de numrul i felul aminoacizilor constitueni i prin secven, adic prin ordinea n care acetia se leag unul de cellalt.
prin conventie captul din stnga - aminoacidul care are gruparea -NH 2 liber, formnd captul N-terminal, iar ultimul aminoacid din partea dreapt care are gruparea -COOH liber formeaz captul C-terminal al lanului polipeptidic. Denumirea peptidelor denumirea aminoacizilor + sufixul il Ex: Val-Ala-Tyr-Ser se numete Valil-alanil-tirozil-serina. Clasificarea peptidelor dup numrul de aminoacizi din structur: - peptide <10 aminoacizi; - polipeptide, 10-100 aminoacizi - Proteine >100 aminoacizi.
H 2 N CH CO NH CH CO R 1 R 2 R n NH CH COOH capt N-terminal capt C-terminal Peptide cu importan biologic
Carnozina (-alanil histidina) i anserina (N-metilcarnozina) - n esutul muscular Glutationul ( glutamil-cistenil-glicina) participa n reaciile redox din celule. Muli hormoni: insulina, ocitocina, vasopresina, ACTH, gonadotropinele Endorfinele sunt neuropeptide, cu aciune analgezic asemntoare morfinei, sintetizate de hipofiz i hipotalamus Antibioticele de tip peptidic - acidul 6-aminopenicilanic - o peptid atipic a L-valinei cu L-cisteina. H 3 C H 3 C C S CH COOH CH N CH NH 2 C=O CO NH CH CO NH CH 2 COOH (CH 2 ) 2 CH 2 -SH CH NH 2 COOH Glutation (G SH) 2G SH -2H +2H G S S G 4. Proteine
Proteinele sunt polipeptide cu structur complex, cu greutate molecular cuprins ntre 10 4 -10 6
daltoni, valori caracteristice pentru macromolecule. Grania ntre polipeptide i proteine este arbitrar. Se estimeaz c numrul de tipuri de proteine din lumea vie este de 10 10 -10 12 .
4.1. Structura proteinelor
patru nivele de organizare, i anume: structura primar, secundar, teriar i pentru unele i cuaternar.
4.1.1. Structura primar
numrul total de aminoacizi, natura lor i ordinea n care se succed n catena polipeptidic.
Componena n aminoacizi -hidroliz total a moleculei, prin fierbere cu HCl 6N, dup care aminoacizii se separ cromatografic i se dozeaz spectrofotometric.
Secvena aminoacizilor. Prima secven a fost determinat de Sanger n 1955 pentru insulin. Pn n prezent s-a reuit s se stabileasc structura primar la peste 3000 de proteine.
4.1.2. Structura secundar determin orientarea n spaiu a lanului polipeptidic, datorit legturilor de hidrogen ntre gruprile -CO- i -NH- din legturi peptidice diferite, n cadrul aceluiai lan (intracatenar) sau din lanuri diferite (intercatenare). Cele mai stabile conformaii sunt acelea care permit formarea celor mai multe legturi de hidrogen. Pauling i Corey (1951) 2 modele de structur secundar
Structura -helix (-keratina) dup care lanul polipeptidic adopt o form rsucit (spiralat) i are la baz legturi de hidrogen intracatenare;
Structur de foaie pliat (- keratina) n care lanul polipeptidic adopt o form ncreit, legturile de hidrogen apar intracatenar sau intercatenar.
4.1.3. Structura teriar (conformaia) Indic dispoziia spaial a lanului polipeptidic, care rezult prin nsumarea tuturor legturilor existente ntre diferiii radicali. sunt posibile 4 tipuri de legturi
O O CH CH CH CH CH CH CH 2 CH CH CH 2 CH 2 O HO P=O O b. H 3 C CH 3 H 3 C CH 3 c. OH d. CH CH CH 2 CH 2 S S a. CH CH CH 2 (CH 2 ) 4 O=C O NH 3 + C - - a) Legturi covalente -legturi disulfurice -legturi fosfodiesterice b) Legturi ionice c) Legturi apolare (hidrofobe) d) Legturi de hidrogen 4.1.4. Structura cuaternar nu este ntlnit la toate proteinele, ci numai la cele care sunt alctuite din mai multe lanuri polipeptidice, separate, denumite protomeri sau subuniti proteice = protein oligomer. funcia proteinei oligomere se manifest numai la nivelul structurii cuaternare, protomerii separai sunt inactivi. Hemoglobina este o protein oligomer. -Hematiile normale conin mai multe specii moleculare de hemoglobin. - Componenta principal, n sngele adultului, este hemoglobina A (Hb A) format din dou lanuri (141 aminoacizi) i dou lanuri (146 aminoacizi). - Fiecare lan leag cte un hem, iar activitatea de transport a oxigenului se manifest numai la nivelul tetramerului.