DISTRIBUCIN DE UN ANTICANCERGENO EN UN MIMTICO DE MEMBRANA BIOLGICA. CLCULO DE ENERGA LIBRE EMPLEANDO DINMICA MOLECULAR.

Vctor Bahamonde1, J.J. Lopez Cascales2, Maximiliano Martnez3, Ramiro ArayaMaturana3 y Boris E. Weiss-Lpez1
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Universidad de Chile, Facultad de Ciencias, Departamento de Qumica, Casilla 653, Email: bweiss@uchile.cl 2 Universidad Politcnica de Cartagena, rea de Qumica Fsica, Aulario II, Campus de Alfonso XIII, 30203 Cartagena, Murcia, Espaa. 3 Universidad de Chile, Facultad de Ciencias Qumicas y Farm., Depto. Qumica Orgnica y Fisicoqumica, Universidad de Chile
Resumen

Hemos calculado la distribucin de un anticancergeno en una bicapa, un smil de membrana, a travs del perfil de la variacin de la energa libre de Gibbs (G) al introducir el husped en la bicapa. Para este propsito empleamos la tcnica Umbrella Sampling implementada en el programa GROMACS. La simulacin ha sido validada reproduciendo los parmetros de orden medidos experimentalmente. La figura 1 muestra el perfil de energa libre con respecto a la posicin a lo largo del eje z del sistema, la normal al plano de la bicapa; el cero corresponde al centro de la bicapa. La variacin de energa libre se ha calculado con respecto a su valor en la zona acuosa. A partir de este clculo, el anticancergeno se encuentra en la regin de la interfaz del sistema modelado, donde el valor de G encuentra un mnimo.

Figura 1
Referencias. MacCallum, J. L.; Bennett, W. F. D.; Tieleman, D. P. Biophysical journal 2008, 94, 3393-404.