Professional Documents
Culture Documents
Amino Asitlerin Biyosentetik Kaderleri 1. Protein Sentezi 2. Nkleik Asit Sentezi 3. Hem Sentezi 4. Tiroid Hormon Sentezi 5. Nrotransmitter Sentezi 6. Spermin ve spermidin 7. Kreatin ve Fosfokreatin
Azot Fiksasyonu
Azot dnyada en yaygn olarak N2 gaz formunda bulunur (havann 80%i) N2 ok kararl ve inert bir gazdr. 2 N l ba ile balanr (bu ban krlmas iin 225 kcal/mollk bir enerjiye ihtiya vardr). N2 gaz 3 yol ile biyolojik olarak kullanma uygun hale dnr: N2; UV k ile NO3- a evrilebilir.(fikse edilmi azotun 15%i) N2 endstriyel prosesler ile NH3a indirgenebilir. (total fikse edilmi azotun 25%i, 500oC ve 300 atm) N2 azot fikse eden bakteriler ile NH3a indirgenebilir (fikse edilmi azotun 60%).
1) 2) 3)
Azot evrimi(Dngs)
Amonyak Asimilasyonu-1
Glutamat dehidrogenaz - -ketogluturatn glutamata redktif aminasyonu.
NH2
Amonyak Asimilasyonu-2
Glutamin Sentetaz Glutamatn gamma karboksil grubunun ATP baml amidasyonu ile glutamine dnm.
Bir ok amino asitin sentezi, degredasyonlarnn basit dnmleridir. Transaminasyon Reaksiyonu Degradasyon ile amino asit iskeletleri ana metabolik ara rnlere dnrler. Benzer ekilde, amino asitler ana metabolik ara rnlerden sentezlenebilirler.
Bir ok Mikroorganizma ve bitkiler 20 AAin tamamn sentezleyebilirken, insanlar sadece 11 AAi sentezleyebilir. Esansiyal Amino Asitler diyetle alnmal
Aspartat ailesi
Aspartat Asparagin Metiyonin Threonin Izolsin Lizin*
Pruvat ailesi
Alanin Valin Lsin
3-fosfogliserat ailesi
Serin Glisin Sistein
4 Adm
+
N H H
CO2 -
Prolin
NH3 +
-
5 Adm
+ H3 NCH 2 CH 2 CH 2 CHCO 2 - Ornitin NH3 +
O 2 CCH 2 CH 2 CHCO 2 -
Glutamat
Glutamin sentaz
re evrimi
+ H2 N=C-HNCH 2 CH 2 CH 2 CHCO 2 NH2 NH3 +
NH3 +
Arginin
H2 NCCH 2 CH 2 CHCO 2 -
Guanidino grubu
Glutamin
O H3C C COO-
O C O CH2
O C COO-
O C O CH2 CH2
O C COO-
Aminotransferase
Aminotransferase
Aminotransferase
O C O CH2
H C COO-
O C O CH2 CH2
H C COO-
NH3+
NH3+
NH3+
Alanine
ATP ADP
H C COO-
O C H2N CH2
O C COOOPO3-
NH3+
NH3+
Asparagine
H C COO-
NH3+
Glutamine
O C O CH2 CH2
H C COO-
NH3+
ATP ADP
H
Sentezi
CH2
CH2
COO-
PO3
NH3+
Glutamate -ketoglutarate
H NH3+ CH2 CH2 CH2 C COO-
NH3+
Glutamate-5-semialdehyde Ornithine--aminotransferase
Ornithine
NH3+
NAD(P)H
COO-
NAD(P)+
H
H2C C
CH2 C N H COO-
H C COO-
'-Pyrroline-5-carboxylate
Pyrroline-5carboxylate reductase
Arginine
NH3+
Proline
Aktivasyon
4 Adm
Karbomoil fosfat
NH4 + HCO3
CPS-I
NH2CO2PO3-2
NH3+
NH3 +
Ureido grubu
Sitrulin
serin+ homosistein
sistatiyonin
sistein + -ketobutirat
Homosistein
+
Sistatiyonin
Serin
Serin Sentezi
CO 2 -
CO 2 3-fosfogliserat DH
Glukoz
Glikoliz
H C OH
C=O
NAD+ NADH + H+
CH2 OPO3-2
CH2 OPO3-2
3-Fosfohidroksipruvat
3 Adm
3-fosfogliserat
Pruvat
(-) Inhibisyon
CO 2 H C NH3 +
Fosfoserin fosfataz
Serin (Ser)
CH2 OH
Folat
Dihidrofolat redktaz
CO 2 H C NH3 + CH2 OH
Serin
Tetrahidrofolat (FH4)
H N
N H2C
H C NH3 +
Glisin
8 Reaksiyon Adm
Lizin
-aspartat semialdehid
-aspartat semialdehid
Homoserin Dehidrogenaz
Homoserin
3 Adm
2 Adm
Homosistein
Treonin
Metiyonin Sentaz
Metiyonin
NH3+
HSCH 2CH 2CHCO 2 + 5-Methyl
L-Homosistein
CO 2 -
FH4
Homosistinri Nadir; sistatiyonin -sentaz eksiklii Mental gerilik, Osteoporz, Kardiovaskular hastalklar ve lm
Sistatiyonin -sentaz
