COMPONENETES FUNDAMENTALES DE LOS CIDOS NUCLEICOS Los acidos nucleicos ( DNA y RNA) esta constituidos por la union de numerosos

nucleotidos, de 4 tipos. Como introduccin a su estudio, se consideran algunos aspectos de interes para cada uno de los componentes estructurales de dichas unidades, los nucleotidos:

COMPONENETES CIDO: FOSFATOS MONOFOSFATOS El fosfato inorgnico (Pi), mezcla de las pespecies quimicas resultantes de la disociacion de la molecula de acido fosforico, aparece com oanion a pH acido, como dianion a pH fisiologico y como trianion a pH alcalino. En a celula, el fosfato se encuentra en forma libre (Pi) o formando parte de numerosos compuestos organicos (RP), por ejemplo, los nucleotidos.

DIFOSFATOS El bifosfato o pirofosfato (PPi) se presenta a pH fisologico como trianion (una de las 4 formas ionicas del acido pirofosforico). Es estable en disolucin a pH neutro o alcalino; sin embargo, dentro de la celula es inestable por accion de las pirofosfatasas, formando 2 Pi. Aparece combinado fundamentalmente en nuclesidos-difosfato ( por jemplo, ADP).

TRIFOSFATOS El trifosfato (PPPi) se presenta a pH fisiologico como tetraanin. No aparece en forma libre, sino formando parte, esencialmente, de nuclesidos-trifosfato (por ejemplo, ATP).

TIPOS DE ENLACES FOSFATO Pueden distinguirse cinco tipos de enlaces fosfato que van a formar parte de los nucleotidos. Obsrvese la estructura y nombre de todos ellos, asi como la diferencia entre enlace ster y anhdrido en los nucleotidos difosfatados y trifosfatados.

COMPONENTE NEUTRO: AZCARES El azcar (inicialmente llamado osa) siempre es una pentosa (5 tomos de carbono), bien la D-ribosa o la D-desoxirribosa. La ribosa (nombre derivado de osa de Rockefeller Institute of Biochemistry, 1908) interviene en nuclesidos y nucletidos bajo su forma mas estable, -D-ribofuranosa.

La formula representada como ejemplo puede extenderse a otras muchas molculas de inters bioqumico: D-glucosa, D-galactosa, 3-desoxi-D-ribosa, etc. COMPONENTE BSICO: BASES NITROGENADAS Son molculas heterocclicas, con ms de un tomo de nitrgeno, formadas por un anillo nico (pirimidina) o por dos anillos condensados (purina). Obsrvense en los ejemplos de bases que intervienen en los cidos nucleicos la numeracin de los tomos de heterociclo y la posicin de los sustituyentes externos. BASES NITROGENADAS MS FRECUENTES: 2TIPOS

A modo de resumen, la posicin de los sustituyentes presentes en cada una de las bases nitrogenadas es:

OTRAS BASES DE INTERS BIOLGICO Y CLNICO Existen otras bases putinicas y pirimidinicas, en general poco frecuentes, que surgen por modificacion de las bases principales A, G, C y U o de alguno de sus analogos (hipoxantina, H). Son de origen natural o sintetico, intervienen en pocesos como la metilacion del DNA en la celula y muestran distintas propiedades (antibiticas, antivricas, antitumorales, etc).

PROPIEDADES FISICOQUMICAS DE LAS BASES PURNICAS Y PIRIMIDNICAS EXISTENCIA DE DIPOLOS Todas las bases poseen atomos electronegativos de O (excepto adenina), en posicin exociclica o extranuclear, y de N, tanto exociclicos como en el anillo, nucleares. Como consecuencia, son abundantes los enlaces polares, lo que les permite interaccionar entre

si mediante puentes de hidrogeno, que poseen una importancia capital en la estructura secundaria de los acidos nucleicos, en especial del DNA. HIDROFOBICIDAD La naturaleza aromtica de los anillos hace que las bases tengan un marcado carcter apolar, sean hidrofobicas y poco solubles en agua al pH celular, cercano ala neutralidad. A pH acido o alcalino adquieren carga y se hacen ms solubles en agua. Como ya se estudiaran, las interacciones hidrofobicas de apilamiento, que tienen lugar entre bases dispuestas paralelamente (a modo de monedas apiladas), son ensenciales para estabilizar la estructura tridimensional de los acidos nucelicos. DISPOSICION COPLNAR DE LOS ENLACES DE CADA ANILLO (C-N Y C-C) Se debe al carcter aromatico, y se puede observa r en modelos espaciales:

TAUTOMERIA O SIOMERIA DINAMICAS Es una isomeria de grupos funcionales. Consiste, con carcter general, en la migracin de los atomo hidrogeno unido a un atomo de C, O o N hacia otro atomo adyacente. El tipoo mas frecuente es la tautomeria ceto-enlica.

