Mikrobiyoloji 3.

hafta
www.biyoloji.in l Senin Biyolojin Anlatm : Aras Tucu

Bakteria domaininin molekler dzeyde incelenmesi

Bacteria domaini iinde farkl dallara ayrlm gruplar vardr.Bunlar karmaktan ilkele doru u ekilde sralanr. Proteobacteriler , Gram pozitif bakteriler , Siyanobakteriler , Planctomyces , yeil kkrtl bakteri , Deinococcus , yeil kkrtsz bakteriler , thermotoga ve aquifex ve ev-OP2 imdi srayla btn bakteri gruplarnn genel zelliklerine bakalm. Proteobacteria ; Gram Negatif boya ile boyanrlar. Dierlerine gre daha sonradan ve gelimi bir gruptur.(Yaam aacnn sonunda bulunduu iin). Bacteria domaininde en fazla eit ve tr ierir.E.coli(kimi zaman patojen) bu grubun iinde yer alr. Azotobacter (Serbest Azotu yakalarlar.) yine bu grubun iindedir. Bu gruptaki eitliliin nedeni ise Kemonitotrof , kemoorganotrof ve Fototrof organizmalarn bu grupta bulunmasdr.

Bakteria domaininin molekler dzeyde incelenmesi

Bu gruptaki fototroflar Kkrt depo edip slfata evirip kullanarak fizyolojik adan eitlilii salar.Patojen bir bakteri Rickettsia(ate dikeni) ve Neisseria gonorrhoeae(bel soukluu neden olur) grubun en bilinen yeleridir. Gram pozitif bacteria ; Gram pozitif boya ile boyanr.Gram pozitif bakteriler bir araya toplannca koloni olutururlar.Bunlarn ayr bir grupta olmasnn nedeni molekler analizi yapldnda filogenetik olarak birbirine benzemesidir. 2 ye ayrlarak incelenir guanin sitozin oran yksek ve dk olarak. Bu grupta en nemli bakteri basillustur.rnek olarak Bacillus subtilis ( zararsz) bir organizmadr fakat Basillus antrakis (zararl) ve arbon etkenidir.bacillus tumnianis bitki mcadelesinde kullanlr.Bacillus bilindii gibi endospor oluturur.(Dipnotuk:Endospor, bir bakterinin uygun olmayan koullar altnda sitoplazma yzeyini minimuma indirerek metabolizmasn en dk halde altrmasyla ortamn d etkilerinden korunmas amal olarak ald haldir.)

Bakteria domaininin molekler dzeyde incelenmesi

Yine Clostridium bu grupta endospor oluturur. Clostridium perfringens gda zehirlenmelerine neden olur. Clostridium tetani (tetanoz) yapar. Laktik Asit bakterileri (endosporu yoktur) yourt , peynir yapmndaki bakteriler bu gruptadr. Listeria lmcl gda zehirlenmelerine sebep olmaktadr.Btn gram pozitif h.duvar ierir fakat 1 tanesi haritir. Mycoplasma pneumoniae(zatrre) hastalna neden olur ve hcre duvar iermez.Peki biz bu mycoplasmay neden gram pozitif bakterileri arasna koyuyoruz? Molekler analiz yntemiyle Gram pozitif ile akraba olduu iin. Dipnotuk : Bacillus hcrenin iinde parlak grnen endosporlardr. Yuvarlak Bakteri ise streptococcus trnde mevcuttur.Bu bakteriler kan paralayp etrafnda zon oluturur.

Bakteria domaininin molekler dzeyde incelenmesi

Siyanobakteriler ; Kok , Filament eklinde olurlar. Oksijenik katotroflardr.Fototrofiktir Etrafa Oksijen verirler.Dnya zerinde Olmasa canllk olmazd.Anerobik olan organizmalar prokaryotlarda yer alr.Siyanobakteriler evrimlemese eitlilik ortaya kmazd. Planctomyces(uzantl bakteriler) ; Uzantlar vardr.Birbirine tutunup Rozet eklini oluturur.Spiroketler bu grupta ok nemlidir bunlarnda nemli 2 zellii vardr 1.si spiraldirler ve ortada bir eksenleri vardr. 2.si ise frenge etkeni olan hastalk treponema palliduma neden olur. Yeil Kkrtl Bakteri ; Fototrofik bakterilerdir kullanrlar. Deinococcus ; Deinococcus radiodurans, ekstremofilik bir bakteri olup radyasyona kar bilinen en dayankl canllardan biridir. Bu canl insann dayanabilecei radyasyondan fazla rasyasyona dayanabilir.Kromozomunu hzl bir ekilde onarabilir.

