O desaparecimento do ginásio em 19 de Fevereiro de 1941 alterou as
necessidades de infra-estruturas e a respectiva prioridade. Fazia agora falta um novo edifício para a Educação Física que possuísse também uma piscina ao ar livre com as dimensões de 25m x 12,5m.
No ano de 1995 foram iniciadas as obras de recuperação e da cobertura
amovível da piscina. No dia 3 de Março de 1996, no 193º aniversário do Colégio Militar, foi, depois de totalmente recuperada, reposta em funcionamento a piscina, parte integrante do edifício da Educação Física que fora inaugurado 47 anos antes.