(PLP-baml)
OH
NH3 +
-
CH 3CHCH 2CO 2
HSCH 2CHCO 2
-Hidroksibutirat
Sistein
(Esansiyal olmayan)
Sistatiyonin
CH3
COO-
CH3
COO-
H3C
CH2
C O
COO-
Pyruvate Pruvat
Pruvat
Pyruvate
-Ketobutyrate -ketoglutarat
TPP +
O CH3 C OH COOOH
CO2
CH3 CH2
CH3
CH3
TPP
H3C
C O
C OH
COO-
Hydroxyethyl-TPP
-Acetolactate -asetoasetat
CH3
C
H
-ketoizovalerat
Glutamate valine aminotransferase Valin aminotransferaz
-Ketoisovalerate
-ketoizokaproat
CH3 H CH2 C NH3 COO-
-keto--metilvalerat methylvalerate
Glutamate Valin aminotransferaz valine aminotransferase -Ketoglutarate
-Keto-
glutamat
CH3
C
H
glutamat
-ketoglutarat
-Ketoglutarate
-Ketoisocaproate glutamat
-ketoglutarat
CH3 H
CH3 COO-
CH3
C
H
C NH3
CH3
C
H
CH2
C NH3
COO-
H3C
C H
Valine Valin
Leucine Lsin
Isoleucine zolsin
2-keto-3-deoksi-D-arabinoheptulosonat-7-fosfat (C7 bileii) halka kapanmas ile korizmat oluur. (R gruplarnn benzen halkas prekrsr) Triptofan sentezinin son iki adm triptofan sentaz enziminin ve altbirimleri ile katalizlenir. (iki farkl aktif merkez)
Phosphoenolpyruvate (PEP)
O
C CH2
PO3COO-
O C
COO-
Pi
H
CH2 C C C OH OH OH
-2
+
O C H
Erythrose-4- H phosphate
C C
OH OH
-2
2-Keto-3deoxyarabinoheptulosonate -7-phosphate
CH2OPO3
CH2OPO3
6 reactions
COOCH2 O H H C COO-OOC O
CH2 C COO-
Anthranilate
Chorismate mutase
HO
Chorismate 2 reactions
Prephenate
2 reactions
H
3 reactions
CH2
COO-
CH2
COO-
NH3+
NH3+
Tyrosine
OH
Phenylalanine
Glyceraldehyde 3-phosphate
OH C N H CH C H OH C H CH2 OPO3
-2
Serine
H2 O
H CH2 C COO-
NH3+
N Tryptophan H synthase
N H
Indole-3-glycerol phosphate
Tryptophan
Histidin Sentezi
Histidin; 5-fosforibozil--pirofosfat(PRPP) tan trevlendirilir. PRPP; Prin ve primidin nkleotidlerinin sentezinde yer alan fosfo eker ara rndr. Histidinin bir prinden sentezi RNA DNYASI??? - Yaamn RNA-tabanl olabilecei hipotezi?
- RNA katalitik zelliklere sahip - histidin bir ok enzimin aktif merkezinde bulunur katalitik reaksiyonlara katlr nkleofil ve genel asit baz katalizi
RIBOSE
H2N N C
ATP
N N RIBOSE P P P
PPi
O3P
H2N O3P
N N C
CH2
CH2
H OH OH
ATP Phosphoribosyltransferase
H OH OH
5-Phosphoribosyl-pyrophosphate (PRPP)
ATP 3 reactions
N O
RIBOSE
To purine biosynthesis
O H2N C
+
H N
NH2
H2N
C HN C H O
HC C CH2 H C
H N CH N
HC C
H CH
C C
N OH OH
Glutamine Glutamate
H
4 reactions
NH3+
H H
C C
C C
OH OH
COO-
CH3OPO3
Glutamine amidotransferase
CH3OPO3
Histidine
5-Phosphoribosyl5-aminoimidazole-4carboxamide ribonucleotide
Nitrik Oksit
Hcre Mesajcs Bir ok fizyolojik ve patofizyolojik olayda etkin Vazodilasyon: guanilil siklaz aktive eder cGMP Nitrogliserin Gliserin + NO Sildenafil (Viagra): vaskular dz kas NO cGMP GMP
Arginin
NO
Sitrulin
Poliamin Biyosentezi
+ H3 NCH 2 CH 2 CH 2 CHCO 2 Ornitin (re evrimi)
NH3
+ H3 N
+ NH3
Putresin
Dekarboksillenmi SAM Spermidin sentaz
CO2
H + H3N H + N H + N H
5-Metiltiyoadenozin
+ NH3
Spermin
Spermin sentaz
+ H3 N
5-Metiltiyoadenozin
H +N H + NH3
Dekarboksillenmi SAM
Spermidin
Kreatin ve Kreatinin
Kreatinin Kreatin Uriner atlm genelde Diyet destei sabit; Kas ktlesi ile Atletik performansn arttrlmas. orantl
Arginin-glisin NH3 transamidinaz + (Bbrek) H2 N=C-HNCH 2 CH 2 CH 2 CHCO 2 -
NH2
Arginin
H N
Glisin
Ornitin
+ H2 N=C-HNCH 2 CO 2 Guanidoasetat