Bakteria domaininin molekler dzeyde incelenmesi

Yeil Kkrtsz Bakteri ; Fototrofik ve termofilik ortamlarda yaarlar. Thermotoga ve Aquifex ; lk ortaya kan bakteri gruplardr.Yeryznn ilk dnya oluumunda ok scak olduunu dorular.(Yaam aacnn kknde yer ald iin.)kiside termofilik bakteridir yani sca severler.Ayrca Hipertermofildirler.Aquifex grubunda filegella(kam) bulunur. ev-OP2 ; Bu gruptaki Bakteriler elinde olmasa dahi rnein topraktan bakterinin Dnas zole edilir.Kltr olmasada Dna analizleri ile byle bir grup ald.

Archaea
Bunlarla lgili Dipnotuklar verelim ; Natrono ( alkali Yksek ph severler) , Methanosarcina (metan reten ) , Pyrococcus ( Ate topu PyrexIsya dayankllar) nemli Dipnotuk : Thermoplazma Hem termofiliktir hem hcre duvar yoktur hemde asidofildir. ou archaea grubu ekstrem derecede yaar. Metanojen ( metan retmek ) sadece Archaea grubuna zgdr.(Metanozis denir bu metan retme reaksiyonuna)Methanosarcina buna rnektir. Halofil ( 25 derecede yaar ) yani bazlarda ekstrem deildir. Archaea 2 grup altnda incelenir. 1)Euryarchaeota, Archaea st alemine ait bir ube. Bu grup metanogenleri, halo bakterileri, baz ekstrem termofilik aeroblar ve ekstrem termofilik anaeroblar iermektedir.ve ayrca tuz ve alkali ortam sevenler bu gruptadr. Crenarchaeota ; bu gruptakiler ise Hipertermofilik Olanlardr.

karyotik Mikroorganizmalar
Bu grupta yaam aacnda uca doru geni dallanmalar grlr dallanma yapan canllar gelimi olan canllardr. karyotik mikroorganizmalara en gzel rnek Maya ve Kftr.(Dipnotuk : Maya+kf=Fungus oluturur.) Maya tek hcrelidir. Protist olarak karyotik organizmalarda protozoolar , entomoeba , paramecium bulunur. Diplomonat ve Trikomonatta Mitokondri yoktur.(Bir Zamanlar vard fakat parazitik yaama geince kayboldu.)ve bunlar barsakta yaarlar. LiKENLER..! Alg+Mantar veya Siyanobakteriler + Mantarn bir araya gelmesiyle oluur.Alg ve siyanobakterilerin ortak grevi Primer reticidir ve Fungus iin gerekli olan karbonu retir.

Mikroskobi Hakknda Genel Bilgiler

Bakterileri incelemek iin k mikroskobundan faydalanyoruz.Tabi baz bakterileri grmek iin boyamakta lazm ama bakterinin pigmenti varsa boyamayada gerek yoktur. rnein bir k mikroskobunda en byk mercek 100x ise 10x de oklerin bykl olursa biz bakterileri k mikroskobunda 1000 kat bytm oluruz. Bu oran elektron mikroskobunda ise 100.000 kat bulur. Tabi bakterileri incelerken znrlkte nemlidir.ncelediimiz preparatta bakteriler 0.2mm den yaknsa biz bunlar gremeyiz. Grlemeyen bakteriler boyama yapmadan faz kontrast ve karanlk saha mikroskoplarnda grlebilir nk Mercek sistemleri farkldr. Elektron mikroskobu 2 ekildedir.Tem ve Sem 3 boyutlu grntlemek iin SEM yani d ortam eer Bakteriden kesit alnp grntlenmek istenirse TEM kullanlr.

Prokaryotik Hcre Yaplar

Prokaryot canllarn ok kk olmas avantajdr.Bunun nedeni ise Yzey hacim orandr ; bir canl ne kadar bykse metabolizmas o kadar hzldr.Bakteriler ok hzl geliebilir 2 ye blnr ve oalr. Kk bakteriler bir araya gelerek populasyon oluturup mutasyona urar ve evreye adaptasyon salar. Evrimlemesi iin Frsat salar ve Hcrenin ierisinde parazit yaayabilir. ok nemli Dipnotuk..! Bakteri hcresi olarak boyu en uzun Epulopiscium fishelsoni dir. Baln vcudunda Simbiyotik olarak yaarlar 0.6mm boyundadr.Hcrenin hacmi asndan en byk bakteri ise Thiomargarita namibiensis 0.75 mm dir. E.coli ise 1x2 mikrometre kadardr.En kk bakteri ise hcre duvarna sahip olmayan Mycoplasma pneumoniaedir.0.002 mm dir. ubuk , Kok ekilli Bakteriler En ok Rastlanlan Bakterilerdir.

 Bu ders slayt www.biyoloji.in sitesi tarafndan yaplmtr. Facebook Sayfamz www.facebook.com/seninbiyolojin Her trl soru ve nerileriniz iin seninbiyolojin@gmail.com adresine mail atabilirsiniz. Dersleri video olarak www.biyoloji.in adresinden izleyebilirsiniz. Bize destei iin www.biyolojigunlugu.com Sitesine ve Sahibi Cenk nsoya Teekkrlerimizi Sunarz.