Son muchos los compuestos orgnicos que existen como mezclas de 2 o mas de estas formas tautomtricas, interconvertibles y en equilibrio. Entre los compuestos heterocclicos son de especial importancia las tautomerias en las bases purinicas y pirimidinicas, en las cuales la migracin del H tiene lugar desde un tomo de N nuclear hacia otro tomo extranuclear, y viceversa:

En consecuencia, las tautomeras de las bases nitrogenadas son las siguientes:

Desde el punto de vista qumico, en las bases libres las formas tautomricas lactima (enol) e imina son menos estables, y por ello son unas 10.000 veces menos abundantes que sus correspondientes tautomeros lactama (ceto) y amina, con lo que el equilibrio se encuentra desplazado hacia la izquierda. CARCTER BSICO Todas las bases nitrogenadas son bases debiles, pues sus atomos de N, tanto nucleares como extranucleares, se pueden protonar, con valores de pKa comprendidos entre 9 y 10. Como ejemplo representativo, obsrvese la ionizacin de la adenina:

Sin embrago, este carcter basico, propio de los anillos purina y pirimidina, se ve disminuido por la presencia de algunos sustituyentes. En concreto, el gurpo OH de los enoles (y lactimas) es ligeramente acido y puede disociarse:

Como consecuencia, las bases nitrogenadas que poseen gurpos lactama (ceto) pueden actuar como acidos, a trabes de sus tautomeros lactima (enol), con lo cual se ve reducido el carcter basico propio de los anillos, en mayor medida cuanto mayor sea el numero de grupos OH. Vease los templos siguientes: a) A es la unica base que no tiene grupo ceto/enol y, por tanto, no muestra ningun carcter acido y es mas basica de todas. b) En Cy G, el unico grupo OH aporta un carcter acido muy debil, por lo que siguen comportandode como bases:

c) en T y U, la presencia de dos grupos OH compensa en mayor grado el carcter basico:

d) como ejemplo extremo, el acido rico (base nitrogenada con tres grupos OH) ya muestra un marcado carcter acido (aunque no es un acido fuerte):

Esta disociacin, como acidos, de los grupos enol compensa en parte el desequilibrio tautomerico anteriormente cosiderado, aumentado la presencia de la formas lactima (enol). No ocurre un efecto similar con las formas amina, por lo que en la practica es comn en las bases nitrogenadas solo se describa la tautomera lactama-lactima, de mayor trascendencia biolgica. ABSORCION DE LA LUZ EN EL ULTRAVIOLETA Es una propiedad caracterstica de las bases purinica y pirimidinicas, debida a su carcter aromatico. En los espectros de absorcin, a pH=7, se observa una fuerte absorcin de la luz en el ultravioleta (UV), con un mximo cerca de 260 mm para todas ellas.

El mantenimiento de esta propiedad en nucleosidos, nucletidos y acidos nucleicos, de los que las bases forman parte, permite su utilizacin analtica en estos compuestos; por ejemplo, para la cuantificacin de acidos nucleicos NUCLEOSIDO Y NUCLEOTIDO ESTRUCTURA DE NUCLEOSIDOS Corresponde al esquema general: nucleosido=base nutrogenada +azcar, tambin pueden considerarse como el producto de la hidrolisis de los nucletidos, con liberacin de fosfato inorgnico. Equivale, por tanto, a un nucletido carente de fosfatos.

CARACTERISTICAS GENERALES La unin covalente (enlace N-glicosidico) entre la base y el azcar (ribosa o desoxirribosa) se establece entre el C-1 (carbono anomerico) del azcar y el N-1 del anillo pirimidinico o el N-9 del anillo purinico, con perdida de una molecula de agua.

TIPOS DE NUCELOSIDOS Debe distiguirse entre nucleosidos constituyentes de acidos nucleicos y otros nucleosidos de internes biolgico y clnico. Su descripcin siempre se hace en funcin de la naturaleza qumica de la base y del azcar. NUCLEOSIDOS QUE FORMAN PARTE DE ACIDOS NUCLEICOS

La distincin entre ribonucleosidos y desoxirribonucleosidos estriba, obviamente, en la presencia de ribosa o desoxirribosa en la molecula.