Guanidoasetat Metiltransferaz (Karacier)
SAM + ATP S-Adenozil homosistein + ADP
NH2
Kreatinin (drar)
HN N CH3
+ H2 N=C-NCH 2 CO 2 ADP + Pi
NHPO3-2 CH3
NH2
ATP
Fosfokreatin
Dekarboksilasyon
Kk Molekl Nrotransmitterler
asetil CoA + kolinasetilkolin
Tirozin
Tirozin
Glutamat CO2
Tirozin
Triptofan
Histidin
GABA Sentezi
GABA; beyindeki nemli bir nrotransmitterdir
Dekarboksilasyon
Katakolamin Biyosentezi
Tirozin Metabolizmasnn Minor Metabolik Yolu
Tirozinin ou protein yapsna katlmad zaman fumarat ve asetoasetata dnr. Bir ksm da Katekolamin prekrsr olarak kullanlr. Bu nemli fizyolojik ajanlar tirozinin hidroksilasyonu ile balayan bir seri reaksiyonu kapsar. Hidroksilasyon rn:
3,4 dihidroksifenilalanin (DOPA)
DOPA Sentezi
DOPAnn DOPA Dekarboksilaz (PLP-baml) ile dekarboksilasyonu sonucu dopamin oluur. Dopamin oluumu beyinde gerekleir ve nrotransmitter olarak fonksiyon gsterir. Dopamin retiminin beyin hcrelerinde azalmas Parkinson hastal ile balantldr, ancak hastaln birincil sebebi bilinmemektedir.
L-DOPA: Parkinsonizm
Kan L-DOPA
CH3 HO CH2 -C-CO2 H NHNH2
HO
Karbidopa
Dopamin
Kan-Beyin Bariyeri
Adrenal medullada da dopamin tirozinden sentezlenir ve kromatin granllerinde lokalize olan bir enzim ile hidroksilasyon sonucu Norepinefrin oluur. Norepinefrinin bir ksm kana salglanmas iin uyar gelincee dein salg granllerinde depolanr. Norepinefrinin byk ksm ise feniletanolamin-N-metil transferaz ile metillenerek epinefrin(adrenalin) oluur. Epinefrin de kromatin granllerde depolanr.
Melanin Sentezi
Tirozin Metabolizmas
Tirozinin tirozinaz ile oksidasyonu sonucu melanin oluur. Melanin granlleri znr deildir ve koyu renklidir. Melanin; deride, retinada ve beyinin baz ksmlarnda bulunan melanosit ad verilen zel hcrelede konsantre olurlar. Deride gne na kar koruma. Melaninin oluamamas Albinizme neden olur. Tirozinazn genetik eksiklii
Melanin Sentezi
HO NH3 + CH2 CHCO2 HO
Tirozin hidroksilaz O2
HO
Tirozin
DOPA Tirozinaz
Dopakinon
Serotonin Sentezi
Triptofan Metabolizmas
Serotonin:
Beyinde (nrotransmitter; uykunun dzenlenmesi, ruh hali, istek, itah) Plateletlerde (platelet agregasyonu, damar daralmas) Dz kasta (kaslma) Gastrointestinal blge (enterokromafin hcreler - major depo blgesi)
Serotonin:
Depresyon Serotonin-seimli geri kazanm inhibitorleri (SSRI) Migren izofreni Obsesif Kompulsif Bozukluk
Indole ring
5-Hydroxytryptamine (5-HT);
MAO
Serotonin
Dehidrogenaz
CH2 CO2H HO
N H
2 Adm
Serotonin
Melatonin
Melatonin: Sentezi bir ok faktrn yansra k ile kontrol edilir. Deri renginin almasn indkler. Ovarian fonksiyonu basklar. Uyku bozukluklarnda kullanlabilir.
CO2 H
N H
Triptofan
HEM BYOSENTEZ
HEM YAPISI
Fe2+ Protoporfirin IX: meten kprleri ile birbirine bal 4 pirol halkas
Demirin Deerlendirilmesi(kullanm)
Hem Biyosentezi
Sksinil CoA
Glisin
Hem
Hem Biyosentezi
Sksinil-CoA
Pridoksal fosfat
Glisin
Mitokondri
-Aminolevnilik asit(ALA)
Sitoplazma
Dehidrataz 2H2O
4 Porfobilinojen
Porfobilinojen deaminaz (PLP) roporfirinojen I sentaz
roporfirinojen III
4 CO2
Hem Ferroelataz
Koproporfirinojen III
Dekarboksilaz
Fe+2
Dehidrogenaz
Protoporfirinojen IX
Protoporfirin IX
Hem Biyosentezi
Sitrat evrimi
Hem Sentezi
Hem Degredasyonu
RBC
mr:120 gn
Retikuloentotelyal Sistem (Dalak)
Hem + Globin
Bilirubin